30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5122 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5122  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 
843 aa  1642    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0427193  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1614  2-alkenal reductase  44.25 
 
 
779 aa  105  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1519  2-alkenal reductase  44.25 
 
 
778 aa  105  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.431551  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2350  DnaK family protein  44.25 
 
 
782 aa  104  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.646727  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1523  2-alkenal reductase  40.17 
 
 
759 aa  97.1  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.250515  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2419  2-alkenal reductase  34.21 
 
 
771 aa  75.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0536577  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2331  2-alkenal reductase  33.33 
 
 
778 aa  73.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0761037  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1964  response regulator CheY  36.17 
 
 
244 aa  61.6  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0118313  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0037  serine/threonine protein kinase  28.91 
 
 
750 aa  58.9  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2361  hypothetical protein  37.35 
 
 
118 aa  58.2  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1598  type IV pilus assembly PilZ  38.1 
 
 
118 aa  58.2  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0005  PEGA domain protein  32.52 
 
 
684 aa  57.4  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1503  type IV pilus assembly PilZ  38.1 
 
 
118 aa  57.4  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2758  hypothetical protein  35.88 
 
 
546 aa  56.6  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1508  type IV pilus assembly PilZ  32.65 
 
 
131 aa  55.8  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4589  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  28.72 
 
 
239 aa  54.3  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.527063  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0214  hypothetical protein  32.59 
 
 
435 aa  52.8  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3408  type IV pilus assembly PilZ  33.05 
 
 
121 aa  52.4  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0420248  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3472  type IV pilus assembly PilZ  33.05 
 
 
121 aa  52.4  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.314761  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4722  type IV pilus assembly PilZ  34.21 
 
 
165 aa  52  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.992615  normal  0.959626 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3328  hypothetical protein  37.23 
 
 
121 aa  51.6  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.580011  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1562  PEGA domain protein  30.52 
 
 
533 aa  51.2  0.00009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00305043  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  46.27 
 
 
1281 aa  51.2  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  34.65 
 
 
963 aa  50.8  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3392  type IV pilus assembly PilZ  41.38 
 
 
121 aa  49.3  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0105  PEGA domain-containing protein  31.11 
 
 
426 aa  48.9  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  29.41 
 
 
433 aa  47  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2676  serine/threonine protein kinase  30.99 
 
 
769 aa  47  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.396186  normal  0.282843 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0111  PEGA domain protein  31.54 
 
 
416 aa  45.4  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1516  PEGA domain-containing protein  30.94 
 
 
432 aa  44.7  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>