18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0357 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0357  putative lipoprotein  100 
 
 		 219 aa  440  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000581024  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3130  putative lipoprotein  71.95 
 
 		 220 aa  312  2.9999999999999996e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1808  putative lipoprotein  59.55 
 
 		 220 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000291865  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3871  lipoprotein, putative  56.39 
 
 		 225 aa  216  2e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.873664 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3787  lipoprotein, putative  56.39 
 
 		 226 aa  216  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0271  putative lipoprotein  55.2 
 
 		 220 aa  200  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0868  hypothetical protein  28.86 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2452  hypothetical protein  27.63 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.289718  normal  0.470045 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0594  hypothetical protein  29.87 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  3.40048e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0763  hypothetical protein  27.27 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2674  hypothetical protein  30.56 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.681359  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0799  hypothetical protein  26.82 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2386  hypothetical protein  33.33 
 
 		 125 aa  53.9  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117772  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2218  hypothetical protein  31.01 
 
 		 140 aa  52.4  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2331  hypothetical protein  36.7 
 
 		 123 aa  50.4  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.472669  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1853  hypothetical protein  33.55 
 
 		 138 aa  49.3  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2830  hypothetical protein  29.93 
 
 		 142 aa  45.8  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4040  hypothetical protein  30.56 
 
 		 126 aa  43.9  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.344476  normal  0.247596 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>