More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1733 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1733  acetate kinase  100 
 
 
394 aa  810    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10210  acetate kinase  49.24 
 
 
398 aa  402  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000154307  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2708  acetate kinase  46.7 
 
 
397 aa  398  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0186296  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0731  acetate kinase  46.19 
 
 
396 aa  393  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0938  acetate kinase  48.36 
 
 
405 aa  394  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000904206  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0940  acetate kinase  49.49 
 
 
397 aa  389  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000914313  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3310  acetate kinase  47.07 
 
 
397 aa  390  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.865638  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1275  acetate kinase  47.07 
 
 
417 aa  387  1e-106  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.419483  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4773  acetate kinase  46.82 
 
 
397 aa  386  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4535  acetate kinase  46.82 
 
 
397 aa  386  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4371  acetate kinase  46.82 
 
 
397 aa  385  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4381  acetate kinase  46.82 
 
 
397 aa  386  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4746  acetate kinase  46.56 
 
 
397 aa  385  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4755  acetate kinase  46.56 
 
 
397 aa  385  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4888  acetate kinase  46.82 
 
 
397 aa  386  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0674  acetate kinase  48.62 
 
 
403 aa  386  1e-106  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2227  propionate kinase  45.92 
 
 
404 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.422778  normal  0.198158 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0650  acetate kinase  48.87 
 
 
403 aa  387  1e-106  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.276735  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4772  acetate kinase  46.82 
 
 
397 aa  386  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1802  acetate kinase  48.1 
 
 
400 aa  386  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1767  acetate kinase  48.1 
 
 
400 aa  386  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2234  propionate kinase  45.66 
 
 
404 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.36468  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4468  acetate kinase  46.56 
 
 
397 aa  384  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1170  acetate kinase  46.15 
 
 
397 aa  383  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.185662 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2280  propionate kinase  45.66 
 
 
404 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.257687  decreased coverage  0.00259617 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1695  acetate kinase  45.98 
 
 
398 aa  382  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0395303  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0489  acetate kinase  46.56 
 
 
397 aa  384  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3826  acetate kinase  46.85 
 
 
399 aa  384  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000259685  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2180  propionate kinase  45.66 
 
 
404 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2393  propionate kinase  45.66 
 
 
404 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1977  acetate kinase  45.48 
 
 
398 aa  379  1e-104  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1028  acetate kinase  46.58 
 
 
399 aa  379  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000413101  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1820  acetate kinase  46.72 
 
 
408 aa  377  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000179563  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0760  acetate kinase  45.23 
 
 
406 aa  375  1e-103  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0768  hypothetical protein  46.23 
 
 
397 aa  377  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000329459  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0933  acetate kinase  46.97 
 
 
397 aa  374  1e-102  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.666104  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1271  acetate kinase  47.1 
 
 
406 aa  374  1e-102  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2094  acetate kinase  46.27 
 
 
396 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.202146  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0560  acetate kinase  45.8 
 
 
398 aa  369  1e-101  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0732  acetate kinase  47.06 
 
 
401 aa  369  1e-101  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000188256  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2136  acetate kinase  44.47 
 
 
397 aa  365  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000219259  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1493  acetate kinase  46.04 
 
 
399 aa  366  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0874579  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1327  acetate kinase  46.43 
 
 
395 aa  367  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000237028  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2295  acetate kinase  47.06 
 
 
395 aa  365  1e-100  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0647  acetate kinase  46.37 
 
 
401 aa  364  1e-99  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3242  acetate kinase  45.25 
 
 
402 aa  363  3e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.697897  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0208  acetate kinase  46.23 
 
 
398 aa  363  4e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.777111  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0469  acetate kinase  43.34 
 
 
419 aa  363  4e-99  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0464018  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1249  acetate kinase  46.6 
 
 
397 aa  360  2e-98  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.407585  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0640  acetate kinase  46.27 
 
 
394 aa  358  9.999999999999999e-98  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0655  acetate kinase  43.04 
 
 
397 aa  357  2.9999999999999997e-97  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000414678  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1105  acetate kinase  44.62 
 
