59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0683 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0683  hypothetical protein  100 
 
 
213 aa  424  1e-118  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0423  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  66.85 
 
 
192 aa  255  3e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00495591  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1913  antibiotic biosynthesis monooxygenase  46.02 
 
 
188 aa  151  8e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1337  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41 
 
 
205 aa  150  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.325578  normal  0.304097 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4812  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.05 
 
 
205 aa  148  5e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1925  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.5 
 
 
195 aa  134  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0584531  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0103  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.61 
 
 
192 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0100  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.61 
 
 
192 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2799  hypothetical protein  36.07 
 
 
186 aa  125  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3359  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.33 
 
 
188 aa  124  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0356206 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0219  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.2 
 
 
188 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.54328 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42340  antibiotic biosynthesis monooxigenase  44.94 
 
 
177 aa  120  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5034  hypothetical protein  37.23 
 
 
197 aa  118  4.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.289652 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1965  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.7 
 
 
208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2944  hypothetical protein  31.82 
 
 
197 aa  104  8e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.163618  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3168  hypothetical protein  31.82 
 
 
181 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.235057  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3176  hypothetical protein  31.25 
 
 
197 aa  100  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2918  hypothetical protein  31.25 
 
 
197 aa  100  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2087  hypothetical protein  31.25 
 
 
197 aa  100  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2663  hypothetical protein  34.42 
 
 
223 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.856516  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3162  hypothetical protein  31.25 
 
 
197 aa  99.8  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0731561  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3153  hypothetical protein  30.68 
 
 
197 aa  99  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3293  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.54 
 
 
307 aa  98.2  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52614  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1777  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.51 
 
 
191 aa  93.6  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1290  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.25 
 
 
312 aa  91.7  8e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4106  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.66 
 
 
223 aa  90.5  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0501266 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1067  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.77 
 
 
325 aa  89  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3925  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.05 
 
 
198 aa  88.2  9e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.694666  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4399  hypothetical protein  33.15 
 
 
198 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.330046 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3968  hypothetical protein  33.15 
 
 
198 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1022  hypothetical protein  34.86 
 
 
188 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.830686 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4616  hypothetical protein  35.59 
 
 
186 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2897  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.5 
 
 
202 aa  84  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0893  hypothetical protein  34.25 
 
 
189 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4631  hypothetical protein  34.46 
 
 
186 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.827591  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1703  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.05 
 
 
194 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.749707  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0809  hypothetical protein  33.9 
 
 
186 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.408823  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4492  hypothetical protein  33.9 
 
 
186 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3102  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.97 
 
 
188 aa  81.3  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.270956  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3287  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.09 
 
 
188 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1685  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.51 
 
 
194 aa  79.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4805  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.48 
 
 
318 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2318  hypothetical protein  32.77 
 
 
208 aa  77.4  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2696  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.83 
 
 
329 aa  73.6  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.816764  normal  0.726885 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3481  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.93 
 
 
184 aa  70.5  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.541544 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19650  hypothetical protein  32 
 
 
185 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.104813  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1184  hypothetical protein  33.14 
 
 
190 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49730  predicted protein  28.33 
 
 
282 aa  68.2  0.00000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0505  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.16 
 
 
330 aa  67  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0643  hypothetical protein  28.81 
 
 
318 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.12978 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28650  hypothetical protein  31.21 
 
 
184 aa  62.8  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0579  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.74 
 
 
195 aa  62.8  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.735898  normal  0.0837341 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1740  hypothetical protein  28.49 
 
 
199 aa  58.5  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.947815  normal  0.634845 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1723  hypothetical protein  29.95 
 
 
199 aa  58.2  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.660602  decreased coverage  0.000569336 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4195  hypothetical protein  36.67 
 
 
175 aa  57.8  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115309  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5306  hypothetical protein  37.18 
 
 
102 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.384644 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0461  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.4 
 
 
310 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.53292  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5164  hypothetical protein  35.9 
 
 
102 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23504  normal  0.0982881 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5254  hypothetical protein  36 
 
 
112 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>