15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3289 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3289  hypothetical protein  100 
 
 		 183 aa  380  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0394214  normal  0.677915 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1624  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase family  37.18 
 
 		 524 aa  77  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.931737  normal  0.205569 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3957  hypothetical protein  28.66 
 
 		 178 aa  68.9  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0935  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase  29.45 
 
 		 509 aa  63.2  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1262  hypothetical protein  30.32 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1148  GHMP kinase group 1  28.03 
 
 		 519 aa  57.8  0.00000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.820316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12963  hypothetical protein  27.33 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0128  hypothetical protein  31.87 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.521926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0349  hypothetical protein  27.78 
 
 		 171 aa  52  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0595803  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0701  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase  28.65 
 
 		 515 aa  52  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.187582  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1697  hypothetical protein  26.47 
 
 		 171 aa  51.6  0.000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1562  hypothetical protein  29.34 
 
 		 171 aa  51.2  0.000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.911918  normal  0.330509 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5298  protein of unknown function DUF98  28 
 
 		 223 aa  50.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0556574 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1054  hypothetical protein  25.62 
 
 		 168 aa  47  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0169173  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1064  hypothetical protein  27.22 
 
 		 171 aa  46.6  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.618696  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>