More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3994 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3994  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  100 
 
 		 512 aa  1073    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3630  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  64.55 
 
 		 519 aa  730    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.154092 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0231  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  66.09 
 
 		 519 aa  736    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.819432  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5099  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  65.32 
 
 		 519 aa  732    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2343  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  62.43 
 
 		 519 aa  689    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.303723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3930  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  59.65 
 
 		 512 aa  675    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.39743  normal  0.0737899 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5923  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain, nifK  66.28 
 
 		 519 aa  736    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1815  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  59.45 
 
 		 511 aa  642    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.994927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0475  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  64.04 
 
 		 520 aa  720    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4249  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  58.35 
 
 		 512 aa  643    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4932  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  75.44 
 
 		 510 aa  825    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1787  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  59.45 
 
 		 511 aa  642    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0539  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  70.31 
 
 		 506 aa  779    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5054  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  74.66 
 
 		 513 aa  827    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2366  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  59.84 
 
 		 511 aa  637    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1352  nitrogenase molybdenum-iron protein subunit beta  59.84 
 
 		 511 aa  659    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.475929  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1568  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  71.29 
 
 		 511 aa  788    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.511918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2190  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  70.31 
 
 		 516 aa  780    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0387614  normal  0.12949 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1432  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  62.04 
 
 		 519 aa  689    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.880154 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1607  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  63.2 
 
 		 519 aa  697    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262136  normal  0.703776 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1012  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  67.06 
 
 		 510 aa  740    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.245367  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0971  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  65.32 
 
 		 519 aa  723    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7755  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  61.66 
 
 		 519 aa  688    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1520  nitrogenase molybdenum-iron protein, beta subunit  66.09 
 
 		 519 aa  743    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.268449  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6223  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  75.88 
 
 		 513 aa  838    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0090  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  68.21 
 
 		 519 aa  758    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4461  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  64.93 
 
 		 518 aa  719    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1467  nitrogenase, molybdenum-iron protein beta chain(NifK)  61.66 
 
 		 519 aa  691    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.261912  hitchhiker  0.00055229 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1075  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  65.13 
 
 		 537 aa  724    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.902597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1248  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  70.12 
 
 		 506 aa  773    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.836121 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4138  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  61.09 
 
 		 512 aa  655    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.453924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3536  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  90.82 
 
 		 512 aa  986    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1238  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  66.09 
 
 		 519 aa  743    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.028424 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2118  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  57.89 
 
 		 511 aa  638    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0200867 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1413  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  53.07 
 
 		 522 aa  582  1.0000000000000001e-165  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.079976 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01400  Nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  52.29 
 
 		 523 aa  576  1.0000000000000001e-163  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6879  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  53.91 
 
 		 518 aa  573  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.640197  normal  0.320804 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4486  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  53.89 
 
 		 518 aa  570  1e-161  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1200  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  49.43 
 
 		 524 aa  544  1e-153  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251423 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0272  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  49.41 
 
 		 523 aa  540  9.999999999999999e-153  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.322626  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0493  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  48.58 
 
 		 522 aa  514  1e-144  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0648  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  49.58 
 
 		 489 aa  496  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2819  nitrogenase molybdenum-iron protein, beta subunit  50.22 
 
 		 489 aa  488  1e-137  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3205  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  49.57 
 
 		 489 aa  486  1e-136  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0664  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  48.54 
 
 		 489 aa  486  1e-136  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.862296 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2076  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  49.27 
 
 		 487 aa  488  1e-136  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1177  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  49.78 
 
 		 487 aa  486  1e-136  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2143  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  49.48 
 
 		 487 aa  483  1e-135  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.305963 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2100  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  47.29 
 
 		 487 aa  481  1e-134  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1051  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  48.42 
 
 		 472 aa  476  1e-133  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3028  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  47 
 
 		 489 aa  472  1e-132  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3469  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  48.33 
 
 		 487 aa  472  1e-132  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0681  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  42.28 
 
 		 459 aa  363  3e-99  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.746204  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0838  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  40.57 
 
 		 458 aa  356  3.9999999999999996e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1953  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  40.94 
 
