16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1354 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1354  hypothetical protein  100 
 
 		 364 aa  743    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00474822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0931  protein of unknown function DUF324  41.14 
 
 		 423 aa  260  3e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0413017  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4242  hypothetical protein  36.66 
 
 		 439 aa  206  6e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.339466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3828  protein of unknown function DUF324  35.71 
 
 		 439 aa  200  3e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000223415 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2591  hypothetical protein  39.72 
 
 		 331 aa  171  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.73412 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1987  protein of unknown function DUF324  38.58 
 
 		 359 aa  171  2e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.920046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0804  protein of unknown function DUF324  32.68 
 
 		 376 aa  154  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.505902  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0314  hypothetical protein  31.91 
 
 		 366 aa  139  6e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0913  protein of unknown function DUF324  38.5 
 
 		 363 aa  123  5e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3814  protein of unknown function DUF324  32.27 
 
 		 325 aa  109  9.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.173062  normal  0.192987 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3923  hypothetical protein  43.94 
 
 		 169 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.618286  normal  0.0669339 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0645  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  25.33 
 
 		 341 aa  55.5  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.12027  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0975  hypothetical protein  28.09 
 
 		 220 aa  52.8  0.000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0171126  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0318  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr4 family  25.42 
 
 		 292 aa  46.6  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2975  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr6 family  28 
 
 		 391 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.506126 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1662  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  25.44 
 
 		 271 aa  43.1  0.008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.894194  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>