217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3067 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3067  transcriptional regulator BolA  100 
 
 
100 aa  201  3e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0912  BolA family protein  72.45 
 
 
104 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2562  BolA family protein  62 
 
 
93 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.699047 
 
 
-
 
NC_004310  BR2026  bolA protein  60.61 
 
 
104 aa  124  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129016  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1948  bolA protein  60.61 
 
 
104 aa  124  3e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3886  BolA family protein  61 
 
 
94 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.784426  normal  0.0137165 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3593  BolA family protein  59 
 
 
93 aa  122  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.703664  normal  0.663978 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4050  stress induced morphogen  60 
 
 
98 aa  120  8e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.830681  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0502  BolA family protein  60.42 
 
 
89 aa  107  6e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.922441  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0291  BolA-like protein  57.29 
 
 
101 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.588155 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0535  BolA-like protein  61.46 
 
 
91 aa  102  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.291649  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0538  BolA-like protein  55.21 
 
 
89 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.501492 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0400  BolA-like protein  52.53 
 
 
91 aa  94.7  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.375771  normal  0.486388 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0320  BolA family protein  53.26 
 
 
108 aa  94  6e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.040837 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0495  BolA-like protein  51.52 
 
 
98 aa  92.4  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3429  BolA family protein  49 
 
 
101 aa  88.6  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.719936  normal  0.229892 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3696  BolA family protein  47.37 
 
 
98 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.664653 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3427  BolA family protein  47.37 
 
 
92 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0082  BolA family protein  59.09 
 
 
92 aa  85.1  3e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3232  BolA family protein  48.42 
 
 
119 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.534293 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3556  BolA family protein  48.42 
 
 
92 aa  84.3  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.388148  normal  0.408235 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1875  BolA family protein  51.58 
 
 
124 aa  84  7e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6494  BolA family protein  48.94 
 
 
96 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0447385  normal  0.0203741 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6742  BolA family protein  46.88 
 
 
93 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0716166  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1715  BolA family protein  44.44 
 
 
92 aa  79  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.528946  normal  0.23123 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2333  transcriptional regulator BolA  50 
 
 
102 aa  79.3  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0856009  normal  0.375097 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2911  transcriptional regulator BolA  48.94 
 
 
90 aa  77  0.00000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.345257  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0204  transcriptional regulator BolA  40.2 
 
 
114 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.591481  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29161  predicted protein  43.62 
 
 
98 aa  76.6  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.427878  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7570  hypothetical protein  57.53 
 
 
68 aa  75.5  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.715691 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0449  BolA-like protein  49.44 
 
 
104 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2277  transcriptional regulator BolA  46.07 
 
 
89 aa  74.7  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0689  BolA family protein  46.24 
 
 
85 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1979  stress induced morphogen, BolA  45.16 
 
 
85 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3105  BolA family protein  46.88 
 
 
99 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0646  BolA-like protein  45.56 
 
 
84 aa  72  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.192561  normal  0.533019 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02420  conserved hypothetical protein  44.09 
 
 
161 aa  72  0.000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1203  BolA family protein  41.94 
 
 
85 aa  71.2  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.704892  normal  0.962968 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2237  BolA family protein  42.71 
 
 
106 aa  71.2  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.629925  normal  0.18735 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1694  transcriptional regulator BolA  38.14 
 
 
118 aa  70.1  0.000000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1311  transcriptional regulator BolA  45.83 
 
 
103 aa  69.3  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.662079  normal  0.161621 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0980  BolA-like protein  46.07 
 
 
99 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.308718  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2545  putative cell division protein BolA  44.79 
 
 
99 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.754994 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3433  BolA family protein  43.75 
 
 
99 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1839  BolA family protein  43.48 
 
 
101 aa  68.2  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2528  BolA family protein  38.78 
 
 
127 aa  67.8  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0715  BolA family protein  42.11 
 
 
90 aa  67.8  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.157845  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3299  BolA family protein  46.51 
 
 
93 aa  67.8  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.845093  normal  0.407173 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0710  BolA-like protein  45.83 
 
 
105 aa  67.8  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1885  bolA protein  47.13 
 
 
106 aa  67.4  0.00000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0166011  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3622  BolA family protein  43.75 
 
