22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0438 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0438  hypothetical protein  100 
 
 
220 aa  445  1e-124  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.503828  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2060  hypothetical protein  43.12 
 
 
236 aa  196  3e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.456181 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0383  putative PAS/PAC sensor protein  38.57 
 
 
227 aa  152  4e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0136  hypothetical protein  36.71 
 
 
231 aa  143  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.547457  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0564  hypothetical protein  34.4 
 
 
232 aa  140  2e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.567175  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0553  hypothetical protein  23.95 
 
 
273 aa  68.2  8e-11  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1930  hypothetical protein  33.98 
 
 
272 aa  67.4  2e-10  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0737  hypothetical protein  25.81 
 
 
244 aa  50.4  2e-05  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.821766  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2461  CRISPR-associated protein Cas4  24.76 
 
 
196 aa  49.3  5e-05  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0774  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  21.5 
 
 
206 aa  47.8  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.356687  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1717  CRISPR-associated protein Cas4  21.99 
 
 
200 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.73181e-25 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4560  CRISPR-associated protein Cas4  25.83 
 
 
194 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1709  hypothetical protein  26.01 
 
 
227 aa  46.6  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.222121  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.84 
 
 
544 aa  46.2  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4175  hypothetical protein  26.28 
 
 
196 aa  45.8  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  1.76829e-05 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0565  CRISPR-associated protein Cas4  27.27 
 
 
202 aa  43.5  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.234335  normal  0.250424 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5519  CRISPR-associated protein Cas1  26.79 
 
 
558 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6022  CRISPR-associated protein Cas4  25.59 
 
 
195 aa  42.4  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318812  normal  0.45154 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1287  CRISPR-associated Cas4 family protein  27.97 
 
 
190 aa  42.4  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.826986  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1975  CRISPR-associated protein Cas4  26.9 
 
 
255 aa  42  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0227  CRISPR-associated Cas4 family protein  22.94 
 
 
209 aa  42  0.007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.279714  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  24.4 
 
 
545 aa  42  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>