43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0858 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0858  hypothetical protein  100 
 
 		 310 aa  593  1e-168  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.69291 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3813  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  73.55 
 
 		 310 aa  397  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.422428  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3994  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  67.1 
 
 		 310 aa  339  2.9999999999999998e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.195622  normal  0.0360257 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0338  hypothetical protein  50.91 
 
 		 327 aa  281  9e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1741  hypothetical protein  51.4 
 
 		 316 aa  275  9e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.665621  normal  0.278657 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4942  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  49.85 
 
 		 316 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0743423  normal  0.111633 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1999  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  49.69 
 
 		 317 aa  266  5e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0057  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  49.54 
 
 		 327 aa  257  1e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2049  hypothetical protein  50.46 
 
 		 316 aa  257  2e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.826532  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2340  putative molybdopterin oxidoreductase, membrane anchor subunit  50.46 
 
 		 316 aa  257  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.58942  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1358  hypothetical protein  50.46 
 
 		 316 aa  257  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1074  hypothetical protein  50.46 
 
 		 316 aa  257  2e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3108  putative molybdopterin oxidoreductase, membrane anchor subunit  50.15 
 
 		 316 aa  256  4e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1447  DMSO reductase chain C  50.15 
 
 		 316 aa  256  4e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3223  putative molybdopterin oxidoreductase, membrane anchor subunit  50.15 
 
 		 316 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.394572  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6212  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  49.22 
 
 		 317 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4522  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  47.98 
 
 		 315 aa  249  5e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.758783  normal  0.769038 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1799  DMSO reductase anchor subunit  40.12 
 
 		 324 aa  193  4e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00050464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0146  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  32.18 
 
 		 349 aa  142  5e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.345045 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0572  DMSO reductase chain C  35.65 
 
 		 312 aa  119  6e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000032468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1441  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  31.72 
 
 		 291 aa  108  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1934  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  33.65 
 
 		 312 aa  102  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1677  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  32.48 
 
 		 315 aa  101  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0495248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1236  DMSO reductase anchor subunit  32.9 
 
 		 295 aa  89.4  8e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.66345  normal  0.0462913 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2644  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  37.89 
 
 		 312 aa  70.5  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.022311  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1739  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  45.65 
 
 		 551 aa  57.4  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3053  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.7 
 
 		 594 aa  53.5  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4688  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  34.72 
 
 		 275 aa  48.9  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000613246  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2961  phenylacetyl-CoA:acceptor oxidoreductase  30.9 
 
 		 293 aa  47.8  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.286998  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0769  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  33.54 
 
 		 295 aa  47.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0549  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  35.87 
 
 		 284 aa  46.6  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0711  molybdopterin-containing oxidoreductase membrane anchor subunit  34.41 
 
 		 255 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.957914 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2335  hypothetical protein  30.07 
 
 		 292 aa  45.4  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4697  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  32.63 
 
 		 277 aa  45.4  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.854228  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4694  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  31.82 
 
 		 277 aa  44.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0771  molybdopterin-containing oxidoreductase membrane anchor subunit  34.41 
 
 		 255 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0129  cyclic nucleotide-binding protein  33.91 
 
 		 272 aa  44.3  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2344  putative anaerobic reductase component  36.78 
 
 		 270 aa  43.9  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.755425  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0725  molybdopterin-containing oxidoreductase membrane anchor subunit  34.41 
 
 		 255 aa  43.5  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.277992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0652  molybdopterin-containing oxidoreductase membrane anchor subunit  34.41 
 
 		 255 aa  43.5  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2240  hypothetical protein  33.33 
 
 		 265 aa  43.5  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0666  molybdopterin-containing oxidoreductase membrane anchor subunit  34.41 
 
 		 255 aa  43.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.909919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00530  DMSO reductase anchor subunit  37.5 
 
 		 350 aa  42.4  0.01  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>