280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_5119 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_5119  urease accessory protein UreG  100 
 
 
215 aa  431  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1464  urease accessory protein UreG  95.35 
 
 
215 aa  411  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1302  urease accessory protein UreG  95.35 
 
 
215 aa  411  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1317  urease accessory protein UreG  74.53 
 
 
212 aa  330  1e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3559  urease accessory protein  77.72 
 
 
220 aa  330  1e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.29571  normal  0.0153059 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1082  urease accessory protein UreG  77.72 
 
 
220 aa  330  1e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1136  urease accessory protein UreG  77.72 
 
 
220 aa  330  1e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.755264  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1361  urease accessory protein UreG  73.58 
 
 
212 aa  324  7e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.346026  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2063  urease accessory protein UreG  57.36 
 
 
211 aa  248  4e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000301925  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4413  urease accessory protein UreG  56.93 
 
 
208 aa  245  4e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2717  urease accessory protein  58.38 
 
 
209 aa  244  6e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1813  urease accessory protein UreG  60.8 
 
 
202 aa  241  5e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0246  urease accessory protein UreG  57.49 
 
 
205 aa  236  2e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0748  urease accessory protein UreG  54.68 
 
 
212 aa  235  5.0000000000000005e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4636  urease accessory protein UreG  57.81 
 
 
200 aa  233  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000195315  normal  0.0674257 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2877  urease accessory protein UreG  55.94 
 
 
203 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0395  urease accessory protein UreG  56.31 
 
 
204 aa  232  4.0000000000000004e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2317  urease accessory protein UreG  59.38 
 
 
204 aa  231  6e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.301422  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2360  urease accessory protein UreG  59.38 
 
 
204 aa  231  6e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.553398  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1556  urease accessory protein UreG  51.98 
 
 
206 aa  231  7.000000000000001e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2409  urease accessory protein UreG  56.28 
 
 
220 aa  230  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0983  urease accessory protein UreG  56 
 
 
217 aa  230  1e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.942838  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2768  urease accessory protein UreG  57.64 
 
 
205 aa  229  2e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3107  urease accessory protein UreG  56.65 
 
 
202 aa  229  2e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0684  urease accessory protein UreG  56.85 
 
 
203 aa  229  3e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1684  urease accessory protein UreG  56.1 
 
 
206 aa  229  3e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64670  urease accessory protein UreG  57.07 
 
 
204 aa  229  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00341231  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03470  urease accessory protein UreG  59.16 
 
 
203 aa  228  4e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.546995  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0959  urease accessory protein UreG  53.66 
 
 
213 aa  228  5e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09380  urease accessory protein UreG  56.72 
 
 
204 aa  228  7e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0664  urease accessory protein UreG  58.33 
 
 
204 aa  228  7e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.469815  normal  0.0339996 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0187  urease accessory protein UreG  55.67 
 
 
211 aa  227  1e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2997  urease accessory protein UreG  54.59 
 
 
203 aa  227  1e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.787106 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1424  urease accessory protein UreG  54.95 
 
 
201 aa  226  2e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.62844 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29751  urease accessory protein UreG  55.24 
 
 
203 aa  226  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4032  urease accessory protein UreG  59.9 
 
 
207 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.199977 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5616  urease accessory protein UreG  56.57 
 
 
204 aa  226  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4441  urease accessory protein UreG  55.56 
 
 
214 aa  226  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761562  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1477  urease accessory protein UreG  56.78 
 
 
212 aa  226  3e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0957656  normal  0.435433 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1244  urease accessory protein UreG  54.77 
 
 
213 aa  225  4e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1874  urease accessory protein UreG  56.35 
 
 
204 aa  224  5.0000000000000005e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00892  urease accessory protein UreG  55.61 
 
 
203 aa  224  8e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.870329  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1764  urease accessory protein UreG  54.9 
 
 
203 aa  224  9e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.861416  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2196  urease accessory protein UreG  54.73 
 
 
220 aa  223  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000358866  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0224  urease accessory protein UreG  57.65 
 
 
207 aa  224  1e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1701  urease accessory protein UreG  57.73 
 
 
204 aa  223  1e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000266659 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1089  urease accessory protein UreG  56.7 
 
 
204 aa  223  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1384  urease accessory protein UreG  58.85 
 
 
210 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0380  urease accessory protein UreG  53.27 
 
 
213 aa  223  2e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.235072  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3261  urease accessory protein UreG  58.55 
 
