18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1115 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE1115  hypothetical protein  100 
 
 
500 aa  1011    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.506809  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1117  hypothetical protein  91.33 
 
 
163 aa  276  5e-73  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.152735  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1170  methyltransferase small  37.67 
 
 
1197 aa  77.4  0.0000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0959  hypothetical protein  41.22 
 
 
1079 aa  64.3  0.000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.36897  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1194  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  27.6 
 
 
928 aa  52.8  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2371  hypothetical protein  23.93 
 
 
510 aa  52.8  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0005  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  33.61 
 
 
920 aa  51.2  0.00005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000417696 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1960  hypothetical protein  28.87 
 
 
204 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  33.33 
 
 
2689 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  26.61 
 
 
1550 aa  48.9  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0004  triacylglycerol lipase  30.51 
 
 
392 aa  48.1  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.00000000112328 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1014  hypothetical protein  26.61 
 
 
798 aa  47  0.0008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0341  hypothetical protein  26.73 
 
 
853 aa  45.4  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.118542 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4993  lipase family protein  30.36 
 
 
240 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.144902  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  24.6 
 
 
2145 aa  44.3  0.005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2717  hypothetical protein  29.63 
 
 
498 aa  43.9  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00657711  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0244  lipase family protein  29.46 
 
 
240 aa  43.5  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00506661  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05456  lipase family  33.33 
 
 
312 aa  43.5  0.01  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>