14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0005 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0005  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  100 
 
 		 920 aa  1882    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000417696 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0004  triacylglycerol lipase  60.51 
 
 		 392 aa  479  1e-134  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.00000000112328 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  34.15 
 
 		 1888 aa  131  5.0000000000000004e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0423  PA domain protein  50 
 
 		 2042 aa  66.6  0.000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0201874 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1115  hypothetical protein  33.61 
 
 		 500 aa  51.2  0.00009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.506809  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32459  predicted protein  36.71 
 
 		 848 aa  50.4  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1915  hypothetical protein  28.44 
 
 		 191 aa  48.9  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0180761  normal  0.627986 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0800  hypothetical protein  39.74 
 
 		 275 aa  48.5  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6888  response regulator receiver protein  40.79 
 
 		 875 aa  46.6  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.3668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2371  hypothetical protein  28.48 
 
 		 510 aa  45.8  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4996  hypothetical protein  28.12 
 
 		 302 aa  45.4  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50390  probable cell surface glycoprotein  48.54 
 
 		 623 aa  45.4  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0151497  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1117  hypothetical protein  30.08 
 
 		 163 aa  45.1  0.006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.152735  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1194  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  30.37 
 
 		 928 aa  44.7  0.008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>