 
221 aa  223  2e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2008  urease accessory protein UreG  59.38 
 
 
206 aa  222  4e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3942  urease accessory protein UreG  57.29 
 
 
225 aa  221  4.9999999999999996e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.452121  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4708  urease accessory protein UreG  59.38 
 
 
209 aa  221  6e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4832  urease accessory protein UreG  55.88 
 
 
212 aa  221  7e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0787  urease accessory protein UreG  55 
 
 
215 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.876633  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1364  urease accessory protein UreG  58.33 
 
 
210 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3659  urease accessory protein UreG  56.35 
 
 
205 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.319946  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4003  urease accessory protein UreG  54.5 
 
 
215 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2621  urease accessory protein UreG  54.82 
 
 
201 aa  219  1.9999999999999999e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.131688  normal  0.804945 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0776  urease accessory protein UreG  54.5 
 
 
215 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2117  urease accessory protein UreG  56.19 
 
 
204 aa  219  3e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0287673 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2251  urease accessory protein UreG  55.56 
 
 
201 aa  219  3e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1493  urease accessory protein UreG  54.5 
 
 
216 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.286659  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1190  urease accessory protein UreG  53.03 
 
 
206 aa  218  6e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.257386  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2867  urease accessory protein UreG  55.21 
 
 
205 aa  217  8.999999999999998e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.378326  normal  0.197237 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3115  urease accessory protein UreG  54 
 
 
216 aa  217  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.619764  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2187  urease accessory protein UreG  54 
 
 
216 aa  217  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2060  urease accessory protein UreG  54 
 
 
216 aa  217  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3079  urease accessory protein UreG  54 
 
 
216 aa  217  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3013  urease accessory protein UreG  54.64 
 
 
204 aa  217  1e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.311602  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2554  urease accessory protein UreG  54 
 
 
216 aa  217  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.7567  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3238  urease accessory protein UreG  54.64 
 
 
204 aa  217  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.522124 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0720  urease accessory protein UreG  54 
 
 
216 aa  217  1e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3138  urease accessory protein UreG  54 
 
 
216 aa  216  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0561  urease accessory protein UreG  56.06 
 
 
204 aa  216  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.562305  normal  0.940607 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2493  urease accessory protein UreG  53.5 
 
 
215 aa  216  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0867  urease accessory protein UreG  53.5 
 
 
215 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0418  urease accessory protein UreG  53.5 
 
 
215 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0897  urease accessory protein UreG  53.5 
 
 
215 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.626533  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3202  urease accessory protein UreG  54.64 
 
 
204 aa  216  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0474  urease accessory protein UreG  53.62 
 
 
206 aa  215  4e-55  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4911  urease accessory protein UreG  55.56 
 
 
205 aa  215  5e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2261  urease accessory protein UreG  55.96 
 
 
201 aa  214  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0587702  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4453  urease accessory protein UreG  55.05 
 
 
205 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1963  urease accessory protein UreG  51.74 
 
 
216 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3533  urease accessory protein UreG  52.48 
 
 
229 aa  212  2.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.305562  normal  0.490615 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2377  urease accessory protein UreG  53.37 
 
 
203 aa  211  4.9999999999999996e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.168299 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4248  urease accessory protein UreG  52.6 
 
 
216 aa  211  4.9999999999999996e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.660089  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1049  urease accessory protein UreG  57.37 
 
 
205 aa  211  7e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.113322  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19201  urease accessory protein UreG  53.69 
 
 
205 aa  210  1e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3408  urease accessory protein UreG  54.59 
 
 
229 aa  210  1e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.835805  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2451  urease accessory protein UreG  53.06 
 
 
219 aa  209  3e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.296243  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1358  urease accessory protein UreG  52.26 
 
 
214 aa  209  3e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3302  urease accessory protein UreG  53.12 
 
 
203 aa  208  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.200502 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1137  urease accessory protein UreG  52.26 
 
 
216 aa  209  4e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1198  urease accessory protein UreG  52.26 
 
 
214 aa  208  5e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.195176  normal  0.215478 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3046  urease accessory protein UreG  53.12 
 
 
203 aa  207  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.317226  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6188  urease accessory protein UreG  53.27 
 
 
208 aa  207  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.226032  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0998  urease accessory protein UreG  53.44 
 
 
209 aa  206  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1326  urease accessory protein UreG  54.55 
 
 
205 aa  206  3e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>