69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1607 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1607  MOSC  100 
 
 		 204 aa  410  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.401865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5597  hypothetical protein  68.18 
 
 		 179 aa  239  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.963565  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2483  hypothetical protein  68.16 
 
 		 179 aa  235  3e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0431097  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0061  MOSC domain-containing protein  63.64 
 
 		 201 aa  218  6e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.489415 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4234  MOSC domain-containing protein  62.43 
 
 		 180 aa  214  5.9999999999999996e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.37433  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2179  MOSC domain containing protein  57.22 
 
 		 184 aa  202  3e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4068  hypothetical protein  64.74 
 
 		 181 aa  199  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0258336  normal  0.178916 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2005  MOSC domain containing protein  53.76 
 
 		 180 aa  183  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.695737 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0785  MOSC domain containing protein  55.56 
 
 		 190 aa  172  3.9999999999999995e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3339  MOSC domain-containing protein  49.75 
 
 		 200 aa  170  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09307  conserved hypothetical protein  44.38 
 
 		 257 aa  132  3e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.409587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64470  hypothetical protein  68.42 
 
 		 98 aa  129  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2094  MOSC  33.14 
 
 		 152 aa  78.6  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1266  MOSC domain containing protein  30.77 
 
 		 154 aa  77  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.509209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0303  MOSC domain-containing protein  32.53 
 
 		 147 aa  75.1  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.968814  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2133  MOSC  31.69 
 
 		 145 aa  72  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1355  MOSC domain containing protein  31.9 
 
 		 143 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0782676  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2271  MOSC domain containing protein  33.33 
 
 		 143 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3145  MOSC domain-containing protein  33.74 
 
 		 144 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1967  hypothetical protein  31.29 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000022743  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2930  MOSC domain containing protein  32.52 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1952  MOSC domain containing protein  33.33 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0302  MOSC  32.12 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0913  MOSC domain containing protein  29.88 
 
 		 143 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1160  MOSC domain containing protein  29.14 
 
 		 262 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.242094  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0750  MOSC domain-containing protein  30.06 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2266  MOSC domain-containing protein  34.23 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2418  MOSC domain-containing protein  31.29 
 
 		 143 aa  64.7  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1438  MOSC domain containing protein  28.92 
 
 		 146 aa  63.9  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0426  MOSC domain containing protein  30.18 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0198409  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3570  MOSC domain-containing protein  36.21 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0259  MOSC domain containing protein  29.01 
 
 		 162 aa  61.2  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.215992 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1394  MOSC domain-containing protein  27.27 
 
 		 146 aa  60.8  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0387  MOSC domain containing protein  33.98 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1602  MOSC domain containing protein  26.38 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1402  MOSC domain containing protein  26.51 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0255  MOSC domain containing protein  44.44 
 
 		 178 aa  57  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1892  MOSC domain-containing protein  28.87 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00267695  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01830  hypothetical protein  30.91 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1399  MOSC domain-containing protein  25.15 
 
 		 152 aa  53.5  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.092789  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2403  MOSC domain-containing protein  30.63 
 
 		 149 aa  53.5  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0524087  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0414  MOSC domain-containing protein  32.74 
 
 		 144 aa  52.4  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.761963  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0491  MOSC domain containing protein  28.07 
 
 		 154 aa  52  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0514141  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2235  MOSC domain-containing protein  30.12 
 
 		 144 aa  51.6  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0830  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC/MOSC-domain-containing protein  23.26 
 
 		 308 aa  51.2  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0205  MOSC domain containing protein  34.38 
 
 		 147 aa  50.8  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0214556  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10950  hypothetical protein  28.22 
 
 		 180 aa  50.1  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00746491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1690  MOSC domain containing protein  24.55 
 
 		 143 aa  49.3  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0779  MOSC domain-containing protein  34.21 
 
 		 209 aa  48.1  0.00009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.161048  normal  0.0150919 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1340  MOSC domain containing protein  27.16 
 
 		 146 aa  48.1  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2367  MOSC domain containing protein  24.24 
 
 		 156 aa  46.2  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0036  MOSC  31.9 
 
 		 234 aa  45.8  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.50784 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2298  MOSC domain containing protein  30.77 
 
 		 142 aa  45.8  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1545  hypothetical protein  27.27 
 
 		 146 aa  45.4  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.695091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0997  MOSC domain containing protein  31.15 
 
 		 234 aa  45.4  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.265579  normal  0.156654 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3793  MOSC domain containing protein  31.97 
 
 		 159 aa  45.4  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00578414 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0371  MOSC domain-containing protein  24.32 
 
 		 144 aa  45.4  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0733  MOSC domain-containing protein  26.59 
 
 		 152 aa  45.1  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2906  MOSC domain containing protein  30.07 
 
 		 167 aa  44.7  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1481  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  26.67 
 
 		 310 aa  43.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.068215  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2044  MOSC domain-containing protein  26.05 
 
 		 142 aa  42.7  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0410  hypothetical protein  24.4 
 
 		 148 aa  42.4  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.966681  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1759  MOSC domain-containing protein  27.27 
 
 		 142 aa  42.4  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188575  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1157  hypothetical protein  28.69 
 
 		 241 aa  42  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0671  MOSC domain containing protein  26.05 
 
 		 144 aa  42  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1093  MOSC domain containing protein  28.33 
 
 		 234 aa  41.6  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.846076 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0191  MOSC domain-containing protein  30.17 
 
 		 242 aa  41.2  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2577  MOSC domain containing protein  26.8 
 
 		 220 aa  41.2  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0326  MOSC domain containing protein  22.13 
 
 		 149 aa  41.2  0.01  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>