21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0653 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0653  hypothetical protein  100 
 
 		 188 aa  356  9.999999999999999e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.344221 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0679  hypothetical protein  80.11 
 
 		 189 aa  258  2e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0690  hypothetical protein  82.26 
 
 		 189 aa  243  9.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.154988  normal  0.145005 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6501  hypothetical protein  42.02 
 
 		 208 aa  104  9e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0018  hypothetical protein  42.86 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0016  hypothetical protein  41.76 
 
 		 273 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.571689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0017  hypothetical protein  41.76 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0015  hypothetical protein  43.37 
 
 		 290 aa  58.2  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0010  hypothetical protein  41.11 
 
 		 293 aa  54.7  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0777049 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0663  hypothetical protein  38.1 
 
 		 305 aa  53.9  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.582224 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3351  hypothetical protein  35.56 
 
 		 349 aa  53.5  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2933  hypothetical protein  45 
 
 		 297 aa  51.6  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0732  hypothetical protein  34.12 
 
 		 161 aa  50.4  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1336  hypothetical protein  40.62 
 
 		 362 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.251495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0940  hypothetical protein  40.68 
 
 		 350 aa  49.7  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1765  hypothetical protein  39.02 
 
 		 323 aa  48.5  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3949  hypothetical protein  39.02 
 
 		 325 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.315669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3710  hypothetical protein  39.66 
 
 		 323 aa  44.7  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.483452 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3584  hypothetical protein  24.49 
 
 		 166 aa  43.9  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3399  hypothetical protein  39.66 
 
 		 347 aa  43.5  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.274598  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0348  hypothetical protein  26.74 
 
 		 180 aa  42  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0447096 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>