38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5730 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_5730  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  100 
 
 
349 aa  697    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00130  hypothetical protein  27.41 
 
 
540 aa  69.7  0.00000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.997572  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0400  Phosphodiesterase I  29.34 
 
 
422 aa  67.4  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0422651  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1449  phosphodiesterase I  28.24 
 
 
417 aa  63.2  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.982314  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2169  phosphodiesterase I  27.16 
 
 
433 aa  57  0.0000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1644  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.47 
 
 
519 aa  55.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2080  phosphodiesterase I  26.72 
 
 
433 aa  55.1  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1643  nucleotide diphosphatase  29.46 
 
 
411 aa  54.3  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0839592 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3829  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.1 
 
 
312 aa  53.1  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.750718  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0836  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.78 
 
 
499 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1878  phosphodiesterase I  25.5 
 
 
428 aa  50.4  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.872565 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20320  uncharacterized AP superfamily protein  25.78 
 
 
427 aa  50.1  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.291938  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1841  phosphodiesterase I  22.88 
 
 
400 aa  49.7  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.126105  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0374  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.24 
 
 
437 aa  48.9  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00616587  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1865  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  21.76 
 
 
430 aa  48.5  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0459  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  24.48 
 
 
437 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000352443  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07550  nucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member (Eurofung)  23.41 
 
 
713 aa  48.1  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.934935  decreased coverage  0.0000816404 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4865  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  24.48 
 
 
437 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2032  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.5 
 
 
395 aa  47  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.683986  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0697  hypothetical protein  34.95 
 
 
435 aa  46.6  0.0006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000533536  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1707  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.15 
 
 
307 aa  46.6  0.0006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0947462  hitchhiker  4.53263e-17 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0508  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  24.07 
 
 
437 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.350178  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0438  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  24.07 
 
 
437 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0508  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  24.07 
 
 
437 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03452  putative type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase protein  24.27 
 
 
447 aa  45.8  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1658  nucleotide diphosphatase  25.61 
 
 
413 aa  46.2  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0394  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  24.07 
 
 
437 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143254  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0368  type I phosphodiesterase  24.07 
 
 
437 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000500368  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0371  type I phosphodiesterase  24.07 
 
 
437 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00015541  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0380  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  24.07 
 
 
437 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0361814  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1028  hypothetical protein  25 
 
 
268 aa  44.7  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1181  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.29 
 
 
478 aa  44.7  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0227784  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7345  hypothetical protein  23.53 
 
 
531 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.617386  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4487  hypothetical protein  26.11 
 
 
265 aa  43.9  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.954296  normal  0.620728 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0380  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.39 
 
 
437 aa  44.3  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000974575  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0713  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.74 
 
 
496 aa  43.9  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_70997  phosphodiesterase; putative nucleotide pyrophosphatase precursor  22.89 
 
 
709 aa  43.5  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.42018 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0747  hypothetical protein  26.41 
 
 
274 aa  42.7  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>