88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1624 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1624  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase family  100 
 
 		 524 aa  1061    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.931737  normal  0.205569 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0701  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase  50.1 
 
 		 515 aa  486  1e-136  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.187582  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0935  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase  48.41 
 
 		 509 aa  475  1e-132  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1148  GHMP kinase group 1  37.83 
 
 		 519 aa  348  1e-94  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.820316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0244  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase  41.37 
 
 		 335 aa  272  1e-71  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0674  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase  43.29 
 
 		 325 aa  265  2e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.2271  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1282  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase  43.29 
 
 		 325 aa  265  2e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.232636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1394  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase  43.29 
 
 		 325 aa  265  2e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.813401  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1290  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase  42.07 
 
 		 325 aa  263  6e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0806  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase  46.44 
 
 		 321 aa  261  2e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1563  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase  43.83 
 
 		 319 aa  249  9e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00013135  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1222  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase  41.49 
 
 		 318 aa  226  6e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2861  GHMP family kinase  35.22 
 
 		 347 aa  164  3e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.480231  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1661  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase  33.65 
 
 		 310 aa  160  6e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00577565  normal  0.473342 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6481  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase  34.55 
 
 		 355 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.321836 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1345  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase family  35.99 
 
 		 292 aa  146  7.0000000000000006e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.380612  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2430  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase  32.73 
 
 		 342 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.100364  normal  0.840747 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6001  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase family  33.94 
 
 		 333 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.498595  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2356  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase family  34.56 
 
 		 322 aa  137  4e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.37342  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0527  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase  35.01 
 
 		 325 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.856491 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3535  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase  34.14 
 
 		 322 aa  135  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1779  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase family  32.66 
 
 		 333 aa  133  9e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0409011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5949  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase  33.78 
 
 		 339 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00300733 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3142  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase family protein  28.77 
 
 		 328 aa  127  3e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.336042  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1616  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase  32.06 
 
 		 284 aa  127  4.0000000000000003e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5777  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase  31.95 
 
 		 323 aa  127  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1828  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase  31.74 
 
 		 340 aa  127  6e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2163  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase family  31.74 
 
 		 340 aa  127  6e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0673427  normal  0.202366 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2384  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase family  32.52 
 
 		 339 aa  125  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2350  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase  33.45 
 
 		 327 aa  121  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2423  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase family  30.1 
 
 		 325 aa  120  4.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.165612  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2606  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase  30.69 
 
 		 342 aa  120  7e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.614879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0792  sugar kinase-like protein  32.71 
 
 		 310 aa  113  8.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178094  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3085  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase family  27.6 
 
 		 348 aa  112  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3153  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase  30.19 
 
 		 375 aa  110  8.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0626  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase family  33.44 
 
 		 345 aa  108  3e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0128  hypothetical protein  41.22 
 
 		 170 aa  100  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.521926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0579  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase  32.41 
 
 		 337 aa  98.6  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.195323  normal  0.392757 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1697  hypothetical protein  37.5 
 
 		 171 aa  97.8  4e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2109  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase family  31.27 
 
 		 328 aa  97.8  5e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1348  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase family  29.7 
 
 		 326 aa  95.9  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0110253 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1262  hypothetical protein  37.84 
 
 		 173 aa  95.5  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2038  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase family  33.78 
 
 		 333 aa  94  7e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.172756  normal  0.249661 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1562  hypothetical protein  35.8 
 
 		 171 aa  89.4  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.911918  normal  0.330509 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0349  hypothetical protein  35.62 
 
 		 171 aa  87.8  4e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0595803  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1064  hypothetical protein  35 
 
 		 171 aa  87  8e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.618696  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1054  hypothetical protein  31.21 
 
 		 168 aa  80.1  0.00000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0169173  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3957  hypothetical protein  30.99 
 
 		 178 aa  77.4  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3289  hypothetical protein  37.18 
 
 		 183 aa  77  0.0000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0394214  normal  0.677915 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1826  GHMP kinase  22.76 
 
 		 357 aa  75.1  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.725882 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5298  protein of unknown function DUF98  35.44 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0556574 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0932  GHMP kinase  23.36 
 
 		 355 aa  67.4  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3390  hypothetical protein  26.35 
 
 		 168 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.120768  hitchhiker  0.00000000204141 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0515  hypothetical protein  30.49 
 
 		 209 aa  59.3  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.228468  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0153  4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol kinase  25.75 
 
 		 283 aa  58.5  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0137952  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1082  GHMP kinase  24.06 
 
 		 360 aa  58.5  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.145228  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0041  4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol kinase  24.33 
 
 		 289 aa  56.2  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000358804  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1451  GHMP kinase  23.49 
 
 		 359 aa  55.5  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0518145  normal  0.0558976 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0091  hypothetical protein  28.73 
 
 		 203 aa  54.3  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0375  protein of unknown function DUF564  28.05 
 
 		 201 aa  53.9  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0050  hypothetical protein  29.17 
 
 		 205 aa  52.4  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0788  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase  23.12 
 
 		 359 aa  51.2  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.128792  hitchhiker  0.00000000549796 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35045  predicted protein  26.63 
 
 		 214 aa  51.2  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.132422  normal  0.23655 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1568  protein of unknown function DUF564  27.07 
 
 		 203 aa  51.2  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.232035  hitchhiker  0.00190267 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3700  hypothetical protein  28.4 
 
 		 208 aa  50.8  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1318  protein of unknown function DUF564  27.78 
 
 		 201 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.542836 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0180  4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol kinase  31.25 
 
 		 299 aa  48.9  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.535183  normal  0.685529 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0040  4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol kinase  23.76 
 
 		 289 aa  48.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1289  protein of unknown function DUF564  27.78 
 
 		 201 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0050  4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol kinase  23.76 
 
 		 289 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000499132  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5266  4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol kinase  23.76 
 
 		 289 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.872029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0050  4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol kinase  23.1 
 
 		 289 aa  47.4  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0043  4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol kinase  23.1 
 
 		 289 aa  47.4  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0040  4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol kinase  23.1 
 
 		 292 aa  47.4  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0039  4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol kinase  24.14 
 
 		 290 aa  47.4  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0040  4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol kinase  23.1 
 
 		 292 aa  47.4  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0044  4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol kinase  23.1 
 
 		 292 aa  47.4  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0043  4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol kinase  23.1 
 
 		 289 aa  47.4  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0054  4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol kinase  23.1 
 
 		 289 aa  47.4  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.958936  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1055  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol kinase  23.14 
 
 		 291 aa  46.2  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5432  4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol kinase  37.1 
 
 		 287 aa  46.6  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21360  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol kinase  25.18 
 
 		 287 aa  45.1  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1275  hypothetical protein  27.81 
 
 		 195 aa  44.3  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.140299  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0516  4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol kinase  21.19 
 
 		 282 aa  44.3  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00128664  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0529  4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol kinase  21.19 
 
 		 282 aa  44.3  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0171348  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1256  hypothetical protein  29.01 
 
 		 188 aa  44.3  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000666283 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2186  4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol kinase  41.67 
 
 		 283 aa  44.3  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21461  4-hydroxybenzoate synthetase (chorismate lyase)  27.22 
 
 		 195 aa  43.5  0.01  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.901505 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>