43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0022 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0022  hypothetical protein  100 
 
 
436 aa  881  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0867  hypothetical protein  80.96 
 
 
436 aa  736  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0801  hypothetical protein  92.2 
 
 
436 aa  815  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1116  methanogenesis marker protein 10  91.06 
 
 
436 aa  823  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1262  hypothetical protein  65.83 
 
 
455 aa  593  1e-168  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2422  hypothetical protein  44.07 
 
 
409 aa  355  1e-96  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0898  hypothetical protein  44.55 
 
 
411 aa  351  2e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0508  hypothetical protein  45.34 
 
 
413 aa  345  1e-93  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0774462  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1632  hypothetical protein  39.42 
 
 
408 aa  322  6e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1781  hypothetical protein  39.08 
 
 
408 aa  312  7e-84  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.415855  normal  0.69888 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1909  methanogenesis marker protein 10  38.07 
 
 
409 aa  310  4e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.144576 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2512  hypothetical protein  39.61 
 
 
408 aa  310  5e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.471508 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1316  hypothetical protein  36.3 
 
 
407 aa  289  7e-77  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3279  protein of unknown function DUF512  24.23 
 
 
432 aa  55.1  2e-06  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0750  protein of unknown function DUF512  25.17 
 
 
433 aa  53.9  5e-06  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0632  hypothetical protein  27.5 
 
 
446 aa  53.1  1e-05  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.674286 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1774  hypothetical protein  22.48 
 
 
430 aa  52  2e-05  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0164491  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1997  PDZ domain-containing protein  21.2 
 
 
433 aa  51.6  3e-05  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0347733  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2107  protein of unknown function DUF512  29.25 
 
 
440 aa  51.2  4e-05  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00107289  normal  0.222005 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2331  Fe-S oxidoreductase  33.75 
 
 
465 aa  50.8  5e-05  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.308629  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0459  FeS-containing organism-specific oxidoreductase  27.73 
 
 
441 aa  49.3  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.320532  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01101  putative Fe-S oxidoreductase  36.07 
 
 
470 aa  49.7  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.277769  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2541  FeS-containing oxidoreductase  32.5 
 
 
448 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1159  hypothetical protein  34.21 
 
 
439 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000801932  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2049  hypothetical protein  21.25 
 
 
433 aa  48.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000101437  hitchhiker  1.46402e-08 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0438  radical SAM domain-containing protein  28.33 
 
 
390 aa  47.8  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.777378  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01111  putative Fe-S oxidoreductase  32.5 
 
 
464 aa  47.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.980262  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0981  protein of unknown function DUF512  21.15 
 
 
432 aa  47  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000360347  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02221  putative Fe-S oxidoreductase  32.61 
 
 
465 aa  46.6  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1466  putative Fe-S oxidoreductase  33.75 
 
 
449 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.455289  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0102  putative Fe-S oxidoreductase  30.26 
 
 
470 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.383242  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0990  protein of unknown function DUF512  31.08 
 
 
444 aa  46.6  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  9.32101e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1984  hypothetical protein  31.17 
 
 
438 aa  46.2  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4507  hypothetical protein  31.34 
 
 
456 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2966  hypothetical protein  32.88 
 
 
436 aa  45.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0640841  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2244  FeS-containing oxidoreductase  31.25 
 
 
453 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1883  FeS-containing oxidoreductase  34.43 
 
 
451 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.64586  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1225  protein of unknown function DUF512  33.33 
 
 
442 aa  45.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.767388  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2296  FeS-containing organism-specific oxidoreductase  31.25 
 
 
453 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00042763  normal  0.0619176 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01681  putative Fe-S oxidoreductase  32.5 
 
 
449 aa  44.3  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.911896  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0359  Fe-S oxidoreductase  32.61 
 
 
465 aa  43.9  0.006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1631  protein of unknown function DUF512  31.87 
 
 
454 aa  43.9  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00530205 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01131  putative Fe-S oxidoreductase  32.79 
 
 
459 aa  43.9  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.104938  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>