More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_2416 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0482  gamma-glutamyl phosphate reductase  72.2 
 
 
447 aa  676    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.700906 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2416  gamma-glutamyl phosphate reductase  100 
 
 
449 aa  919    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00821851  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3394  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.61 
 
 
443 aa  482  1e-135  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.321961  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2209  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.85 
 
 
445 aa  481  1e-134  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1371  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.06 
 
 
443 aa  479  1e-134  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.754028  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2013  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.12 
 
 
431 aa  461  1e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0170243  normal  0.240578 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0262  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.03 
 
 
431 aa  447  1.0000000000000001e-124  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000913374  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0557  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.88 
 
 
432 aa  447  1.0000000000000001e-124  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000588024  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2594  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.89 
 
 
432 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0057  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.89 
 
 
438 aa  437  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.944563  normal  0.275371 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2590  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.54 
 
 
434 aa  432  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2048  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.69 
 
 
434 aa  433  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2022  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.46 
 
 
434 aa  433  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1397  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.08 
 
 
435 aa  426  1e-118  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4304  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.46 
 
 
433 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.710202  normal  0.487734 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2275  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  48.17 
 
 
431 aa  417  9.999999999999999e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0718764  normal  0.980488 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19350  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  48.85 
 
 
427 aa  409  1e-113  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000458015 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0026  gamma-glutamyl phosphate reductase  50 
 
 
438 aa  399  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.938682  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06461  gamma-glutamyl phosphate reductase  50 
 
 
438 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10601  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.06 
 
 
434 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.107286  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2265  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.17 
 
 
431 aa  394  1e-108  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.687785 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18451  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.32 
 
 
438 aa  392  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.96532 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1026  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.96 
 
 
435 aa  391  1e-107  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.993795  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0590  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.58 
 
 
436 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.291608  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06161  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.72 
 
 
436 aa  384  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4864  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.69 
 
 
423 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.797783  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0927  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.9 
 
 
441 aa  381  1e-104  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2129  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.72 
 
 
434 aa  381  1e-104  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0315956 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90997  predicted protein  45.05 
 
 
443 aa  381  1e-104  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2585  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.58 
 
 
423 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000881796 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4811  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.69 
 
 
423 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.41418 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4369  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.26 
 
 
421 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4686  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.93 
 
 
423 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.820899  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0610  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.66 
 
 
423 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3802  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.66 
 
 
421 aa  372  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4829  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.77 
 
 
421 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369756  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01930  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.21 
 
 
418 aa  374  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06461  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.49 
 
 
436 aa  372  1e-102  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.328707  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05799  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase (Eurofung)  44.69 
 
 
456 aa  369  1e-101  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.22549  hitchhiker  0.00000000000409555 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0367  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.73 
 
 
458 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3412  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.73 
 
 
458 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2450  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.13 
 
 
423 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2637  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.73 
 
 
458 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3743  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.87 
 
 
423 aa  370  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.152827 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1214  gamma-glutamyl phosphate reductase  46 
 
 
423 aa  369  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.818935  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06551  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.22 
 
 
436 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.555624  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1541  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  47.09 
 
 
428 aa  370  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0892613  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3447  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.73 
 
 
458 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1226  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.73 
 
 
458 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1520  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.53 
 
 
414 aa  366  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3447  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.89 
 
 
423 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.928975  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2662  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.23 
 
 
418 aa  365  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00209734  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0482  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.3 
 
 
429 aa  367  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.13569  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3345  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.89 
 
 
435 aa  367  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000234228  normal  0.0212307 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0235  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.15 
 
 
429 aa  367  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2729  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.34 
 
 
435 aa  365  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2980  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.04 
 
 
426 aa  368  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.316248  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1102  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.28 
 
 
421 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0826689  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12010  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.56 
 
 
421 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0624  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.34 
 
 
423 aa  364  2e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0953  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.21 
 
 
446 aa  363  3e-99  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000135756  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2417  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.12 
 
 
418 aa  363  4e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00400511  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0552  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.63 
 
 
423 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.468514  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0657  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.87 
 
 
435 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.291837  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0174  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.87 
 
 
423 aa  362  8e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0257  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.86 
 
 
425 aa  362  1e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2570  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.31 
 
 
426 aa  362  1e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.968824 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0578  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.63 
 
 
423 aa  361  1e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.295302  normal  0.735276 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0090  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.02 
 
 
418 aa  360  2e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2970  gamma-glutamyl phosphate reductase  45 
 
 
426 aa  361  2e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2831  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.25 
 
 
426 aa  360  3e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.20532  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0403  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.15 
 
 
420 aa  360  3e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08350  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.44 
 
 
421 aa  360  4e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0563  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.55 
 
 
418 aa  358  8e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1607  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  43.43 
 
 
419 aa  358  9.999999999999999e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2579  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.96 
 
 
418 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000246583  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0514  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.69 
 
 
421 aa  357  2.9999999999999997e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3644  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.53 
 
 
416 aa  357  2.9999999999999997e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0817389  normal  0.521871 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0644  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.86 
 
 
415 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0349753  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2852  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.15 
 
 
419 aa  355  6.999999999999999e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.204057  hitchhiker  0.000000132471 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4974  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.21 
 
 
423 aa  354  2e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.126752  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2741  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.58 
 
 
426 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2276  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.75 
 
 
427 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.616003  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0619  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.61 
 
 
415 aa  352  7e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00446157  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06240  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase, putative  42.89 
 
 
460 aa  349  5e-95  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2804  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.9 
 
 
420 aa  349  6e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2582  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.48 
 
 
415 aa  348  9e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0579  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.63 
 
 
423 aa  347  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2903  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.48 
 
 
415 aa  348  2e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3508  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.08 
 
 
418 aa  347  3e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876636  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3199  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.82 
 
 
418 aa  347  4e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000241705  unclonable  2.3922e-23 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0188  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.43 
 
 
419 aa  347  4e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.240991  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3377  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.4 
 
 
423 aa  345  7e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4018  hitchhiker  0.00000000120564 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3348  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  43.1 
 
 
423 aa  345  1e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243599  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3211  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.57 
 
 
418 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000676761  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1644  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.72 
 
 
419 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3751  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.3 
 
 
430 aa  343  2.9999999999999997e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.634786 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0674  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.89 
 
 
441 aa  342  5.999999999999999e-93  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3598  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.62 
 
 
418 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_1184  predicted protein  43.49 
 
 
420 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.730647 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>