103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1355 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_1355  MOSC domain containing protein  100 
 
 
143 aa  289  8e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0782676  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2930  MOSC domain containing protein  97.2 
 
 
143 aa  282  1.0000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2418  MOSC domain-containing protein  72.03 
 
 
143 aa  219  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1952  MOSC domain containing protein  70.63 
 
 
143 aa  218  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2271  MOSC domain containing protein  69.93 
 
 
143 aa  217  3.9999999999999997e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0303  MOSC domain-containing protein  69.78 
 
 
147 aa  216  6e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.968814  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3145  MOSC domain-containing protein  67.86 
 
 
144 aa  212  9.999999999999999e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0302  MOSC  66.43 
 
 
146 aa  211  2.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0913  MOSC domain containing protein  68.84 
 
 
143 aa  211  2.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3570  MOSC domain-containing protein  70.15 
 
 
145 aa  207  5e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2094  MOSC  68.79 
 
 
152 aa  206  6e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1160  MOSC domain containing protein  66.91 
 
 
262 aa  201  3e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.242094  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1967  hypothetical protein  63.19 
 
 
153 aa  183  8e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000022743  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2133  MOSC  61.27 
 
 
145 aa  182  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1266  MOSC domain containing protein  58.87 
 
 
154 aa  180  7e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.509209  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1402  MOSC domain containing protein  60.28 
 
 
144 aa  179  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0414  MOSC domain-containing protein  57.86 
 
 
144 aa  176  7e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.761963  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2266  MOSC domain-containing protein  64.08 
 
 
145 aa  175  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1892  MOSC domain-containing protein  56.25 
 
 
147 aa  167  6e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00267695  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10950  hypothetical protein  52.45 
 
 
180 aa  165  2e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00746491  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0426  MOSC domain containing protein  55.32 
 
 
158 aa  163  9e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0198409  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01830  hypothetical protein  54.86 
 
 
177 aa  162  2.0000000000000002e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0255  MOSC domain containing protein  53.85 
 
 
178 aa  159  1e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0750  MOSC domain-containing protein  52.14 
 
 
144 aa  157  6e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1394  MOSC domain-containing protein  56.12 
 
 
146 aa  157  6e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0205  MOSC domain containing protein  50.35 
 
 
147 aa  155  2e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0214556  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1690  MOSC domain containing protein  50 
 
 
143 aa  153  7e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1438  MOSC domain containing protein  51.08 
 
 
146 aa  152  1e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0259  MOSC domain containing protein  51.45 
 
 
162 aa  149  1e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.215992 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2403  MOSC domain-containing protein  47.55 
 
 
149 aa  147  7e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0524087  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1545  hypothetical protein  55.97 
 
 
146 aa  144  3e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.695091  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1759  MOSC domain-containing protein  48.57 
 
 
142 aa  144  3e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188575  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2044  MOSC domain-containing protein  48.57 
 
 
142 aa  143  6e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2235  MOSC domain-containing protein  52.52 
 
 
144 aa  143  6e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0491  MOSC domain containing protein  48.23 
 
 
154 aa  143  8.000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0514141  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1481  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  43.26 
 
 
310 aa  142  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.068215  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1340  MOSC domain containing protein  53.68 
 
 
146 aa  140  7e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2367  MOSC domain containing protein  50.35 
 
 
156 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0671  MOSC domain containing protein  52.45 
 
 
144 aa  137  3.9999999999999997e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1602  MOSC domain containing protein  45.64 
 
 
154 aa  135  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2836  MOSC domain-containing protein  50 
 
 
165 aa  134  4e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.654473  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0733  MOSC domain-containing protein  51.77 
 
 
152 aa  130  5e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0410  hypothetical protein  48.59 
 
 
148 aa  128  3e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.966681  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2768  MOSC domain containing protein  46.81 
 
 
144 aa  128  3e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0830  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC/MOSC-domain-containing protein  47.59 
 
 
308 aa  128  3e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0326  MOSC domain containing protein  44.85 
 
 
149 aa  123  9e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1399  MOSC domain-containing protein  39.46 
 
 
152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.092789  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1858  MOSC domain-containing protein  38.19 
 
 
145 aa  99.4  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0371  MOSC domain-containing protein  38.36 
 
 
144 aa  99.4  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0061  MOSC domain-containing protein  34.34 
 