 		 460 aa  356  5e-97  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.119434  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2617  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  40.18 
 
 		 458 aa  356  6.999999999999999e-97  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0740  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  40.32 
 
 		 459 aa  353  4e-96  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1027  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  38.28 
 
 		 461 aa  352  8e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.975928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1755  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  40.49 
 
 		 460 aa  351  2e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.077468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1248  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  40.67 
 
 		 485 aa  350  4e-95  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.36292  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3094  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  39.59 
 
 		 461 aa  347  2e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1631  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  40.54 
 
 		 460 aa  344  2e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000877058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2817  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  38.44 
 
 		 463 aa  342  8e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0167  nitrogenase, subunit beta  37.5 
 
 		 456 aa  340  5e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1532  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  40.05 
 
 		 459 aa  339  7e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1015  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  38.6 
 
 		 458 aa  335  9e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.502201  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1154  nitrogenase molybdenum-iron protein, beta subunit  37.58 
 
 		 461 aa  330  4e-89  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.813541  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0557  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  37.44 
 
 		 455 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0151336  normal  0.228475 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1146  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  35.11 
 
 		 455 aa  310  5e-83  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.101192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0059  nitrogenase  35.24 
 
 		 458 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.148206  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0104  nitrogenase  36.81 
 
 		 458 aa  302  1e-80  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.294919  normal  0.143181 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0664  nitrogenase  36.81 
 
 		 458 aa  301  3e-80  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.683559  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1797  nitrogenase  36.57 
 
 		 458 aa  299  7e-80  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.561613  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0061  nitrogenase  38.34 
 
 		 462 aa  298  2e-79  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0147  nitrogenase  37.89 
 
 		 490 aa  295  2e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1799  nitrogenase  36.57 
 
 		 462 aa  293  7e-78  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0102  nitrogenase  36.34 
 
 		 462 aa  291  2e-77  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0981911  normal  0.153494 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0662  nitrogenase  36.34 
 
 		 462 aa  290  3e-77  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.341539  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1198  nitrogenase  34.09 
 
 		 475 aa  283  6.000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.403437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1430  nitrogenase  36.08 
 
 		 472 aa  280  5e-74  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0165  nitrogenase associated protein N  33.48 
 
 		 477 aa  276  9e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4040  nitrogenase  33.26 
 
 		 475 aa  265  2e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.342277  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_002936  DET1152  nitrogenase molybdenum-iron protein, beta subunit, putative  32.5 
 
 		 451 aa  239  9e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.680246  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2815  nitrogenase  32.57 
 
 		 479 aa  237  4e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2276  nitrogenase, subunit beta  32.29 
 
 		 461 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.665587  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1029  Nitrogenase  33.11 
 
 		 466 aa  236  7e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1551  nitrogenase, subunit K  32.51 
 
 		 462 aa  231  3e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1757  Nitrogenase  32.05 
 
 		 457 aa  231  3e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0799606  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48970  Fe-only nitrogenase, beta subunit  31.68 
 
 		 462 aa  228  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12057  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2613  Fe-only nitrogenase, beta subunit  32.74 
 
 		 462 aa  227  5.0000000000000005e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02590  vanadium nitrogenase beta subunit, vnfK  32.74 
 
 		 475 aa  222  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.607029  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1955  Nitrogenase  31.42 
 
 		 450 aa  219  1e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0171503  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0555  Nitrogenase  30.16 
 
 		 456 aa  218  2e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.376218 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1633  Nitrogenase  31.05 
 
 		 456 aa  218  2e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000322358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1392  nitrogenase  31.54 
 
 		 462 aa  217  4e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.392625  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0679  Nitrogenase  31.28 
 
 		 451 aa  217  5e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0432483  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1620  Fe-only nitrogenase, beta subunit  30.89 
 
 		 461 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.855819  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4027  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  32.01 
 
 		 463 aa  213  5.999999999999999e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.762261 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1012  nitrogenase  30.25 
 
 		 454 aa  213  5.999999999999999e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2621  Nitrogenase  28.23 
 
 		 538 aa  213  5.999999999999999e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>