121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0302 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_0302  MOSC  100 
 
 
146 aa  296  6e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3145  MOSC domain-containing protein  87.41 
 
 
144 aa  260  4e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0303  MOSC domain-containing protein  80.85 
 
 
147 aa  245  2e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.968814  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2418  MOSC domain-containing protein  79.02 
 
 
143 aa  240  5e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2094  MOSC  80.14 
 
 
152 aa  235  1e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1160  MOSC domain containing protein  79.43 
 
 
262 aa  234  4e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.242094  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2271  MOSC domain containing protein  76.92 
 
 
143 aa  233  8e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1952  MOSC domain containing protein  76.22 
 
 
143 aa  231  2.0000000000000002e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0913  MOSC domain containing protein  76.26 
 
 
143 aa  230  4.0000000000000004e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3570  MOSC domain-containing protein  78.1 
 
 
145 aa  229  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2930  MOSC domain containing protein  67.83 
 
 
143 aa  214  4e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1355  MOSC domain containing protein  66.43 
 
 
143 aa  211  2.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0782676  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1402  MOSC domain containing protein  68.53 
 
 
144 aa  198  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2266  MOSC domain-containing protein  69.5 
 
 
145 aa  197  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2133  MOSC  65.96 
 
 
145 aa  190  6e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1266  MOSC domain containing protein  63.38 
 
 
154 aa  188  2e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.509209  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1967  hypothetical protein  62.5 
 
 
153 aa  185  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000022743  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0426  MOSC domain containing protein  63.12 
 
 
158 aa  183  5e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0198409  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0414  MOSC domain-containing protein  58.45 
 
 
144 aa  180  6e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.761963  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1394  MOSC domain-containing protein  60 
 
 
146 aa  175  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1892  MOSC domain-containing protein  59.72 
 
 
147 aa  174  4e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00267695  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0750  MOSC domain-containing protein  57.45 
 
 
144 aa  173  8e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0205  MOSC domain containing protein  57.45 
 
 
147 aa  172  9.999999999999999e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0214556  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01830  hypothetical protein  58.5 
 
 
177 aa  171  2.9999999999999996e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1438  MOSC domain containing protein  61.15 
 
 
146 aa  170  5e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2235  MOSC domain-containing protein  61.97 
 
 
144 aa  169  1e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0255  MOSC domain containing protein  58.62 
 
 
178 aa  169  2e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0491  MOSC domain containing protein  56.2 
 
 
154 aa  168  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0514141  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1481  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  52.86 
 
 
310 aa  167  3e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.068215  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2403  MOSC domain-containing protein  57.34 
 
 
149 aa  166  1e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0524087  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1759  MOSC domain-containing protein  54.61 
 
 
142 aa  164  4e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188575  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0259  MOSC domain containing protein  58.99 
 
 
162 aa  163  6.9999999999999995e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.215992 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2044  MOSC domain-containing protein  53.9 
 
 
142 aa  163  6.9999999999999995e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1690  MOSC domain containing protein  50.71 
 
 
143 aa  160  7e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10950  hypothetical protein  51.39 
 
 
180 aa  158  3e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00746491  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2367  MOSC domain containing protein  57.14 
 
 
156 aa  157  4e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1340  MOSC domain containing protein  57.58 
 
 
146 aa  152  2e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2836  MOSC domain-containing protein  55.71 
 
 
165 aa  151  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.654473  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1545  hypothetical protein  57.89 
 
 
146 aa  149  2e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.695091  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0671  MOSC domain containing protein  56.12 
 
 
144 aa  147  5e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2768  MOSC domain containing protein  54.23 
 
 
144 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0733  MOSC domain-containing protein  57.58 
 
 
152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0830  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC/MOSC-domain-containing protein  50.34 
 
 
308 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0410  hypothetical protein  53.96 
 
 
148 aa  144  6e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.966681  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0326  MOSC domain containing protein  53.85 
 
 
149 aa  138  1.9999999999999998e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1602  MOSC domain containing protein  45.7 
 
 
154 aa  136  7.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1399  MOSC domain-containing protein  40.82 
 
 
152 aa  114  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.092789  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0371  MOSC domain-containing protein  44.83 
 
 
144 aa  111  3e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1858  MOSC domain-containing protein  41.67 
 
