34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0073 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0073  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  100 
 
 		 286 aa  552  1e-156  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3231  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  44.89 
 
 		 379 aa  205  9e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0855  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  37.93 
 
 		 373 aa  154  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.399663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1779  hypothetical protein  33.12 
 
 		 425 aa  122  6e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.501115  normal  0.0869109 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0187  hypothetical protein  32.14 
 
 		 377 aa  105  6e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1615  hypothetical protein  29.62 
 
 		 425 aa  95.9  6e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0270  hypothetical protein  28.85 
 
 		 417 aa  92.4  8e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0797  hypothetical protein  32.08 
 
 		 472 aa  90.9  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0932  hypothetical protein  31.25 
 
 		 474 aa  91.3  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0864  hypothetical protein  31.1 
 
 		 481 aa  90.1  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3428  hypothetical protein  32.47 
 
 		 481 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3623  hypothetical protein  32.47 
 
 		 481 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.672371 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3500  hypothetical protein  30.74 
 
 		 481 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3210  hypothetical protein  31.91 
 
 		 474 aa  86.3  5e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3313  hypothetical protein  31.17 
 
 		 474 aa  86.7  5e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0813  hypothetical protein  31.91 
 
 		 474 aa  86.3  6e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00191266 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0833  hypothetical protein  31.51 
 
 		 474 aa  85.9  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0975  hypothetical protein  31.17 
 
 		 474 aa  85.5  9e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3135  cytochrome c-type biogenesis protein  26.04 
 
 		 273 aa  85.5  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0405537  normal  0.432106 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3058  hypothetical protein  31.49 
 
 		 473 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0750  hypothetical protein  34.48 
 
 		 475 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4105  hypothetical protein  29.32 
 
 		 444 aa  84  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4013  hypothetical protein  29.7 
 
 		 443 aa  82.4  0.000000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169231  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0130  glutaredoxin  31.1 
 
 		 382 aa  77.8  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0312  hypothetical protein  28.4 
 
 		 479 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000250033  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0626  hypothetical protein  27.63 
 
 		 461 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.78018 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2703  hypothetical protein  30.07 
 
 		 443 aa  73.2  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2246  hypothetical protein  29.9 
 
 		 409 aa  72.8  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0795  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.53 
 
 		 927 aa  67.4  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.337391  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1106  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.24 
 
 		 366 aa  67.4  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1175  hypothetical protein  25.99 
 
 		 471 aa  65.5  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2787  hypothetical protein  27.8 
 
 		 405 aa  58.9  0.00000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.151152  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1017  Cytochrome c biogenesis protein-like protein  24.86 
 
 		 519 aa  53.9  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2062  cytochrome c biogenesis protein  21.3 
 
 		 325 aa  43.9  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>