11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0208 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0208  hypothetical protein  100 
 
 
319 aa  589  1e-167  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.032861  hitchhiker  0.00393769 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05640  hypothetical protein  43.82 
 
 
328 aa  169  8e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2493  hypothetical protein  39.79 
 
 
337 aa  166  4e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.146629  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2348  hypothetical protein  40.64 
 
 
324 aa  160  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.403946  normal  0.0185029 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1546  hypothetical protein  42.42 
 
 
306 aa  159  5e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2490  hypothetical protein  41.32 
 
 
307 aa  153  5e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0031  hypothetical protein  34.63 
 
 
334 aa  130  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00551613  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5253  hypothetical protein  35.96 
 
 
339 aa  129  6e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.402527  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6446  hypothetical protein  34.18 
 
 
270 aa  92  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2696  Bile acid:sodium symporter  39.39 
 
 
404 aa  64.7  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.227415  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2423  hypothetical protein  28.9 
 
 
280 aa  48.1  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.546252  normal  0.0962448 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>