31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4390 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4390  peptidase M56 BlaR1  100 
 
 
321 aa  597  1e-170  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.431329  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0291  hypothetical protein  31.12 
 
 
328 aa  82.4  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.497447  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4097  peptidase M56 BlaR1  36.07 
 
 
324 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486349  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1350  peptidase M56, BlaR1  29.56 
 
 
260 aa  70.9  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.205977  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00308  peptidase M56, BlaR1  23.66 
 
 
314 aa  68.2  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31050  hypothetical protein  37.59 
 
 
332 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000019921  unclonable  2.92536e-22 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2522  peptidase M56, BlaR1  25.79 
 
 
326 aa  64.7  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1645  peptidase M56 BlaR1  25.61 
 
 
270 aa  61.2  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.135549  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1791  hypothetical protein  26.22 
 
 
270 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1595  cell surface protein  26.22 
 
 
270 aa  59.3  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1646  hypothetical protein  26.22 
 
 
270 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000626927  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1827  hypothetical protein  26.22 
 
 
270 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1777  hypothetical protein  26.22 
 
 
270 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.617262  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0499  hypothetical protein  33.54 
 
 
282 aa  58.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.620209 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1903  hypothetical protein  28.23 
 
 
270 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000423406  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3553  hypothetical protein  28.1 
 
 
270 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.444632  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1850  hypothetical protein  27.42 
 
 
270 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00976816  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1625  cell surface protein  26.52 
 
 
270 aa  55.8  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000608951  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1807  peptidase M56 BlaR1  36.05 
 
 
328 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.817572  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2623  peptidase M56 BlaR1  26.61 
 
 
284 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0123908  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3493  peptidase M56 BlaR1  26.61 
 
 
284 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3768  hypothetical protein  32.47 
 
 
279 aa  54.3  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.198282  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1963  peptidase M56 BlaR1  43.75 
 
 
330 aa  52.8  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321633  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4387  peptidase M56, BlaR1  25.6 
 
 
326 aa  52.4  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.567369 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1878  peptidase M56 BlaR1  44.53 
 
 
330 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.101036  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0306  peptidase M48 Ste24p  35.57 
 
 
314 aa  51.2  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2000  peptidase M56, BlaR1  44.07 
 
 
330 aa  50.4  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2482  peptidase M48 Ste24p  40.34 
 
 
317 aa  50.4  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.16895 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3998  peptidase M56, BlaR1  21.56 
 
 
326 aa  48.5  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4281  hypothetical protein  30.83 
 
 
287 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0950  hypothetical protein  34.32 
 
 
308 aa  42.7  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>