More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2704 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_2704  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
252 aa  524  1e-148  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1515  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  85.32 
 
 
252 aa  436  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0436137  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2561  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  85.32 
 
 
252 aa  436  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000775273  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2505  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  82.14 
 
 
252 aa  427  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1718  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  82.54 
 
 
252 aa  426  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.57021  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1849  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  82.54 
 
 
252 aa  426  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2743  phosphate ABC transporter permease  66.41 
 
 
259 aa  351  7e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00299446  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0469  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  67.45 
 
 
254 aa  349  2e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0572  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  63.89 
 
 
251 aa  347  1e-94  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0590  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  63.57 
 
 
258 aa  345  5e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2521  phosphate ABC transporter ATPase subunit  64.29 
 
 
273 aa  345  5e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0748442  normal  0.186434 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1416  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  65.87 
 
 
251 aa  345  5e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00175163  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0821  phosphate ABC transporter permease  65.48 
 
 
286 aa  345  6e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4579  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  61.75 
 
 
272 aa  343  2e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.723553  normal  0.288742 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1013  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  63.49 
 
 
251 aa  341  8e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1137  phosphate transporter ATP-binding protein  63.75 
 
 
285 aa  340  1e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.326059  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0114  phosphate ABC transporter permease  63.05 
 
 
252 aa  340  2e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0182  phosphate transporter ATP-binding protein  64.4 
 
 
277 aa  339  2e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0355  phosphate transporter ATP-binding protein  62.79 
 
 
258 aa  338  5.9999999999999996e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.584479  normal  0.0138641 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0621  phosphate transporter ATP-binding protein  62.5 
 
 
261 aa  338  7e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0093  phosphate transporter ATP-binding protein  65.02 
 
 
284 aa  338  7e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1781  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  62.65 
 
 
258 aa  337  8e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0483  phosphate ABC transporter ATPase subunit  63.45 
 
 
277 aa  337  9e-92  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2831  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  62.96 
 
 
252 aa  337  9e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1156  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  62 
 
 
255 aa  337  9e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.206732  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1439  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  62 
 
 
255 aa  337  9e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0954  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  64.61 
 
 
276 aa  337  9.999999999999999e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.222469  normal  0.101255 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2104  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  63.86 
 
 
252 aa  337  9.999999999999999e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4003  phosphate transporter ATP-binding protein  63.05 
 
 
262 aa  337  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1259  phosphate transporter ATP-binding protein  62.95 
 
 
265 aa  337  9.999999999999999e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1536  phosphate transporter ATP-binding protein  62.3 
 
 
264 aa  337  9.999999999999999e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.424595  normal  0.394597 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8334  phosphate ABC transporter permease  60.47 
 
 
258 aa  337  9.999999999999999e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37650  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  62.55 
 
 
259 aa  337  9.999999999999999e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0806666 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4145  phosphate transporter ATP-binding protein  63.05 
 
 
262 aa  336  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0586  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  62.99 
 
 
272 aa  336  1.9999999999999998e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.518906 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3160  phosphate transporter ATP-binding protein  62.1 
 
 
258 aa  336  1.9999999999999998e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0881  phosphate transporter ATP-binding protein  64.54 
 
 
255 aa  336  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0906767 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1569  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  61.9 
 
 
251 aa  335  2.9999999999999997e-91  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0477  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  62 
 
 
252 aa  335  2.9999999999999997e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1359  phosphate transporter ATP-binding protein  61.75 
 
 
272 aa  335  2.9999999999999997e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0675287  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4381  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  64.09 
 
 
259 aa  336  2.9999999999999997e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21550  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  63.39 
 
 
253 aa  335  3.9999999999999995e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01640  PstB  62.16 
 
 
259 aa  335  3.9999999999999995e-91  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1992  phosphate transporter ATP-binding protein  63.05 
 
 
249 aa  335  3.9999999999999995e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1503  phosphate transporter ATP-binding protein  62.4 
 
 
272 aa  335  5e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.529486  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1700  phosphate transporter ATP-binding protein  63.2 
 
 
272 aa  335  5e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2386  phosphate transporter ATP-binding protein  64.8 
 
 
253 aa  335  5e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00455032  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48570  phosphate transporter ATP-binding protein  64.52 
 
 
277 aa  335  5.999999999999999e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.253106  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4119  phosphate transporter ATP-binding protein  62.65 
 
 
262 aa  334  5.999999999999999e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2203  phosphate transporter ATP-binding protein  60.4 
 
 
260 aa  335  5.999999999999999e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.574176  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0653  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  61.9 
 
