24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0030 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0030    100 
 
 		 1654 bp  3279    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.367954  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0936  adenine specific DNA methylase MOD  83.37 
 
 		 1734 bp  339  2e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000403504  normal  0.65434 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4169  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  86.08 
 
 		 1662 bp  339  2e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52350  adenine specific DNA methylase N-4/N-6  81.61 
 
 		 1683 bp  311  4.0000000000000004e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3656  adenine specific DNA methylase Mod  81.14 
 
 		 1704 bp  266  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000129355  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0676  DNA methylase N-4/N-6  91.14 
 
 		 1563 bp  93.7  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.635951 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0029  hypothetical protein  100 
 
 		 387 bp  87.7  0.000000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.510948  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12280  hypothetical protein  97.5 
 
 		 8151 bp  71.9  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_6612  hypothetical protein  95 
 
 		 303 bp  63.9  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4096  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  80.3 
 
 		 1638 bp  63.9  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.480555 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0647  hypothetical protein  100 
 
 		 138 bp  58  0.000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000849212  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4576  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  87.27 
 
 		 1149 bp  54  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6611  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  100 
 
 		 1191 bp  50.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0870  ATP-dependent DNA ligase  100 
 
 		 1869 bp  50.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.140434  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0047  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  96.55 
 
 		 2007 bp  50.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4617  ATP-dependent DNA ligase  100 
 
 		 1869 bp  50.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0361  pseudouridine synthase  100 
 
 		 903 bp  50.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0956  DNA polymerase I  100 
 
 		 3102 bp  48.1  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0793  ATP-dependent DNA ligase  100 
 
 		 1893 bp  48.1  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.758441 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0037  protein of unknown function DUF559  100 
 
 		 480 bp  48.1  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43700  hypothetical protein  100 
 
 		 318 bp  48.1  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0548595  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51700  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  100 
 
 		 2112 bp  48.1  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.851543  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0046  hypothetical protein  100 
 
 		 492 bp  48.1  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3814  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  100 
 
 		 735 bp  48.1  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.243988  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>