21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2053 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2053  hypothetical protein  100 
 
 
224 aa  458  1e-128  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113901  normal  0.0119007 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2823  hypothetical protein  93.1 
 
 
232 aa  434  1e-121  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2751  hypothetical protein  89.24 
 
 
225 aa  406  1e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0312385 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1320  hypothetical protein  84.85 
 
 
233 aa  394  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0825886 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2581  hypothetical protein  84.85 
 
 
233 aa  393  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.178484 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2902  hypothetical protein  78.92 
 
 
225 aa  361  6e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0615892  normal  0.938531 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1252  hypothetical protein  78.83 
 
 
225 aa  360  1e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0979226  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2656  hypothetical protein  31.84 
 
 
196 aa  99  5e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3212  hypothetical protein  32.09 
 
 
193 aa  94  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3213  hypothetical protein  50 
 
 
173 aa  70.9  1e-11  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.052023 
 
 
-
 
NC_003296  RS03903  hypothetical protein  48.48 
 
 
115 aa  67.8  1e-10  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0850  hypothetical protein  50.85 
 
 
164 aa  66.6  3e-10  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.272158  normal  0.0878547 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3211  hypothetical protein  60.87 
 
 
68 aa  63.2  3e-09  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2070  hypothetical protein  39.68 
 
 
127 aa  59.3  4e-08  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.981444 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1147  hypothetical protein  39.06 
 
 
136 aa  57.4  2e-07  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1524  hypothetical protein  45.31 
 
 
173 aa  54.7  1e-06  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.545795 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2334  hypothetical protein  33.85 
 
 
108 aa  53.5  2e-06  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.777792 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1451  hypothetical protein  40.62 
 
 
136 aa  52.4  5e-06  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2943  hypothetical protein  35.94 
 
 
136 aa  51.2  1e-05  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2529  hypothetical protein  37.29 
 
 
70 aa  48.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0240  hypothetical protein  54.05 
 
 
85 aa  45.8  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>