49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0026 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_0026  integral membrane protein  100 
 
 
247 aa  503  1e-141  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.667689  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1763  integral membrane protein  43.23 
 
 
200 aa  194  1e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00234926  normal  0.0438415 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0528  integral membrane protein  42.86 
 
 
244 aa  131  1.0000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1063  integral membrane protein  34.96 
 
 
269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000155002  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5527  integral membrane protein  36.2 
 
 
214 aa  124  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000108543  hitchhiker  0.0000000242358 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0978  hypothetical protein  34.5 
 
 
217 aa  122  4e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5427  hypothetical protein  34.8 
 
 
217 aa  121  8e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.176134  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5100  hypothetical protein  36.36 
 
 
217 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4984  hypothetical protein  34.82 
 
 
217 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0797538  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5002  hypothetical protein  34.65 
 
 
217 aa  116  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000139015  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5544  hypothetical protein  34.65 
 
 
217 aa  116  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000271519  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5152  hypothetical protein  34.65 
 
 
217 aa  116  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000285957  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5393  hypothetical protein  34.65 
 
 
217 aa  116  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.62077e-32 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2194  protein of unknown function DUF975  31.58 
 
 
216 aa  112  5e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4213  integral membrane protein  35.81 
 
 
217 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.395001 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5423  integral membrane protein  36.61 
 
 
214 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00180581  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3044  hypothetical protein  36.22 
 
 
249 aa  102  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000181685  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1989  hypothetical protein  28.51 
 
 
251 aa  100  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.193754  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3114  hypothetical protein  31.08 
 
 
252 aa  99.4  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.692009  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2675  hypothetical protein  31.08 
 
 
252 aa  95.1  9e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000159385 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2476  hypothetical protein  31.08 
 
 
252 aa  95.1  9e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.058907  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2658  hypothetical protein  31.08 
 
 
252 aa  95.1  9e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2008  hypothetical protein  34.71 
 
 
252 aa  92.4  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000169588  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23050  predicted integral membrane protein  40 
 
 
315 aa  91.3  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.980655  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5609  hypothetical protein  43.64 
 
 
252 aa  90.9  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4985  hypothetical protein  45.54 
 
 
263 aa  87.8  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0146407  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5394  hypothetical protein  45.36 
 
 
263 aa  87  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.58278e-35 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5153  hypothetical protein  45.36 
 
 
263 aa  87  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000141896  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5545  hypothetical protein  45.36 
 
 
263 aa  87  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000433429  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5003  group-specific protein  49.37 
 
 
263 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000242715  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3823  hypothetical protein  48.28 
 
 
266 aa  85.9  6e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5428  hypothetical protein  42.34 
 
 
264 aa  85.5  7e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.210935  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5480  hypothetical protein  44.33 
 
 
264 aa  85.1  9e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5101  hypothetical protein  44.71 
 
 
261 aa  84  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5424  group-specific protein  48.1 
 
 
261 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00185358  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5526  group-specific protein  43.56 
 
 
261 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000173284  hitchhiker  0.0000000104917 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0101  hypothetical protein  24.42 
 
 
246 aa  72.8  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000075579  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0105  hypothetical protein  24.42 
 
 
265 aa  70.1  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0395  hypothetical protein  35.29 
 
 
246 aa  69.3  0.00000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.607918  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3822  hypothetical protein  42.31 
 
 
116 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0213  hypothetical protein  39.53 
 
 
257 aa  61.2  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2383  protein of unknown function DUF975  44.44 
 
 
228 aa  53.1  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000186865  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0309  hypothetical protein  35 
 
 
224 aa  52.4  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0315  hypothetical protein  35 
 
 
224 aa  52.4  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.428114  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5479  integral membrane protein  29.03 
 
 
146 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0160  hypothetical protein  21.67 
 
 
229 aa  50.4  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.678676  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3083  protein of unknown function DUF975  32.71 
 
 
244 aa  49.3  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5478  hypothetical protein  56.41 
 
 
55 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0102  hypothetical protein  44 
 
 
290 aa  46.6  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000170522  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>