54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0281 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_0281  YibE/F family protein  100 
 
 		 413 aa  800    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.715715  normal  0.837418 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0617  YibE/F family protein  87.53 
 
 		 411 aa  674    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225708  normal  0.665044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0427  YibE/F family protein  80.2 
 
 		 410 aa  556  1e-157  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.550828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0440  YibE/F-like protein  80.2 
 
 		 424 aa  552  1e-156  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.270973  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0450  YibE/F family protein  80.2 
 
 		 424 aa  552  1e-156  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0441383 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0460  YibE/F family protein  50.23 
 
 		 563 aa  325  8.000000000000001e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1586  YibE/F family protein  52.3 
 
 		 480 aa  314  1.9999999999999998e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.728201  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1335  YibE/F family protein  39.44 
 
 		 499 aa  269  8e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1371  YibE/F family protein  38.5 
 
 		 484 aa  248  1e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000298866 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4407  YibE/F family protein  46.26 
 
 		 447 aa  248  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.689016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2203  YibE/F family protein  41.21 
 
 		 599 aa  240  4e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0616  YibE/F family protein  38.88 
 
 		 436 aa  232  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0532  YibE/F family protein  40.35 
 
 		 449 aa  229  9e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.155623  normal  0.0605973 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0444  YibE/F family protein  45.75 
 
 		 448 aa  223  4.9999999999999996e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.701723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36270  predicted multitransmembrane protein  43.5 
 
 		 484 aa  218  1e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3598  YibE/F family protein  37.75 
 
 		 428 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15190  predicted multitransmembrane protein  36.39 
 
 		 397 aa  212  1e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0772315 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4623  YibE/F family protein  38.8 
 
 		 427 aa  211  3e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0949625  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1777  YibE/F family protein  40.95 
 
 		 422 aa  209  6e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0836045  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0164  YibE/F family protein  41.76 
 
 		 416 aa  207  4e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00530836 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2506  YibE/F family protein  35.55 
 
 		 406 aa  207  4e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.416194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1706  YibE/F family protein  36.41 
 
 		 513 aa  206  5e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0292  YibE/F family protein  36.84 
 
 		 404 aa  184  2.0000000000000003e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.502683  normal  0.0969675 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0151  YibE/F family protein  44.57 
 
 		 438 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0309546 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3310  YibE/F family protein  35.82 
 
 		 386 aa  171  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5754  YibE/F family protein  35.98 
 
 		 404 aa  170  4e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1474  YibE/F family protein  36.86 
 
 		 345 aa  140  4.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.649458  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2084  YibE/F family protein  35.79 
 
 		 446 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0158953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18650  predicted multitransmembrane protein  32.09 
 
 		 404 aa  129  7.000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.221349  normal  0.497385 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2717  YibE/F family protein  30.48 
 
 		 393 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00980244  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2256  hypothetical protein  25.98 
 
 		 393 aa  119  9.999999999999999e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000922663  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1717  YibE/F family protein  28.37 
 
 		 373 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000872311  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2866  YibE/F family protein  27.42 
 
 		 451 aa  107  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.405695  hitchhiker  0.000000000000397965 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1617  YbiE/YbiF family membrane protein  24.76 
 
 		 382 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0997624  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0490  hypothetical protein  29.67 
 
 		 260 aa  99.8  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.45051  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0503  hypothetical protein  29.67 
 
 		 260 aa  99.8  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.84165  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1552  YibE/F family protein  28.99 
 
 		 392 aa  97.1  5e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000166872  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0869  hypothetical protein  26.42 
 
 		 370 aa  95.1  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0893767  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0105  hypothetical protein  28.02 
 
 		 261 aa  95.5  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1156  YibE/F family protein  25.81 
 
 		 385 aa  90.9  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2695  hypothetical protein  23.32 
 
 		 434 aa  90.9  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2300  YibE/F family protein  28.3 
 
 		 376 aa  86.3  9e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000681983  normal  0.658547 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4236  YibE/F family protein  25.26 
 
 		 409 aa  79.7  0.00000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01199  hypothetical protein  22.53 
 
 		 396 aa  74.3  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0513  YibE/F family protein  27.97 
 
 		 386 aa  74.7  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0625  YibE/F family protein  21.65 
 
 		 416 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0617008  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1217  multitransmembrane protein-like  26.96 
 
 		 395 aa  67.4  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0106  hypothetical protein  23.21 
 
 		 370 aa  64.3  0.000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2291  YibE/F family protein  26.2 
 
 		 396 aa  63.9  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0504  hypothetical protein  22.54 
 
 		 370 aa  62.4  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.36708  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0491  hypothetical protein  22.54 
 
 		 370 aa  62.4  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.696499  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0923  YibE/F family protein  21.75 
 
 		 381 aa  55.8  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0732684  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0458  YibE/F family protein  25.22 
 
 		 371 aa  53.5  0.000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000650445  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0532  multitransmembrane protein  25.14 
 
 		 361 aa  47  0.0006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>