More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0013 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_0243  L-glutamine synthetase  72.32 
 
 
469 aa  725  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4255  glutamine synthetase  69.02 
 
 
469 aa  698  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.743533 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2186  glutamine synthetase, type I  66.67 
 
 
471 aa  689  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.179605  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67600  glutamine synthetase  70.84 
 
 
469 aa  694  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4189  glutamine synthetase  69.66 
 
 
469 aa  710  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2149  glutamine synthetase, type I  66.88 
 
 
471 aa  690  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5098  glutamine synthetase, type I  67.89 
 
 
468 aa  671  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0030  glutamine synthetase  69.66 
 
 
469 aa  710  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1122  glutamine synthetase, type I  67.73 
 
 
471 aa  695  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.744153  normal  0.286491 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0300  glutamine synthetase  71.12 
 
 
469 aa  704  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.114886  hitchhiker  0.00271616 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5002  glutamine synthetase, type I  66.24 
 
 
471 aa  662  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0311  glutamine synthetase  71.34 
 
 
469 aa  704  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3916  glutamine synthetase  70.94 
 
 
469 aa  706  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4881  glutamine synthetase  69.02 
 
 
469 aa  701  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.567284  hitchhiker  0.000124189 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0292  glutamine synthetase  70.51 
 
 
469 aa  706  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  9.78153e-06 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0418  glutamine synthetase, type I  68.53 
 
 
468 aa  675  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.910839  normal  0.393257 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0325  glutamine synthetase  71.12 
 
 
469 aa  708  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000686666  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2234  glutamine synthetase, type I  65.6 
 
 
469 aa  639  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.356963  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1440  glutamine synthetase, type I  67.6 
 
 
469 aa  667  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00931108  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2062  L-glutamine synthetase  67.94 
 
 
471 aa  689  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00147579  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2059  glutamine synthetase, type I  66.67 
 
 
471 aa  689  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0697  glutamine synthetase, type I  66.88 
 
 
471 aa  679  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.817374 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5928  glutamine synthetase, type I  66.88 
 
 
471 aa  690  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3581  glutamine synthetase, type I  68.79 
 
 
471 aa  698  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1124  glutamate--ammonia ligase  63.58 
 
 
469 aa  643  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.453717  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1544  L-glutamine synthetase  65.17 
 
 
469 aa  645  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2167  glutamine synthetase, type I  66.88 
 
 
471 aa  690  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4643  glutamine synthetase  70.73 
 
 
469 aa  707  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0305  glutamine synthetase  71.34 
 
 
469 aa  705  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3719  glutamine synthetase  71.34 
 
 
469 aa  705  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.606524  normal  0.0221879 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0013  L-glutamine synthetase  100 
 
 
471 aa  976  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.778405 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3416  glutamine synthetase  72.04 
 
 
469 aa  717  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.532289 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4392  glutamine synthetase  69.02 
 
 
469 aa  698  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.519647  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3484  glutamine synthetase, type I  68.87 
 
 
472 aa  698  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.068778  normal  0.31098 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0736  glutamine synthetase, type I  73 
 
 
468 aa  724  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00218328  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0306  glutamine synthetase  71.34 
 
 
469 aa  704  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2634  glutamine synthetase, type I  67.09 
 
 
471 aa  687  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.675717  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2690  glutamine synthetase, type I  67.09 
 
 
471 aa  687  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363282  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1389  glutamine synthetase, type I  64.96 
 
 
469 aa  644  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.737079  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1524  glutamine synthetase, type I  67.09 
 
 
471 aa  687  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1645  glutamine synthetase, type I  69.31 
 
 
469 aa  689  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.356376  normal  0.294461 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3554  glutamine synthetase  71.77 
 
 
469 aa  711  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4920  glutamine synthetase, type I  68.1 
 
 
468 aa  671  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0970  glutamine synthetase, type I  65.17 
 
 
469 aa  648  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.545228  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1255  glutamine synthetase, type I  67.73 
 
 
471 aa  685  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.027099  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2318  glutamine synthetase  72.69 
 
 
469 aa  731  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4140  L-glutamine synthetase  68.52 
 
 
468 aa  677  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4096  glutamine synthetase  69.02 
 
 
469 aa  699  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3067  glutamine synthetase, type I  67.09 
 
 
471 aa  687  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2076  L-glutamine synthetase  68.66 
 
