35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_3499 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3486  putative integral membrane protein  100 
 
 
257 aa  513  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.379383  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3549  putative integral membrane protein  100 
 
 
257 aa  513  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.393882  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3499  putative integral membrane protein  100 
 
 
257 aa  513  1e-144  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.23601  normal  0.728118 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13267  integral membrane protein  72.73 
 
 
244 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.849706  normal  0.37238 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2947  putative integral membrane protein  66.24 
 
 
262 aa  309  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.704391  normal  0.150351 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0003  hypothetical protein  53.69 
 
 
257 aa  270  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0005  putative integral membrane protein  53.69 
 
 
257 aa  270  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2587  putative integral membrane protein  49.6 
 
 
252 aa  262  4.999999999999999e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4173  putative integral membrane protein  55.42 
 
 
279 aa  259  3e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2945  putative integral membrane protein  55.97 
 
 
245 aa  257  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4814  putative integral membrane protein  51.26 
 
 
248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3176  hypothetical protein  50.19 
 
 
266 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132982  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7385  hypothetical protein  56.36 
 
 
252 aa  242  6e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6423  hypothetical protein  57.56 
 
 
244 aa  235  4e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.812738  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5015  hypothetical protein  53.78 
 
 
242 aa  224  8e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3401  hypothetical protein  30.69 
 
 
271 aa  73.9  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0910  hypothetical protein  27.35 
 
 
271 aa  67.4  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3040  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  43.01 
 
 
197 aa  60.8  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1980  hypothetical protein  29.32 
 
 
193 aa  60.5  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0006793  normal  0.0779931 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2171  hypothetical protein  31.93 
 
 
203 aa  60.1  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0717446  normal  0.0305929 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1791  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  38.96 
 
 
191 aa  58.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.823427 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0359  putative integral membrane protein  28.84 
 
 
223 aa  57.4  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1926  hypothetical protein  31.35 
 
 
197 aa  57.4  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0660  hypothetical protein  38.24 
 
 
213 aa  57  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1324  hypothetical protein  28.79 
 
 
196 aa  53.1  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3239  hypothetical protein  36.23 
 
 
215 aa  50.8  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.303297  normal  0.187673 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2810  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  32.88 
 
 
198 aa  47.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.231029  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4413  hypothetical protein  32.81 
 
 
216 aa  47  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0781  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.71 
 
 
189 aa  45.8  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.225749  normal  0.571315 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5364  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  38.2 
 
 
220 aa  45.8  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2950  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  30.65 
 
 
205 aa  45.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6146  hypothetical protein  37.84 
 
 
207 aa  43.9  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0971  normal  0.0597032 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4501  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  39.19 
 
 
224 aa  43.5  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.843705 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0345  protein-S-isoprenylcysteine O-methyltransferase-like protein  29.41 
 
 
126 aa  43.5  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.7101  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1746  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.65 
 
 
194 aa  42.4  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>