18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4359 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4359  hypothetical protein  100 
 
 		 333 aa  672    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.651926  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5045  hypothetical protein  62.84 
 
 		 332 aa  418  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.280998  normal  0.420218 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5355  hypothetical protein  63.06 
 
 		 359 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0746954 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4584  hypothetical protein  62.54 
 
 		 332 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.91512 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4293  hypothetical protein  60.61 
 
 		 334 aa  411  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0525491 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3925  hypothetical protein  60.61 
 
 		 334 aa  410  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.117767  normal  0.0555776 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0961  hypothetical protein  27.19 
 
 		 372 aa  74.3  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.605405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0062  putative FemAB family protein  26.55 
 
 		 323 aa  54.7  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.731343 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3417  putative FemAB family protein  28.27 
 
 		 328 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.658974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3053  Methicillin resistance protein  22.22 
 
 		 354 aa  51.2  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000266593 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1247  femAB family protein  26.18 
 
 		 352 aa  50.4  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3683  FemAB family protein  27.75 
 
 		 328 aa  49.3  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.830414  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2417  methicillin resistance protein  20.06 
 
 		 366 aa  48.5  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00836283  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0340  Methicillin resistance protein  25.54 
 
 		 394 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1611  Methicillin resistance protein  21.07 
 
 		 370 aa  46.6  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0083  methicillin resistance protein  23.43 
 
 		 354 aa  45.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1415  methicillin resistance protein  22.75 
 
 		 366 aa  45.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.89632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2408  methicillin resistance protein  22.15 
 
 		 363 aa  42.4  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>