 
282 aa  334  7e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.316011 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2396  ABC phosphate transporter, ATPase subunit  63.45 
 
 
283 aa  334  7e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.874884  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0891  phosphate transporter ATP-binding protein  62.4 
 
 
274 aa  334  7e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0365  phosphate transporter ATP-binding protein  61 
 
 
259 aa  334  7.999999999999999e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3638  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  63.86 
 
 
267 aa  334  9e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000916154  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31840  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  60.23 
 
 
259 aa  333  1e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1483  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  62.96 
 
 
249 aa  333  1e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00537874  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3166  phosphate transporter ATP-binding protein  62.4 
 
 
272 aa  333  1e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2650  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  63.31 
 
 
285 aa  334  1e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.567129  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2079  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  60.62 
 
 
259 aa  333  1e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0423  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  60.71 
 
 
251 aa  333  1e-90  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2582  phosphate transporter ATP-binding protein  61.75 
 
 
272 aa  333  1e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2890  phosphate transporter ATP-binding protein  63.45 
 
 
252 aa  334  1e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0597569 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1436  phosphate transporter ATP-binding protein  61.75 
 
 
272 aa  333  2e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4262  phosphate transporter ATP-binding protein  61.24 
 
 
258 aa  333  2e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1489  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  59.92 
 
 
260 aa  333  2e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0486  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  61.51 
 
 
251 aa  333  2e-90  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4915  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  60.16 
 
 
260 aa  333  2e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.508237  normal  0.341234 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70810  phosphate transporter ATP-binding protein  63.35 
 
 
277 aa  333  2e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.356471 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0622  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  61.04 
 
 
269 aa  332  2e-90  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.970932  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6145  phosphate transporter ATP-binding protein  63.35 
 
 
277 aa  333  2e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2629  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  60 
 
 
260 aa  333  2e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.119732  normal  0.10241 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2369  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  59.92 
 
 
260 aa  333  2e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004378  phosphate transport ATP-binding protein PstB  62.4 
 
 
272 aa  333  2e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.706998  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5373  phosphate transporter ATP-binding protein  64.52 
 
 
277 aa  332  3e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.417045 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0350  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  61.51 
 
 
251 aa  332  3e-90  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000161831 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4978  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  62.55 
 
 
259 aa  332  3e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1410  phosphate transporter ATP-binding protein  62 
 
 
272 aa  332  3e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.261593  normal  0.0224304 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1568  phosphate transporter ATP-binding protein  60.96 
 
 
272 aa  332  4e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.120557  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4920  phosphate transporter ATP-binding protein  62.25 
 
 
275 aa  332  4e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.506329 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1535  phosphate transporter ATP-binding protein  60.96 
 
 
272 aa  332  4e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.172939  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0421  phosphate transporter ATP-binding protein  62.65 
 
 
260 aa  332  4e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.846145 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2816  phosphate transporter ATP-binding protein  60.96 
 
 
272 aa  332  4e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1540  phosphate transporter ATP-binding protein  60.96 
 
 
272 aa  332  4e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.794037  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4000  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  62.26 
 
 
265 aa  331  5e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5612  phosphate transporter ATP-binding protein  64.11 
 
 
277 aa  332  5e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.8399  normal  0.188753 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0148  phosphate transporter ATP-binding protein  64.11 
 
 
277 aa  331  5e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1928  phosphate transporter ATP-binding protein  62.7 
 
 
251 aa  331  6e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333841  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2983  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  60.24 
 
 
253 aa  331  6e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3291  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  61.09 
 
 
264 aa  331  6e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2832  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  61.09 
 
 
264 aa  331  6e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.814332 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2558  phosphate transporter ATP-binding protein  61.35 
 
 
272 aa  331  6e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.897125  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2625  phosphate transporter ATP-binding protein  61.35 
 
 
272 aa  331  6e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0233475  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0205  phosphate transporter ATP-binding protein  60.23 
 
 
259 aa  331  6e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2732  phosphate transporter ATP-binding protein  61.35 
 
 
272 aa  331  6e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2972  ABC phosphate transporter, ATPase subunit  61.66 
 
 
253 aa  331  7.000000000000001e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0509  phosphate transporter ATP-binding protein  62.25 
 
 
273 aa  330  9e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.518327 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0397  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  62.8 
 
 
284 aa  330  9e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5234  phosphate transporter ATP-binding protein  64.11 
 
 
277 aa  330  1e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.634569  normal  0.16068 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0333  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  61.87 
 
 
306 aa  330  1e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0100959 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>