251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1898 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1851  periplasmic binding protein  100 
 
 
353 aa  692  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1898  periplasmic binding protein  100 
 
 
353 aa  692  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1832  periplasmic binding protein  99.15 
 
 
353 aa  684  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.136123  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2081  periplasmic binding protein  65.9 
 
 
380 aa  422  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.754693 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4278  periplasmic binding protein  65.58 
 
 
405 aa  409  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.170406  normal  0.771045 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13060  Fe(III)-dicitrate-binding periplasmic lipoprotein fecB  62.03 
 
 
359 aa  398  1e-110  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0425065 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3525  periplasmic binding protein  37.14 
 
 
310 aa  173  4e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.476755  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1784  hypothetical protein  34.88 
 
 
309 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.933909 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4123  periplasmic binding protein  34.52 
 
 
346 aa  146  7e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0413  periplasmic binding protein  32.12 
 
 
319 aa  141  2e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2011  periplasmic binding protein  30 
 
 
662 aa  129  1e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00756421  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2422  periplasmic binding protein  34.41 
 
 
300 aa  126  6e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2264  periplasmic binding protein  28.7 
 
 
324 aa  124  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0778  lipoprotein  28.78 
 
 
316 aa  124  3e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.662712  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2078  periplasmic binding protein  27.76 
 
 
320 aa  121  2e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0923581  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7985  substrate-binding family protein, putative  31.1 
 
 
336 aa  119  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.428373  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2237  putative iron compound-binding protein  27.4 
 
 
305 aa  118  2e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0793747  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2283  substrate-binding family protein, putative  25.31 
 
 
321 aa  118  2e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00918063  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2038  iron(III) dicitrate-binding protein  26.79 
 
 
320 aa  117  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  3.24878e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2365  putative iron compound-binding protein  24.85 
 
 
320 aa  117  4e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00267184  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2036  iron(III) dicitrate-binding protein  27.05 
 
 
320 aa  117  4e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  1.0516e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3087  putative iron compound-binding protein  27.05 
 
 
320 aa  116  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.32473  hitchhiker  9.18537e-17 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2280  putative iron compound-binding protein  26.43 
 
 
320 aa  115  8e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17371e-45 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2255  substrate-binding family protein  26.43 
 
 
320 aa  115  8e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00818777  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2099  substrate-binding family protein  26.43 
 
 
320 aa  115  8e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  2.70129e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3282  periplasmic binding protein  33.33 
 
 
329 aa  115  1e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2122  periplasmic binding protein  31.27 
 
 
298 aa  115  2e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10692  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1987  periplasmic binding protein  24.64 
 
 
324 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  1.25239e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5759  periplasmic binding protein  29.82 
 
 
331 aa  113  4e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0683  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.98 
 
 
321 aa  112  8e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0615  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  26.79 
 
 
321 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  2.82355e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0581  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  26.79 
 
 
321 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  6.73134e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0529  periplasmic binding protein  26.71 
 
 
322 aa  110  4e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00029355  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0743  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.79 
 
 
321 aa  110  4e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  8.97265e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0652  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.14 
 
 
322 aa  109  8e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000476646  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4685  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.14 
 
 
322 aa  109  8e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0132289  hitchhiker  2.7046e-21 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  26.79 
 
 
321 aa  109  9e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.33829e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0670  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.79 
 
 
321 aa  109  9e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.07774e-37 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  26.79 
 
 
321 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  2.68482e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2940  periplasmic binding protein  29.58 
 
 
316 aa  107  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30510  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  31.88 
 
 
326 aa  106  7e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.163783  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3865  periplasmic binding protein  28.72 
 
 
329 aa  105  9e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.900175  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1523  periplasmic binding protein  27.66 
 
 
313 aa  102  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3654  periplasmic binding protein  34.28 
 
 
329 aa  100  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.841476  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0133  periplasmic binding protein  27.46 
 
 
306 aa  96.3  7e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0463  periplasmic binding protein  27.02 
 
 
308 aa  95.9  8e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2440  periplasmic binding protein  28.85 
 
 
348 aa  96.3  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  1.2115e-07 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5448  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.19 
 
 
312 aa  94  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5060  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.93 
 
 
314 aa  93.6  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.320975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5628  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  23.93 
 
 
314 aa  93.6  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5229  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  23.93 
 
 
314 aa  93.6  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5077  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.93 
 
 
314 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5503  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.19 
 
 
312 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5173  periplasmic binding protein  26.1 
 
 
312 aa  93.2  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2943  periplasmic binding protein  28.98 
 