 
145 aa  106  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0654  MOSC domain-containing protein  36.11 
 
 
139 aa  90.1  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000905439  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0061  MOSC domain-containing protein  32.93 
 
 
201 aa  79.3  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.489415 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0397  hypothetical protein  40.82 
 
 
145 aa  76.6  0.00000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5597  hypothetical protein  34.15 
 
 
179 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.963565  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2483  hypothetical protein  35.71 
 
 
179 aa  71.6  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0431097  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3339  MOSC domain-containing protein  39.13 
 
 
200 aa  70.9  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1607  MOSC  32.12 
 
 
204 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.401865  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2298  MOSC domain containing protein  33.1 
 
 
142 aa  66.2  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0430  MOSC domain-containing protein  32.28 
 
 
151 aa  62.8  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.458415 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2179  MOSC domain containing protein  36.36 
 
 
184 aa  61.6  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2674  MOSC domain-containing protein  35.11 
 
 
148 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.216386  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2719  MOSC domain-containing protein  35.11 
 
 
148 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.005456  normal  0.132425 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2705  MOSC domain-containing protein  35.11 
 
 
148 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.705945  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0785  MOSC domain containing protein  33.58 
 
 
190 aa  58.5  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4234  MOSC domain-containing protein  29.94 
 
 
180 aa  57.8  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.37433  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0387  MOSC domain containing protein  28.8 
 
 
153 aa  57.4  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3793  MOSC domain containing protein  29.22 
 
 
159 aa  57  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00578414 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2005  MOSC domain containing protein  31.25 
 
 
180 aa  56.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.695737 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4111  putative sulferase  31.82 
 
 
174 aa  56.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.641133  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08310  hypothetical protein  30.71 
 
 
214 aa  55.5  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0821937  normal  0.516945 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7200  MOSC domain-containing protein  32.64 
 
 
167 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.313237 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0530  alpha amylase domain-containing protein  34.81 
 
 
144 aa  54.3  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4395  MOSC domain containing protein  30.25 
 
 
209 aa  54.3  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.772534  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4075  MOSC domain containing protein  28.12 
 
 
205 aa  54.3  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0155  hypothetical protein  29.87 
 
 
205 aa  53.5  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1459  MOSC domain-containing protein  33.1 
 
 
181 aa  52.8  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550389  normal  0.126815 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0779  MOSC domain-containing protein  29.93 
 
 
209 aa  52.8  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.161048  normal  0.0150919 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4068  hypothetical protein  33.33 
 
 
181 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0258336  normal  0.178916 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9197  hypothetical protein  33.07 
 
 
223 aa  51.6  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.91426 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5172  hypothetical protein  35.48 
 
 
146 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.634719  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2475  MOSC domain containing protein  29.37 
 
 
215 aa  50.8  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1893  MOSC domain-containing protein  30.82 
 
 
218 aa  50.4  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.552866  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1774  MOSC domain-containing protein  30.5 
 
 
209 aa  49.7  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000110547  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64470  hypothetical protein  37.65 
 
 
98 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1047  MOSC domain-containing protein  33.33 
 
 
219 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6438  MOSC domain containing protein  32.88 
 
 
586 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3658  MOSC domain containing protein  29.77 
 
 
217 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.192632 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1157  hypothetical protein  37.8 
 
 
241 aa  48.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5783  MOSC domain-containing protein  33.85 
 
 
215 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09307  conserved hypothetical protein  27.47 
 
 
257 aa  47  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.409587  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1811  MOSC  30.92 
 
 
158 aa  47  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.98215  normal  0.190966 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5316  MOSC domain containing protein  35.87 
 
 
232 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00687382  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4394  MOSC domain-containing protein  32.81 
 
 
213 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58850  hypothetical protein  32.8 
 
 
149 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.111042 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4172  MOSC domain-containing protein  34.26 
 
 
213 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4238  MOSC domain-containing protein  34.26 
 
 
213 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06890  hypothetical protein  32.14 
 
 
233 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59857  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11892  hypothetical protein  31.2 
 
 
251 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.358209 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3520  hypothetical protein  29.2 
 
 
229 aa  43.9  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.344482  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0963  MOSC domain-containing protein  23.64 
 
 
221 aa  43.5  0.0009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2362  MOSC domain-containing protein  30.49 
 
 
217 aa  43.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>