25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1818 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1818  PEGA domain protein  100 
 
 
592 aa  1178    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0005  PEGA domain protein  24.83 
 
 
684 aa  55.1  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1237  PEGA domain protein  24.14 
 
 
613 aa  52.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3774  PEGA domain-containing protein  29.65 
 
 
317 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1431  PEGA domain-containing protein  25.74 
 
 
326 aa  52.8  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.075762  decreased coverage  0.0000710587 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1516  PEGA domain-containing protein  23.3 
 
 
432 aa  52  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3706  PEGA domain protein  28.66 
 
 
338 aa  50.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.425846  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2495  PEGA  24.87 
 
 
436 aa  49.3  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.441491  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3789  PEGA domain protein  28.76 
 
 
338 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000518163  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0086  PEGA domain-containing protein  29.13 
 
 
456 aa  48.5  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.943488  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1891  PEGA domain protein  26.05 
 
 
460 aa  48.9  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3342  hypothetical protein  31.76 
 
 
387 aa  48.1  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3648  TPR repeat-containing protein  28.67 
 
 
334 aa  47.8  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0366403  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2153  hypothetical protein  24.3 
 
 
581 aa  47.4  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0263882  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6451  Tetratricopeptide TPR_4  36.23 
 
 
282 aa  47.4  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1453  PEGA domain-containing protein  32.67 
 
 
276 aa  46.6  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0637995  normal  0.0741839 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0363  hypothetical protein  28.07 
 
 
298 aa  47  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2758  hypothetical protein  26.21 
 
 
546 aa  46.6  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1562  PEGA domain protein  30.1 
 
 
533 aa  45.8  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00305043  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0086  PEGA domain-containing protein  28.16 
 
 
456 aa  46.2  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00061684  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0037  serine/threonine protein kinase  24.85 
 
 
750 aa  46.2  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3131  peptidase C1A, papain  26.67 
 
 
1096 aa  45.8  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.34084  hitchhiker  0.000341484 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0951  PEGA domain-containing protein  27.73 
 
 
409 aa  45.4  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.919574  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0214  hypothetical protein  24.18 
 
 
435 aa  44.3  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2314  Protein of unknown function DUF1628  38.89 
 
 
527 aa  43.9  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.561661  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>