33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5274 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5274  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  490  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.357303  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5923  protein of unknown function DUF1239  82.08 
 
 		 240 aa  362  3e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2498  hypothetical protein  54.41 
 
 		 252 aa  223  3e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.238493  normal  0.312198 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2721  protein of unknown function DUF1239  54.41 
 
 		 252 aa  223  3e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.533074  normal  0.0594287 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2426  protein of unknown function DUF1239  51.61 
 
 		 253 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.289708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5468  hypothetical protein  55.03 
 
 		 239 aa  204  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.131274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0124  hypothetical protein  40.18 
 
 		 233 aa  144  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0169027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0178  hypothetical protein  40.58 
 
 		 258 aa  142  4e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0526761  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0156  protein of unknown function DUF1239  40.7 
 
 		 250 aa  139  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.535072 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0172  hypothetical protein  40 
 
 		 230 aa  135  4e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.980945 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0418  hypothetical protein  37.44 
 
 		 244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0658  hypothetical protein  36.92 
 
 		 243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.27994 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0175  hypothetical protein  36.22 
 
 		 256 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0048  protein of unknown function DUF1239  34.67 
 
 		 246 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0571  hypothetical protein  29.53 
 
 		 241 aa  116  3.9999999999999997e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0150  hypothetical protein  38.38 
 
 		 255 aa  113  3e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.211696  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0155  hypothetical protein  38.38 
 
 		 217 aa  112  5e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0167  hypothetical protein  36.36 
 
 		 237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0067  hypothetical protein  35.12 
 
 		 306 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.690329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0408  hypothetical protein  31.19 
 
 		 221 aa  103  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.47995  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0061  protein of unknown function DUF1239  30.35 
 
 		 221 aa  99  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0018  hypothetical protein  28.49 
 
 		 222 aa  95.9  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000157484 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0195  hypothetical protein  31.58 
 
 		 239 aa  90.1  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.296411  normal  0.846633 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0045  protein of unknown function DUF1239  29.95 
 
 		 221 aa  88.2  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.140568 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1370  hypothetical protein  27.04 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3670  hypothetical protein  28.24 
 
 		 235 aa  72.4  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3250  hypothetical protein  27.23 
 
 		 214 aa  72  0.000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0108  hypothetical protein  34.44 
 
 		 237 aa  67.4  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.760602 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1691  hypothetical protein  28.91 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.355489 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1671  hypothetical protein  28.14 
 
 		 246 aa  55.5  0.0000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.593803  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2904  hypothetical protein  25.52 
 
 		 231 aa  47  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.796329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4955  hypothetical protein  29.52 
 
 		 212 aa  45.8  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.588248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0013  hypothetical protein  24.22 
 
 		 274 aa  43.9  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>