37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2345 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2345  hypothetical protein  100 
 
 		 98 aa  206  6e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.938426  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1667  hypothetical protein  44.94 
 
 		 190 aa  90.1  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0837256 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2141  hypothetical protein  54.17 
 
 		 180 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000110374  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0746  hypothetical protein  54.17 
 
 		 172 aa  77.8  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.125519  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0500  hypothetical protein  46.58 
 
 		 197 aa  74.3  0.0000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.0000000100693  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0785  hypothetical protein  49.37 
 
 		 175 aa  74.3  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113287 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0591  hypothetical protein  54.1 
 
 		 172 aa  72.4  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.59111  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0023  hypothetical protein  51.67 
 
 		 173 aa  72  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2437  hypothetical protein  48.65 
 
 		 174 aa  70.9  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.254046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3640  hypothetical protein  35.56 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.00000000000227371  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4483  hypothetical protein  42.86 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.230203 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2641  hypothetical protein  39.71 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4476  hypothetical protein  37.1 
 
 		 247 aa  53.1  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3453  hypothetical protein  42.65 
 
 		 211 aa  51.6  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.948893  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2321  hypothetical protein  40.98 
 
 		 240 aa  51.2  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00685  hypothetical protein  40.3 
 
 		 207 aa  51.2  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0834282  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1513  conserved hypothetical protein-like protein  41.67 
 
 		 212 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0045  hypothetical protein  36.36 
 
 		 303 aa  49.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0108  hypothetical protein  36.51 
 
 		 193 aa  50.1  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  unclonable  1.3521599999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5582  hypothetical protein  38.46 
 
 		 215 aa  48.9  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0238097  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3925  hypothetical protein  36.07 
 
 		 227 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.750282 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2513  hypothetical protein  38.46 
 
 		 209 aa  47  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.376167  normal  0.0570101 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4158  signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 		 98 aa  45.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0887  hypothetical protein  40.28 
 
 		 232 aa  45.8  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0106843  hitchhiker  0.000000000926044 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10371  hypothetical protein  38.89 
 
 		 197 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.809389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5198  hypothetical protein  37.5 
 
 		 211 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0887  hypothetical protein  34.09 
 
 		 204 aa  45.1  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2900  hypothetical protein  41.86 
 
 		 204 aa  43.9  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2231  hypothetical protein  36.07 
 
 		 233 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.518522 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0715  hypothetical protein  37.68 
 
 		 223 aa  43.5  0.0009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3168  hypothetical protein  36.07 
 
 		 224 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.335635  normal  0.446109 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2854  hypothetical protein  32.43 
 
 		 298 aa  42  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.333627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1160  hypothetical protein  28.74 
 
 		 248 aa  41.2  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7291  hypothetical protein  33.33 
 
 		 209 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000516756  hitchhiker  0.000182855 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2786  hypothetical protein  33.33 
 
 		 187 aa  41.2  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.181648  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5914  hypothetical protein  33.85 
 
 		 196 aa  40.8  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.254692 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2178  hypothetical protein  33.33 
 
 		 180 aa  40.4  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.570864  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>