35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3239 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3239  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  428  1e-119  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.303297  normal  0.187673 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2171  hypothetical protein  28.92 
 
 		 203 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0717446  normal  0.0305929 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3040  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  37.82 
 
 		 197 aa  95.1  7e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2950  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  38.1 
 
 		 205 aa  84.7  9e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1791  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.45 
 
 		 191 aa  82.8  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.823427 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3864  hypothetical protein  38.6 
 
 		 174 aa  76.6  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0660  hypothetical protein  30.61 
 
 		 213 aa  72  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7385  hypothetical protein  31.03 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0359  putative integral membrane protein  30.95 
 
 		 223 aa  67.8  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0003  hypothetical protein  27.92 
 
 		 257 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0005  putative integral membrane protein  27.92 
 
 		 257 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1980  hypothetical protein  32.49 
 
 		 193 aa  63.9  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0006793  normal  0.0779931 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3176  hypothetical protein  30.2 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132982  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6423  hypothetical protein  36.56 
 
 		 244 aa  61.6  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.812738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2810  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  26.32 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.231029  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1926  hypothetical protein  29.19 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4173  putative integral membrane protein  28.72 
 
 		 279 aa  57  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4814  putative integral membrane protein  26.67 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13267  integral membrane protein  35.11 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.849706  normal  0.37238 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3401  hypothetical protein  28.64 
 
 		 271 aa  53.1  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1324  hypothetical protein  30.93 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2587  putative integral membrane protein  26.47 
 
 		 252 aa  52.8  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5015  hypothetical protein  29.35 
 
 		 242 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3499  putative integral membrane protein  36.23 
 
 		 257 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.23601  normal  0.728118 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3549  putative integral membrane protein  36.23 
 
 		 257 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.393882  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3486  putative integral membrane protein  36.23 
 
 		 257 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.379383  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2947  putative integral membrane protein  27.46 
 
 		 262 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.704391  normal  0.150351 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0781  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.33 
 
 		 189 aa  46.6  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.225749  normal  0.571315 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2945  putative integral membrane protein  26.94 
 
 		 245 aa  45.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2482  hypothetical protein  28.95 
 
 		 169 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.492151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0275  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.03 
 
 		 213 aa  42.7  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.6638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3805  hypothetical protein  28.97 
 
 		 160 aa  42.7  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3245  hypothetical protein  32.95 
 
 		 215 aa  42  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0910  hypothetical protein  26.34 
 
 		 271 aa  41.6  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0571  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.17 
 
 		 207 aa  41.6  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.537112  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>