32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1799 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_1799  major facilitator transporter  100 
 
 
429 aa  836    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26360  Major facilitator family protein  69.27 
 
 
435 aa  555  1e-157  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2512  major facilitator transporter  70.49 
 
 
427 aa  555  1e-157  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2643  major facilitator transporter  71.05 
 
 
427 aa  551  1e-156  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.268366  normal  0.417045 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3250  major facilitator transporter  70.56 
 
 
427 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.840395  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2661  major facilitator transporter  68.28 
 
 
439 aa  525  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1530  major facilitator transporter  54.18 
 
 
438 aa  428  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.749699  normal  0.343883 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0377  ATP/ADP translocase-like protein  53.19 
 
 
430 aa  420  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2784  transporter, putative  55.23 
 
 
436 aa  414  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4783  putative MFS superfamily transport protein  56.25 
 
 
453 aa  409  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.127813  normal  0.486857 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1331  major facilitator superfamily MFS_1  53.95 
 
 
439 aa  409  1e-113  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.865021  normal  0.03557 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4002  major facilitator transporter  56.27 
 
 
463 aa  386  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0029  major facilitator transporter  45.35 
 
 
448 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0641866  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4316  hypothetical protein  42.42 
 
 
445 aa  295  1e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0448  hypothetical protein  39.72 
 
 
457 aa  290  3e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4166  hypothetical protein  41.57 
 
 
458 aa  286  4e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.221707 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3857  hypothetical protein  41.83 
 
 
458 aa  286  7e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0862287 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1229  hypothetical protein  41.99 
 
 
450 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1369  hypothetical protein  40.67 
 
 
442 aa  279  8e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1896  major facilitator transporter  36.88 
 
 
449 aa  248  2e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.183614  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3067  hypothetical protein  36.89 
 
 
441 aa  223  4.9999999999999996e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.179764 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01661  hypothetical protein  32.71 
 
 
385 aa  161  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.450943  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09318  hypothetical protein  27.44 
 
 
939 aa  87.4  4e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3730  ATP/ADP translocase-like protein  27.79 
 
 
400 aa  77.4  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.374188  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1797  major facilitator transporter  51.72 
 
 
73 aa  66.6  0.0000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000398276  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0335  ADP, ATP carrier protein  21.9 
 
 
529 aa  58.5  0.0000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00666368  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50189  nucleotide transporter 3  24.02 
 
 
666 aa  54.3  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.384013  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1256  ATP/ADP translocase-like  23.08 
 
 
450 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45145  nucleotide transporter 2  22.22 
 
 
575 aa  47.4  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0739731  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0388  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.36 
 
 
532 aa  43.9  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1996  cAMP-binding protein  24.92 
 
 
1002 aa  43.9  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  25.34 
 
 
392 aa  43.1  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>