 
99 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.358741  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1832  BolA family protein  44.32 
 
 
99 aa  67.4  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.773392  normal  0.322979 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0712  bolA protein  41.57 
 
 
104 aa  67  0.00000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.375659  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2584  transcriptional regulator BolA  47.62 
 
 
97 aa  67  0.00000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00875  morphogene BolA protein  43.33 
 
 
107 aa  65.9  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.220108  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002706  cell division protein BolA  44.83 
 
 
102 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0214945  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0970  transcriptional regulator BolA  40 
 
 
106 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0255275  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2883  BolA family protein  41.67 
 
 
99 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.665541  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0932  transcriptional regulator BolA  40.91 
 
 
106 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0202581  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0945  BolA family protein  42.7 
 
 
99 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0934  transcriptional regulator BolA  40.91 
 
 
106 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.150947  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03276  hypothetical protein  45.98 
 
 
102 aa  63.9  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2398  BolA-like protein  44.94 
 
 
97 aa  63.2  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0850633  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0548  BolA-like protein  37.5 
 
 
101 aa  62.4  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.708138  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03668  BolA protein  37.5 
 
 
106 aa  62.4  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3078  BolA family protein  40 
 
 
85 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1099  bolA protein  41.67 
 
 
97 aa  61.6  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0647  BolA-like protein  39.36 
 
 
96 aa  62  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.81334  normal  0.0407934 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2994  transcriptional regulator BolA  39.58 
 
 
103 aa  60.8  0.000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00410783  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0745  BolA family protein  39.36 
 
 
103 aa  60.5  0.000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2879  BolA family protein  41.49 
 
 
104 aa  60.1  0.000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.294183  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0948  BolA protein  41.38 
 
 
104 aa  60.1  0.000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0118  BolA family protein  38.95 
 
 
131 aa  60.1  0.000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.213801  normal  0.0407389 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1880  hypothetical protein  42.7 
 
 
105 aa  59.7  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1552  BolA family protein  44.05 
 
 
96 aa  59.7  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.15156  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0936  BolA family protein  39.33 
 
 
106 aa  59.7  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.526813  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1609  morphogene BolA protein  44.05 
 
 
106 aa  59.3  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.980085  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1891  hypothetical protein  41.57 
 
 
105 aa  59.3  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3567  BolA family protein  40.91 
 
 
106 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3370  BolA family protein  40.91 
 
 
106 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1862  transcriptional regulator BolA  40.96 
 
 
86 aa  58.5  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.020215 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3442  BolA family protein  40.91 
 
 
106 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1765  BolA-like protein  36.56 
 
 
105 aa  58.5  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.082138 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5212  transcriptional regulator BolA  45.56 
 
 
102 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.17561 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1093  transcriptional regulator BolA  40.23 
 
 
104 aa  58.2  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000277187  hitchhiker  0.00000275713 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3237  transcriptional regulator BolA  40.23 
 
 
106 aa  57.8  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00596017  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3056  transcriptional regulator BolA  40.23 
 
 
106 aa  57.8  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209706  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3094  transcriptional regulator BolA  40.23 
 
 
106 aa  57.8  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000183213  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3070  BolA family protein  39.36 
 
 
104 aa  57.8  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0107558  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2030  BolA family protein  41.86 
 
 
92 aa  57.4  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1363  BolA family protein  44.44 
 
 
104 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1674  transcriptional regulator BolA  41.86 
 
 
92 aa  57.4  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.205869  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0920  BolA family protein  41.38 
 
 
97 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0031  BolA family protein  37.5 
 
 
102 aa  57  0.00000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2137  BolA-like protein  41.11 
 
 
106 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0460466  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1875  BolA family protein  43.37 
 
 
83 aa  56.6  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.932748  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2279  putative stress-induced morphogene BolA- like protein  56.52 
 
 
106 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.170015 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0902  transcriptional regulator BolA  39.33 
 
 
105 aa  55.5  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000592891  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3198  transcriptional regulator BolA  39.33 
 
 
105 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000754579  hitchhiker  0.0000747363 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1921  BolA family protein  56.52 
 
 
106 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.066107  normal  0.787426 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>