 
201 aa  89.7  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.489415 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0654  MOSC domain-containing protein  32.86 
 
 
139 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000905439  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5597  hypothetical protein  31.1 
 
 
179 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.963565  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2179  MOSC domain containing protein  31.1 
 
 
184 aa  71.6  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2483  hypothetical protein  34.78 
 
 
179 aa  71.2  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0431097  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1607  MOSC  31.9 
 
 
204 aa  70.5  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.401865  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3339  MOSC domain-containing protein  38.33 
 
 
200 aa  70.1  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0785  MOSC domain containing protein  38.66 
 
 
190 aa  69.7  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4234  MOSC domain-containing protein  31.74 
 
 
180 aa  66.2  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.37433  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0397  hypothetical protein  34.78 
 
 
145 aa  62.4  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4068  hypothetical protein  35.29 
 
 
181 aa  61.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0258336  normal  0.178916 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08310  hypothetical protein  34.43 
 
 
214 aa  58.2  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0821937  normal  0.516945 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3793  MOSC domain containing protein  29.8 
 
 
159 aa  55.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00578414 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0430  MOSC domain-containing protein  33.33 
 
 
151 aa  52.8  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.458415 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4394  MOSC domain-containing protein  31.21 
 
 
213 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1157  hypothetical protein  36.14 
 
 
241 aa  51.2  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0779  MOSC domain-containing protein  31.91 
 
 
209 aa  50.8  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.161048  normal  0.0150919 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09307  conserved hypothetical protein  29.07 
 
 
257 aa  50.4  0.000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.409587  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2005  MOSC domain containing protein  34.83 
 
 
180 aa  49.7  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.695737 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1893  MOSC domain-containing protein  32.99 
 
 
218 aa  50.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.552866  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2298  MOSC domain containing protein  27.86 
 
 
142 aa  50.1  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5926  hypothetical protein  33.91 
 
 
189 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0229267  normal  0.231206 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4075  MOSC domain containing protein  29.37 
 
 
205 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4172  MOSC domain-containing protein  30.57 
 
 
213 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4238  MOSC domain-containing protein  30.57 
 
 
213 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1047  MOSC domain-containing protein  30.52 
 
 
219 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11892  hypothetical protein  32.06 
 
 
251 aa  48.1  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.358209 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64470  hypothetical protein  36.47 
 
 
98 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9197  hypothetical protein  32.17 
 
 
223 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.91426 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0997  MOSC domain containing protein  30.95 
 
 
234 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.265579  normal  0.156654 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0846  MOSC domain-containing protein  28.07 
 
 
214 aa  45.4  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.201546  normal  0.0737228 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4395  MOSC domain containing protein  28.91 
 
 
209 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.772534  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1093  MOSC domain containing protein  29.76 
 
 
234 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.846076 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1147  MOSC domain-containing protein  32.28 
 
 
208 aa  45.1  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3658  MOSC domain containing protein  30.77 
 
 
217 aa  43.9  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.192632 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0387  MOSC domain containing protein  23.84 
 
 
153 aa  43.9  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2674  MOSC domain-containing protein  30.39 
 
 
148 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.216386  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2719  MOSC domain-containing protein  30.39 
 
 
148 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.005456  normal  0.132425 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2705  MOSC domain-containing protein  31.73 
 
 
148 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.705945  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5783  MOSC domain-containing protein  30.53 
 
 
215 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4111  putative sulferase  28.57 
 
 
174 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.641133  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3877  MOSC  30.21 
 
 
224 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.913671  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2352  MOSC domain containing protein  35.11 
 
 
216 aa  42.7  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3720  MOSC domain containing protein  28.57 
 
 
241 aa  43.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.050466 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1774  MOSC domain-containing protein  27.08 
 
 
209 aa  43.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000110547  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4831  hypothetical protein  28.23 
 
 
189 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.000000085919  hitchhiker  0.00670464 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7731  hypothetical protein  30.65 
 
 
211 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4456  MOSC domain-containing protein  28 
 
 
250 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.267556  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0155  hypothetical protein  33.33 
 
 
205 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2061  hypothetical protein  24.65 
 
 
148 aa  41.2  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000026195  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00774  mosc  23.97 
 
 
151 aa  40.8  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00950006  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>