 
472 aa  697  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.943231  normal  0.983586 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4097  glutamine synthetase  69.02 
 
 
469 aa  698  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0769  glutamine synthetase, type I  74.68 
 
 
467 aa  745  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1442  L-glutamine synthetase  66.45 
 
 
471 aa  664  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2780  glutamine synthetase, type I  66.88 
 
 
471 aa  673  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.481689  hitchhiker  0.00799964 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1189  L-glutamine synthetase  65.39 
 
 
471 aa  661  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.868262  normal  0.510939 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00588  glutamine synthetase  72.9 
 
 
469 aa  731  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2253  glutamine synthetase, type I  67.09 
 
 
471 aa  687  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3154  glutamine synthetase, type I  66.67 
 
 
471 aa  665  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0027  glutamine synthetase  69.66 
 
 
469 aa  710  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1217  glutamine synthetase, type I  83.86 
 
 
471 aa  844  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1582  glutamine synthetase, type I  83.01 
 
 
471 aa  827  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0307  glutamine synthetase  71.34 
 
 
469 aa  704  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4146  glutamine synthetase  69.02 
 
 
469 aa  698  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.216906 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5853  glutamine synthetase  70.84 
 
 
469 aa  694  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343891  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0412  glutamine synthetase  71.12 
 
 
469 aa  703  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1090  glutamine synthetase, type I  63.58 
 
 
469 aa  646  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.603235  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03755  glutamine synthetase  69.02 
 
 
469 aa  698  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1743  glutamine synthetase, type I  67.09 
 
 
471 aa  687  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0103435  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1318  glutamine synthetase  65.52 
 
 
469 aa  658  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1315  glutamine synthetase  65.52 
 
 
469 aa  658  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4817  glutamine synthetase type I  68.75 
 
 
468 aa  679  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0975  L-glutamine synthetase  68.24 
 
 
469 aa  672  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.85428  hitchhiker  0.000890816 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3763  L-glutamine synthetase  69.51 
 
 
471 aa  694  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.382156  normal  0.0833573 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1179  glutamine synthetase, type I  68.15 
 
 
471 aa  693  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1920  glutamine synthetase, type I  65.31 
 
 
469 aa  644  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.656654  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2057  L-glutamine synthetase  67.94 
 
 
471 aa  691  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.648979  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1632  glutamine synthetase, type I  69.85 
 
 
471 aa  707  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45850  glutamine synthetase, type I; GlnA  70.41 
 
 
467 aa  701  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2503  L-glutamine synthetase  72.1 
 
 
469 aa  704  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1109  glutamine synthetase, type I  65.61 
 
 
471 aa  664  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2375  glutamine synthetase  65.38 
 
 
469 aa  653  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.290662  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3959  glutamine synthetase  70.69 
 
 
469 aa  704  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03704  hypothetical protein  69.02 
 
 
469 aa  698  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4116  glutamine synthetase, type I  69.02 
 
 
469 aa  698  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2577  glutamine synthetase, type I  77.14 
 
 
469 aa  795  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0018456 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001905  glutamine synthetase type I  73.33 
 
 
469 aa  734  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.168817  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5046  glutamine synthetase, type I  68.1 
 
 
468 aa  671  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.114417  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1677  glutamine synthetase, type I  79.27 
 
 
469 aa  806  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.20708  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1258  glutamine synthetase protein  69.21 
 
 
471 aa  698  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.859472 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0209  glutamine synthetase, type I  73.93 
 
 
469 aa  745  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.692281  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4503  glutamine synthetase  69.66 
 
 
469 aa  706  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.664136  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0400  glutamine synthetase  71.55 
 
 
468 aa  705  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0641467  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4220  glutamine synthetase  69.66 
 
 
469 aa  707  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1004  glutamine synthetase, type I  65.17 
 
 
469 aa  647  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4410  glutamine synthetase  70.69 
 
 
469 aa  701  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0359  glutamine synthetase, type I  68.1 
 
 
468 aa  675  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4156  glutamine synthetase  70.69 
 
 
469 aa  712  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.35339  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2770  glutamine synthetase, type I  67.09 
 
 
471 aa  687  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2652  glutamine synthetase type I  76.56 
 
 
469 aa  774  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  1.27344e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0344  L-glutamine synthetase  68.32 
 
 
468 aa  674  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.734058 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>