More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_2117 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_2117  GTP cyclohydrolase I  100 
 
 
203 aa  419  1e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19630  GTP cyclohydrolase I  66.67 
 
 
186 aa  246  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1690  GTP cyclohydrolase I  66.67 
 
 
186 aa  247  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1299  GTP cyclohydrolase  64.04 
 
 
185 aa  243  2e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1020  GTP cyclohydrolase I  65.32 
 
 
187 aa  242  3e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3289  GTP cyclohydrolase  64.94 
 
 
186 aa  241  4e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1182  GTP cyclohydrolase I  64.16 
 
 
187 aa  239  3e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1799  GTP cyclohydrolase I  65.12 
 
 
198 aa  236  1e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.982751  hitchhiker  6.26036e-06 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3598  GTP cyclohydrolase I  62.01 
 
 
181 aa  236  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.812952  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0891  GTP cyclohydrolase I  63.22 
 
 
186 aa  236  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42850  GTP cyclohydrolase I  62.01 
 
 
181 aa  236  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2021  GTP cyclohydrolase I  61.71 
 
 
186 aa  233  1e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.780834  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1153  GTP cyclohydrolase I  60.34 
 
 
184 aa  233  1e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0863  GTP cyclohydrolase I  60.34 
 
 
188 aa  233  2e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1715  GTP cyclohydrolase I  62.01 
 
 
181 aa  233  2e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23690  GTP cyclohydrolase I  60.89 
 
 
181 aa  232  4e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0310829  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3207  GTP cyclohydrolase I  61.71 
 
 
186 aa  231  8e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.574177  normal  0.0542023 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1845  GTP cyclohydrolase I  61.45 
 
 
181 aa  231  8e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.350099 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2512  GTP cyclohydrolase I  61.14 
 
 
186 aa  229  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2744  GTP cyclohydrolase I  60.89 
 
 
181 aa  229  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0752455  normal  0.719118 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3782  GTP cyclohydrolase I  62.21 
 
 
189 aa  229  2e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2035  GTP cyclohydrolase I  60.89 
 
 
181 aa  229  3e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31903  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1390  GTP cyclohydrolase I  55.56 
 
 
213 aa  227  7e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0548  GTP cyclohydrolase I  60.92 
 
 
184 aa  227  1e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2294  GTP cyclohydrolase I  59.65 
 
 
184 aa  226  2e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2678  GTP cyclohydrolase I  60.11 
 
 
180 aa  225  3e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.508198  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1431  GTP cyclohydrolase I  59.22 
 
 
181 aa  224  5e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.33903  normal  0.426591 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1401  GTP cyclohydrolase I  62.01 
 
 
181 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.154537  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1823  GTP cyclohydrolase I  61.54 
 
 
190 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00310183  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1670  GTP cyclohydrolase I  56.04 
 
 
185 aa  223  2e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3888  GTP cyclohydrolase I  62.01 
 
 
181 aa  222  3e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.299741 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0939  GTP cyclohydrolase I  57.71 
 
 
239 aa  219  2e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0912  GTP cyclohydrolase I  57.71 
 
 
239 aa  219  2e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3350  GTP cyclohydrolase I  57.14 
 
 
247 aa  218  4e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0206  GTP cyclohydrolase I  56.74 
 
 
202 aa  218  6e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04920  GTP cyclohydrolase I, putative  55.62 
 
 
435 aa  217  8e-56  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1496  GTP cyclohydrolase I  56.11 
 
 
190 aa  216  1e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2683  GTP cyclohydrolase I  58.43 
 
 
179 aa  217  1e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1393  GTP cyclohydrolase I  57.95 
 
 
200 aa  217  1e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1778  GTP cyclohydrolase I  56.42 
 
 
190 aa  216  2e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2814  GTP cyclohydrolase I  58.43 
 
 
179 aa  215  3e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2930  GTP cyclohydrolase I  57.54 
 
 
182 aa  215  4e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1588  GTP cyclohydrolase I  50.51 
 
 
223 aa  213  1e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1597  GTP cyclohydrolase I  55.56 
 
 
213 aa  213  2e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.874876  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0890  GTP cyclohydrolase I  53.09 
 
 
214 aa  211  4e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.273347  normal  0.916518 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0864  GTP cyclohydrolase I  53.09 
 
 
214 aa  211  4e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4616  GTP cyclohydrolase I  53.54 
 
 
212 aa  211  5e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0762321  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0402  GTP cyclohydrolase I  56.57 
 
 
235 aa  211  5e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.160762  normal  0.817545 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0955  GTP cyclohydrolase I  57.4 
 
 
201 aa  211  6e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  9.98174e-12  hitchhiker  0.00336193 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2469  GTP cyclohydrolase I  55.87 
 