 
305 aa  92  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.382264  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4780  periplasmic binding protein  27.55 
 
 
305 aa  91.7  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5558  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.83 
 
 
311 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2670  periplasmic binding protein  27.88 
 
 
272 aa  90.1  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5509  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.62 
 
 
314 aa  89.7  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5472  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.62 
 
 
314 aa  89.7  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3901  periplasmic binding protein  23.34 
 
 
313 aa  82.8  9e-15  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1043  periplasmic binding protein  29.27 
 
 
340 aa  82.4  1e-14  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1777  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  20.56 
 
 
331 aa  81.6  2e-14  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0102  periplasmic binding protein  24.48 
 
 
330 aa  81.6  2e-14  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  1.4163e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0106  periplasmic binding protein  24.48 
 
 
330 aa  81.6  2e-14  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  1.00605e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2409  periplasmic binding protein  25.26 
 
 
333 aa  79.7  8e-14  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0140485  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4510  periplasmic binding protein  27.62 
 
 
317 aa  79.3  9e-14  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.145248 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2413  periplasmic binding protein  26.85 
 
 
351 aa  78.2  2e-13  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4269  periplasmic binding protein  26.21 
 
 
314 aa  74.3  3e-12  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0364817  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2064  periplasmic binding protein  23.38 
 
 
313 aa  72.8  8e-12  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0694  putative iron compound-binding protein  25.64 
 
 
314 aa  71.6  2e-11  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00869259  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06007  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  25.44 
 
 
298 aa  71.2  2e-11  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4541  putative iron compound-binding protein  25.24 
 
 
314 aa  71.2  3e-11  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00289345  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0693  periplasmic binding protein  25.8 
 
 
306 aa  70.9  3e-11  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2757  periplasmic binding protein  28.82 
 
 
309 aa  71.2  3e-11  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4317  substrate-binding family protein  25.24 
 
 
314 aa  70.5  5e-11  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  7.12566e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4501  putative iron compound-binding protein  25.24 
 
 
314 aa  70.5  5e-11  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170385 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4166  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.24 
 
 
314 aa  70.5  5e-11  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  2.45758e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4652  substrate-binding family protein  25.24 
 
 
314 aa  70.5  5e-11  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152488  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4155  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.24 
 
 
314 aa  68.9  1e-10  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  6.76883e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2754  periplasmic binding protein  26.78 
 
 
312 aa  68.6  2e-10  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5028  periplasmic binding protein  30.43 
 
 
316 aa  68.6  2e-10  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.690796  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4069  periplasmic binding protein  31.93 
 
 
342 aa  67.8  3e-10  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.423894 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0794  periplasmic binding protein  28.19 
 
 
314 aa  67.8  3e-10  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.352793  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2246  periplasmic binding protein  22.34 
 
 
327 aa  67  4e-10  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.13483  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2208  periplasmic binding protein  22.34 
 
 
327 aa  67  4e-10  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.970371  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0640  periplasmic binding protein  26.55 
 
 
337 aa  67  4e-10  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.451068  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1119  periplasmic binding protein  21.12 
 
 
319 aa  66.6  5e-10  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  5.65066e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0550  periplasmic binding protein  22.92 
 
 
313 aa  67  5e-10  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7292  ABC transporter membrane spanning protein (iron(III) dicitrate)  27.27 
 
 
311 aa  67  5e-10  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1097  periplasmic binding protein  21.12 
 
 
319 aa  66.6  5e-10  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  1.53945e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0807  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.52 
 
 
314 aa  66.2  9e-10  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.426992  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2421  periplasmic binding protein  26.55 
 
 
309 aa  65.9  1e-09  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2590  periplasmic binding protein  27.41 
 
 
301 aa  65.9  1e-09  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.37556  normal  0.0169021 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4041  periplasmic binding protein  30.71 
 
 
341 aa  65.5  1e-09  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2699  periplasmic binding protein  24.83 
 
 
305 aa  65.1  2e-09  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.885635  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3506  periplasmic binding protein  21.04 
 
 
321 aa  64.3  3e-09  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474135  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1354  enterochelin ABC transporter, periplasmic enterochelin-binding protein, authentic frameshift  22.45 
 
 
330 aa  63.5  5e-09  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3139  periplasmic binding protein  27.46 
 
 
315 aa  63.5  5e-09  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  3.55327e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2829  twin-arginine translocation pathway signal  23.92 
 
 
300 aa  63.5  5e-09  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.582079  normal  0.501847 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>