298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_R0054 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_R0054  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0046  tRNA-Gly  97.33 
 
 		 75 bp  133  6e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0040  tRNA-Gly  97.33 
 
 		 75 bp  133  6e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0471615  normal  0.863144 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0044  tRNA-Gly  96 
 
 		 75 bp  125  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.69312  normal  0.302799 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0070  tRNA-Gly  96 
 
 		 75 bp  125  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0015  tRNA-Gly  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.409791  hitchhiker  0.00133566 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0061  tRNA-Gly  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.638683  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0060  tRNA-Gly  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.312952  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt08  tRNA-Gly  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.711822  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt09  tRNA-Gly  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.745225  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0052  tRNA-Gly  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.165358 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0063  tRNA-Gly  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0060  tRNA-Gly  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.18005  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0024  tRNA-Gly  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.113773  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0054  tRNA-Gly  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.290496  normal  0.747562 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0037  tRNA-Gly  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0004  tRNA-Gly  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.54255  normal  0.0153905 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0055  tRNA-Gly  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.9646 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0052  tRNA-Gly  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0014  tRNA-Gly  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.854137  normal  0.0928806 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0959  tRNA-Gly  94.67 
 
 		 77 bp  117  3.9999999999999997e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0060  tRNA-Gly  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.766632 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0005  tRNA-Gly  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.118248  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0045  tRNA-Gly  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.471231 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0059  tRNA-Gly  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.07343  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0058  tRNA-Gly  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0053  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6044  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0005  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0004  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.679327 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0042  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0839  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.343418  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0046  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4576  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0007  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0015  tRNA-Gly  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0001    92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0451223 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0002  tRNA-Gly  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.385644 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0001  tRNA-Gly  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0055  tRNA-Gly  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.138155  hitchhiker  0.00896758 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA4  tRNA-Gly  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.489059 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0016  tRNA-Gly  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0054  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0271354  normal  0.903317 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0008  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.142347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0010  tRNA-Gly  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0010  tRNA-Gly  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0015  tRNA-Ser  98 
 
 		 67 bp  91.7  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0082796  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  96.23 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.36527  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0050  tRNA-Gly  91.3 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00165947  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0044  tRNA-Gly  96.23 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00255441  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0072  tRNA-Gly  96.23 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.827056  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0073  tRNA-Gly  96.23 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.611784  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0030  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.121021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0031  tRNA-Gly  96.08 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0005  tRNA-Gly  96.08 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000151844  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0033  tRNA-Gly  96 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0406258  normal  0.16961 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0037  tRNA-Gly  96 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0254902  normal  0.171485 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0069  tRNA-Gly  96 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.494624  hitchhiker  0.00109102 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0017  tRNA-Gly  96 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0117925 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0031  tRNA-Gly  96 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0675454  normal  0.168417 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0028  tRNA-Gly  96 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.706726  normal  0.167752 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0035  tRNA-Gly  96 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0213758  normal  0.172215 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0025  tRNA-Gly  96 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.404716  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0855  tRNA-Gly  96 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.627024  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0017  tRNA-Gly  96 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000592681  hitchhiker  0.00000010486 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0022  tRNA-Gly  89.86 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0110394  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0858  tRNA-Gly  89.86 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000473646  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5692  tRNA-Gly  89.86 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000815905  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5728  tRNA-Gly  89.86 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000760665  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Gly-3  tRNA-Gly  94.34 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.82132  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5030  tRNA-Gly  89.86 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000514384  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gly-5  tRNA-Gly  89.86 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000174679  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gly-8  tRNA-Gly  89.86 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00746864  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  89.86 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gly-4  tRNA-Gly  89.86 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000472811  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gly-5  tRNA-Gly  89.86 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.34208  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gly-9  tRNA-Gly  89.86 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0690974  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  89.86 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000170652  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gly-3  tRNA-Gly  89.86 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000219047  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gly-7  tRNA-Gly  89.86 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0273307  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0028  tRNA-Gly  94.34 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.433481  normal  0.466553 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0044  tRNA-Gly  94.34 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0022  tRNA-Gly  89.86 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00428299  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1755  tRNA-Gly  94.34 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2165  tRNA-Gly  94.34 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5730  tRNA-Gly  89.86 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000092576  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5815  tRNA-Gly  89.86 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000650347  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gly-3  tRNA-Gly  89.86 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000594127  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gly-5  tRNA-Gly  89.86 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000138303  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gly-8  tRNA-Gly  89.86 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000064552  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0102  tRNA-Gly  89.86 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000562923  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0139  tRNA-Gly  89.86 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00889637  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2245  tRNA-Gly  94.34 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0241  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5718  tRNA-Gly  89.86 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00273939  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0086  tRNA-Gly  89.86 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000534948  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1730  tRNA-Gly  94.34 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.873105  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5637  tRNA-Gly  89.86 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116083  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2253  tRNA-Gly  94.34 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.986427  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0099  tRNA-Gly  89.86 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00152408  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>