28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0853 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0853  Protein of unknown function DUF2266, transmembrane  100 
 
 		 158 aa  302  1.0000000000000001e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.205092  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1736  integral membrane protein  41.29 
 
 		 166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1363  hypothetical protein  45.22 
 
 		 172 aa  96.3  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00054435  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2170  Protein of unknown function DUF2266, transmembrane  47.86 
 
 		 154 aa  93.6  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.82451  hitchhiker  0.000424044 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9343  hypothetical protein  42.11 
 
 		 170 aa  89.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.354753  normal  0.737177 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8403  hypothetical protein  39.13 
 
 		 184 aa  79.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1128  Protein of unknown function DUF2266, transmembrane  41.14 
 
 		 186 aa  79  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.01431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2207  hypothetical protein  36.91 
 
 		 159 aa  76.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.260587 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3268  putative transmembrane protein  32.88 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.398918  normal  0.0684452 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5100  cytochrome c class I  33.11 
 
 		 284 aa  66.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.449412  normal  0.538396 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2422  putative integral membrane protein  35.51 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4405  hypothetical protein  35.43 
 
 		 162 aa  65.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.14034 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0135  conserved hypothetical conserved membrane protein  31.08 
 
 		 160 aa  60.8  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5269  hypothetical protein  30.61 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5073  hypothetical protein  30.56 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3158  hypothetical protein  32.47 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0132  conserved hypothetical conserved membrane protein  33.83 
 
 		 160 aa  57  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.599894 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6883  integral membrane protein  35.57 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.209631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1649  hypothetical protein  35 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.863009  normal  0.614735 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0901  Protein of unknown function DUF2266, transmembrane  34.84 
 
 		 158 aa  53.9  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1106  hypothetical protein  33.59 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0262236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1243  hypothetical protein  31.88 
 
 		 158 aa  52.4  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590744 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0510  hypothetical protein  29.17 
 
 		 171 aa  49.3  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1675  hypothetical protein  31.43 
 
 		 160 aa  48.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00317924  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1815  integral-membrane protein  33.09 
 
 		 157 aa  47.8  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.295351  decreased coverage  0.00207179 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6280  integral membrane protein  33.58 
 
 		 161 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.104283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1549  integral membrane protein  33.58 
 
 		 161 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.462747  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6772  integral membrane protein  32.84 
 
 		 161 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>