34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1229 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1229  hypothetical protein  100 
 
 		 450 aa  860    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1369  hypothetical protein  80.68 
 
 		 442 aa  653    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4316  hypothetical protein  77.38 
 
 		 445 aa  598  1e-170  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0448  hypothetical protein  70.94 
 
 		 457 aa  594  1e-169  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4166  hypothetical protein  76.7 
 
 		 458 aa  589  1e-167  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.221707 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3857  hypothetical protein  77.18 
 
 		 458 aa  590  1e-167  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862287 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0029  major facilitator transporter  50.71 
 
 		 448 aa  365  1e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0641866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1896  major facilitator transporter  45.91 
 
 		 449 aa  319  5e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.183614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2512  major facilitator transporter  43.72 
 
 		 427 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3250  major facilitator transporter  43.76 
 
 		 427 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.840395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2643  major facilitator transporter  44.42 
 
 		 427 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.268366  normal  0.417045 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1799  major facilitator transporter  40.78 
 
 		 429 aa  301  2e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1530  major facilitator transporter  42.99 
 
 		 438 aa  294  3e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.749699  normal  0.343883 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26360  Major facilitator family protein  41.24 
 
 		 435 aa  290  3e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2661  major facilitator transporter  42.14 
 
 		 439 aa  289  8e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0377  ATP/ADP translocase-like protein  41.55 
 
 		 430 aa  282  9e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2784  transporter, putative  43.04 
 
 		 436 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4783  putative MFS superfamily transport protein  40.14 
 
 		 453 aa  273  3e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.127813  normal  0.486857 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4002  major facilitator transporter  39.51 
 
 		 463 aa  268  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1331  major facilitator superfamily MFS_1  39.37 
 
 		 439 aa  252  1e-65  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.865021  normal  0.03557 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3067  hypothetical protein  36.25 
 
 		 441 aa  221  1.9999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.179764 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01661  hypothetical protein  33.7 
 
 		 385 aa  166  1.0000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.450943  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09318  hypothetical protein  27.32 
 
 		 939 aa  104  3e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3730  ATP/ADP translocase-like protein  27.64 
 
 		 400 aa  82  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.374188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1256  ATP/ADP translocase-like  25.37 
 
 		 450 aa  62.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0929  HEAT repeat-containing PBS lyase  22.12 
 
 		 1010 aa  56.2  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0335  ADP, ATP carrier protein  23.16 
 
 		 529 aa  54.3  0.000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00666368  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1488  ATP/ADP translocase-like protein  23.26 
 
 		 803 aa  53.9  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3729  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.46 
 
 		 909 aa  50.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.369293  normal  0.981995 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46794  nucleotide transporter 4  24.44 
 
 		 591 aa  49.3  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0520076  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49533  nucleotide transporter 1  25.13 
 
 		 610 aa  48.9  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1797  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 73 aa  48.5  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000398276  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2039  hypothetical protein  24.85 
 
 		 1002 aa  47.8  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.373695 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50189  nucleotide transporter 3  23.69 
 
 		 666 aa  47.8  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.384013  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>