16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1871 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_1871  hypothetical protein  100 
 
 
119 aa  231  2e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.482968  normal  0.159127 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0164  hypothetical protein  36.75 
 
 
120 aa  70.5  8e-12  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0215  hypothetical protein  36.75 
 
 
120 aa  68.2  4e-11  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.250298  hitchhiker  5.80905e-14 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0496  hypothetical protein  40.54 
 
 
115 aa  61.6  3e-09  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2046  hypothetical protein  32.63 
 
 
118 aa  55.5  2e-07  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127106 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1728  hypothetical protein  36.27 
 
 
113 aa  54.3  5e-07  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.267724  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1418  hypothetical protein  36.27 
 
 
113 aa  54.7  5e-07  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2219  hypothetical protein  44.44 
 
 
123 aa  53.1  1e-06  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.246381 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1985  hypothetical protein  38.96 
 
 
114 aa  50.8  7e-06  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0030  hypothetical protein  46.27 
 
 
110 aa  47.8  6e-05  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7320  hypothetical protein  31.63 
 
 
115 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1051  hypothetical protein  30.83 
 
 
120 aa  44.3  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000141356 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0486  hypothetical protein  29 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.407371  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0551  hypothetical protein  31.65 
 
 
113 aa  43.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.295838  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0613  hypothetical protein  31.65 
 
 
113 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0869  hypothetical protein  41.67 
 
 
115 aa  40.8  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.170288 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>