 
181 aa  211  6e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1694  GTP cyclohydrolase I  52.43 
 
 
195 aa  211  7e-54  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2537  GTP cyclohydrolase I  51.53 
 
 
235 aa  210  9e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21868  predicted protein  55.62 
 
 
186 aa  210  1e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.213311  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1949  GTP cyclohydrolase I  56 
 
 
216 aa  210  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.414952 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2093  GTP cyclohydrolase  54.07 
 
 
179 aa  209  2e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.101734  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3367  GTP cyclohydrolase I  53.71 
 
 
235 aa  208  5e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501269  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0859  GTP cyclohydrolase I  53.59 
 
 
226 aa  208  5e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.323599 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3847  GTP cyclohydrolase I  55.43 
 
 
218 aa  207  8e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0754  GTP cyclohydrolase I  48.98 
 
 
216 aa  207  1e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0859  GTP cyclohydrolase I  50 
 
 
219 aa  206  2e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.765891  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1858  GTP cyclohydrolase I  52.49 
 
 
218 aa  206  2e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0041  GTP cyclohydrolase I  53.51 
 
 
194 aa  206  2e-52  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2086  GTP cyclohydrolase I  54.49 
 
 
179 aa  205  4e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2932  GTP cyclohydrolase I  50.26 
 
 
201 aa  204  5e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0900198 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0372  GTP cyclohydrolase I  51.11 
 
 
223 aa  205  5e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.884596  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34960  GTP cyclohydrolase I (GTP-CH-I)  51.32 
 
 
270 aa  204  6e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0204  GTP cyclohydrolase I  51.96 
 
 
190 aa  204  6e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0225  GTP cyclohydrolase I  51.4 
 
 
190 aa  204  8e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0976  GTP cyclohydrolase I  48.92 
 
 
219 aa  203  1e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.49412  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0017  GTP cyclohydrolase I  54.7 
 
 
224 aa  203  1e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0187  GTP cyclohydrolase I  51.4 
 
 
190 aa  204  1e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08188  hypothetical protein similar to GTP cyclohydrolase I (Broad)  49.21 
 
 
329 aa  203  2e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1425  GTP cyclohydrolase I  54.6 
 
 
203 aa  203  2e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.899017  normal  0.42931 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1044  GTP cyclohydrolase  54.02 
 
 
203 aa  202  3e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.663333 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1481  GTP cyclohydrolase I  51.12 
 
 
190 aa  199  2e-50  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0969  GTP cyclohydrolase  50.56 
 
 
243 aa  199  3e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0257975  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0301  GTP cyclohydrolase I  53.55 
 
 
225 aa  198  4e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000150261  normal  0.11188 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2208  GTP cyclohydrolase  52.22 
 
 
199 aa  196  1e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0579312  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0705  GTP cyclohydrolase I  53.33 
 
 
226 aa  194  6e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0131  GTP cyclohydrolase I  53.14 
 
 
206 aa  194  6e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2156  GTP cyclohydrolase I  50.27 
 
 
193 aa  194  1e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4149  GTP cyclohydrolase I  50.27 
 
 
210 aa  192  3e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0266568 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6956  GTP cyclohydrolase I  53.85 
 
 
195 aa  192  4e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.837765  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0625  GTP cyclohydrolase I  51.72 
 
 
193 aa  192  4e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.497078 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0445  GTP cyclohydrolase I  51.89 
 
 
205 aa  189  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0193  GTP cyclohydrolase I  51.93 
 
 
220 aa  189  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9174  GTP cyclohydrolase I  53.19 
 
 
193 aa  188  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0990  GTP cyclohydrolase I  49.75 
 
 
203 aa  187  7e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1041  GTP cyclohydrolase I  48.02 
 
 
213 aa  187  1e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.25698  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3446  GTP cyclohydrolase I  53.8 
 
 
194 aa  187  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0793851  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1075  GTP cyclohydrolase I  48.02 
 
 
213 aa  186  3e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.76008  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08636  GTP cyclohydrolase I  49.16 
 
 
199 aa  185  3e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0871  GTP cyclohydrolase I  49.24 
 
 
203 aa  185  4e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0836  GTP cyclohydrolase I  49.73 
 
 
214 aa  183  1e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0812961  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4504  GTP cyclohydrolase I  51.67 
 
 
210 aa  183  2e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4971  GTP cyclohydrolase I  49.26 
 
 
199 aa  183  2e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.853969 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0466  GTP cyclohydrolase I  50.27 
 
 
188 aa  183  2e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2894  GTP cyclohydrolase I  48.19 
 
 
207 aa  182  3e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0205  GTP cyclohydrolase I  51.37 
 
 
200 aa  181  5e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.224052 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1116  GTP cyclohydrolase I  46.45 
 
 
187 aa  181  6e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>