 
398 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000219398  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1269  acetate kinase  44.56 
 
 
399 aa  353  4e-96  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0812  acetate kinase  45.73 
 
 
399 aa  352  5e-96  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2303  acetate kinase  43.59 
 
 
398 aa  351  1e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0206  acetate kinase  46.23 
 
 
398 aa  351  1e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3528  acetate kinase  45.64 
 
 
394 aa  351  2e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.18649  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0621  acetate kinase  44.39 
 
 
397 aa  351  2e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000298382  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0343  acetate kinase  44 
 
 
402 aa  349  5e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.441374  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1731  acetate kinase  47.83 
 
 
401 aa  349  6e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000422881  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0270  acetate kinase  45.59 
 
 
396 aa  347  2e-94  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0797  acetate kinase  42.33 
 
 
406 aa  347  2e-94  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2294  acetate kinase  42.93 
 
 
395 aa  347  2e-94  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0168  acetate kinase  43.77 
 
 
397 aa  346  4e-94  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.14758  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1865  acetate kinase  43.97 
 
 
404 aa  346  4e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1729  acetate kinase  44.56 
 
 
404 aa  346  5e-94  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.247984  normal  0.031096 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1936  acetate kinase  43.18 
 
 
404 aa  346  5e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1081  acetate kinase  41.85 
 
 
398 aa  344  1e-93  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.347293 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06280  acetate kinase  44.05 
 
 
414 aa  344  1e-93  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.719404  normal  0.0196101 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1318  acetate kinase  46.15 
 
 
396 aa  344  2e-93  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1280  acetate kinase  42.62 
 
 
418 aa  344  2e-93  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0712  acetate kinase  45.64 
 
 
396 aa  342  5.999999999999999e-93  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1834  acetate kinase  43.59 
 
 
397 aa  342  7e-93  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000432075  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0296  acetate kinase  45 
 
 
403 aa  341  1e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2543  acetate kinase  44.47 
 
 
421 aa  338  7e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.60205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0077  acetate kinase  43.07 
 
 
397 aa  337  9.999999999999999e-92  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0788  acetate kinase  44.36 
 
 
396 aa  337  1.9999999999999998e-91  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.119296  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1049  acetate kinase  41.9 
 
 
401 aa  333  4e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1034  acetate kinase  42.54 
 
 
402 aa  330  2e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00869824  normal  0.811028 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0920  acetate kinase  40.61 
 
 
414 aa  329  6e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0557  acetate kinase  42.03 
 
 
420 aa  328  8e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1044  acetate kinase  42.5 
 
 
404 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3396  acetate kinase  42.46 
 
 
421 aa  325  8.000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2707  acetate kinase  42.17 
 
 
421 aa  323  4e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.405254  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2656  acetate kinase  41.43 
 
 
422 aa  322  5e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2590  acetate kinase  41.81 
 
 
398 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.871913  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1473  acetate kinase  40.2 
 
 
411 aa  321  9.999999999999999e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.206902 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1034  acetate kinase  41.41 
 
 
421 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000252602  hitchhiker  0.00000192642 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3887  acetate kinase  42.71 
 
 
404 aa  319  5e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3099  acetate kinase  40.61 
 
 
398 aa  318  1e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.492017  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1180  acetate kinase  40.1 
 
 
414 aa  317  3e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3504  acetate kinase  40.59 
 
 
405 aa  315  6e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3937  acetate kinase  41.25 
 
 
404 aa  314  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.484081  normal  0.188518 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2476  acetate kinase  42.64 
 
 
400 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0608  acetate kinase  39.95 
 
 
421 aa  315  9.999999999999999e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.387186  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1705  acetate kinase  42.03 
 
 
399 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0458561  hitchhiker  0.00694718 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2983  acetate kinase  39.29 
 
 
425 aa  313  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.37833  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1158  acetate kinase  40.76 
 
 
398 aa  313  1.9999999999999998e-84  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00331056  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2897  acetate kinase  39.29 
 
 
415 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3088  acetate kinase  39.29 
 
 
425 aa  313  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273293  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>