264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_13351 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_13351  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  100 
 
 
289 aa  603  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13561  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  87.27 
 
 
268 aa  501  1e-141  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.338754  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1265  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  88.43 
 
 
270 aa  499  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13651  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  87.27 
 
 
268 aa  498  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.229398  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0812  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  75 
 
 
296 aa  481  1e-135  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.211227  hitchhiker  0.00219501 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1561  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  74.91 
 
 
290 aa  474  1e-133  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.442148  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0778  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  75.87 
 
 
290 aa  470  1e-132  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16221  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  76.22 
 
 
290 aa  472  1e-132  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0239928  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20541  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  71.18 
 
 
318 aa  458  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.143369 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12601  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  72.92 
 
 
293 aa  460  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.879707  hitchhiker  0.00432496 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2690  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  69.93 
 
 
290 aa  442  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.641434 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2457  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  68.51 
 
 
292 aa  443  1e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000472181  hitchhiker  0.000000000290022 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3426  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  69.93 
 
 
290 aa  442  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4336  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  67.01 
 
 
294 aa  433  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3659  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  69.01 
 
 
298 aa  433  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3866  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.78 
 
 
294 aa  433  1e-120  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.086859  normal  0.138028 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4255  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.44 
 
 
296 aa  428  1e-119  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00424245  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0922  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.97 
 
 
292 aa  430  1e-119  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.0000402813  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2056  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.9 
 
 
296 aa  424  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2473  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.01 
 
 
295 aa  413  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000559349  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3048  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.98 
 
 
296 aa  412  1e-114  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0314071  normal  0.0184819 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0484  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.15 
 
 
295 aa  404  1.0000000000000001e-112  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.411276  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0603  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.11 
 
 
319 aa  398  9.999999999999999e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1516  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.11 
 
 
303 aa  399  9.999999999999999e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.603304  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0578  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.42 
 
 
292 aa  385  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1023  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.07 
 
 
291 aa  384  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.165229  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0290  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.9 
 
 
291 aa  387  1e-106  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.213376 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2942  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.42 
 
 
291 aa  385  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000870309  hitchhiker  0.000753437 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0915  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.52 
 
 
292 aa  384  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1062  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  59.17 
 
 
301 aa  384  1e-106  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1265  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.21 
 
 
289 aa  385  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.127189  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0641  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.07 
 
 
291 aa  381  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.963303  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2034  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.07 
 
 
294 aa  383  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000016391  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12450  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.32 
 
 
282 aa  383  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3673  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.42 
 
 
291 aa  384  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000113382  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1320  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.28 
 
 
299 aa  382  1e-105  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.797629  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3060  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.38 
 
 
292 aa  383  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1687  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  57.79 
 
 
290 aa  378  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0323438 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0655  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.72 
 
 
292 aa  380  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79988e-24 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0598  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  58.68 
 
 
290 aa  378  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.4959400000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1207  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.21 
 
 
294 aa  379  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0202592  normal  0.156512 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1588  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.06 
 
 
282 aa  379  1e-104  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1440  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  56.99 
 
 
321 aa  374  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.198845 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1092  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  59.52 
 
 
293 aa  373  1e-102  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0268  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  57.14 
 
 
304 aa  371  1e-102  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.43665  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0354  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  58.08 
 
 
308 aa  371  1e-102  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1052  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  58.48 
 
 
297 aa  373  1e-102  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2446  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  57.79 
 
 
290 aa  372  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1734  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  57.79 
 
 
291 aa  372  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.424728  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1220  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  57.93 
 
 
304 aa  369  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0870  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  58.08 
 
 
308 aa  369  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3936  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  58.13 
 
 
289 aa  369  1e-101  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.429438  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0539  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  56.45 
 
 
305 aa  370  1e-101  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0639733  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0992  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  57.79 
 
 
289 aa  368  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2460  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  57.49 
 
 
326 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.581203  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3534  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  56.45 
 
 
327 aa  365  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0200192 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0788  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  57.64 
 
 
290 aa  367  1e-100  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0493212  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3696  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  56.99 
 
 
325 aa  367  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0334  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  57.44 
 
 
293 aa  366  1e-100  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3381  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  55.71 
 
 
318 aa  365  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.899304 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0012  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  57.73 
 
 
317 aa  367  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.569318 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3256  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  57.39 
 
 
306 aa  363  1e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1196  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  57.29 
 
 
317 aa  363  1e-99  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0503079  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1288  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  55.71 
 
 
312 aa  363  1e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.652722 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2049  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  57.79 
 
 
309 aa  363  2e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0372  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  56.01 
 
 
314 aa  363  2e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2050  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  56.36 
 
 
308 aa  363  2e-99  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.19493  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0010  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  56.9 
 
 
317 aa  363  3e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000663268  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0732  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.06 
 
 
286 aa  362  3e-99  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2348  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  57.39 
 
 
312 aa  362  4e-99  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.900103 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0014  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  56.25 
 
 
315 aa  362  4e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4744  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  56.29 
 
 
301 aa  362  5.0000000000000005e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1305  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  56.1 
 
 
309 aa  361  9e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1711  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  55.4 
 
 
300 aa  360  1e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.271634  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0888  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  55.82 
 
 
307 aa  360  1e-98  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2056  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  55.52 
 
 
350 aa  360  1e-98  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.518988  normal  0.447026 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1012  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  55.82 
 
 
307 aa  360  1e-98  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0761934  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0708  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.06 
 
 
286 aa  359  2e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  56.6 
 
 
315 aa  360  2e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4178  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  55.94 
 
 
314 aa  359  2e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.436375 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0443  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  56.64 
 
 
308 aa  360  2e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0692449  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0208  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  56.36 
 
 
319 aa  359  3e-98  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2555  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  56.45 
 
 
309 aa  359  3e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00956697  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2651  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  56.45 
 
 
309 aa  359  3e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2115  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  56.36 
 
 
319 aa  359  3e-98  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.160845  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00100  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  56.6 
 
 
315 aa  359  3e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1774  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  55.52 
 
 
329 aa  358  4e-98  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0563652  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  57.44 
 
 
318 aa  358  4e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.583173  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0740  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  55.75 
 
 
328 aa  359  4e-98  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.786171  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4203  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  56.29 
 
 
301 aa  358  6e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0543  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  55.1 
 
 
317 aa  358  7e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0527  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  55.1 
 
 
317 aa  358  7e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0240153 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00110  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  56.25 
 
 
318 aa  358  8e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0184  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  55.21 
 
 
315 aa  357  9e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0012  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  55.21 
 
 
335 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0216  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  55.71 
 
 
317 aa  357  9.999999999999999e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0389393 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0645  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  55.25 
 
 
312 aa  356  1.9999999999999998e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0007  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  55.48 
 
 
323 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2954  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  58.36 
 
 
295 aa  355  3.9999999999999996e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2211  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  54.83 
 
 
317 aa  354  7.999999999999999e-97  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>