More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1319 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1319  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  100 
 
 		 305 aa  618  1e-176  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.225363  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2964  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  96.07 
 
 		 305 aa  598  1e-170  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00460178 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1696  MoxR family protein  65.79 
 
 		 313 aa  402  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1632  MoxR family protein  66.12 
 
 		 313 aa  403  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000221226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2054  MoxR-like ATPases  63.04 
 
 		 312 aa  398  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0418936  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2426  ATPase  61.51 
 
 		 314 aa  397  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.624284  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2044  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  62.46 
 
 		 314 aa  386  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3277  ATPase  57.34 
 
 		 310 aa  361  9e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1523  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.62 
 
 		 305 aa  339  4e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0345  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.53 
 
 		 310 aa  292  4e-78  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.898086  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1288  ATPase  47.12 
 
 		 323 aa  285  7e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1592  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.8 
 
 		 325 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.488895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0210  ATPase  48.14 
 
 		 347 aa  282  4.0000000000000003e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.283743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.44 
 
 		 319 aa  282  5.000000000000001e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0692  ATPase  49.83 
 
 		 323 aa  281  9e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0164  ATPase  49.83 
 
 		 319 aa  279  3e-74  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2275  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50 
 
 		 322 aa  279  5e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1359  ATPase  47.67 
 
 		 310 aa  278  6e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.020418  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0958  MoxR-like ATPase  44.92 
 
 		 457 aa  277  1e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1760  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.11 
 
 		 333 aa  277  1e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00353191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1332  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.78 
 
 		 323 aa  277  1e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000274445 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0460  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.02 
 
 		 343 aa  277  1e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0415  ATPase  49.02 
 
 		 302 aa  276  3e-73  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19020  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.55 
 
 		 313 aa  275  5e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3171  magnesium chelatase, ChlI subunit; methanol dehydrogenase regulator  47.12 
 
 		 309 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0622  ATPase  46.05 
 
 		 327 aa  273  3e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02436  methanol dehydrogenase regulator  47.59 
 
 		 308 aa  272  4.0000000000000004e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.808259  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05630  MoxR-like ATPase  48.14 
 
 		 331 aa  272  6e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.609898  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1176  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.49 
 
 		 327 aa  272  6e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.997573  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3034  ATPase, AAA family  46.74 
 
 		 310 aa  272  7e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3009  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.62 
 
 		 331 aa  271  9e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.116146  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0704  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.17 
 
 		 314 aa  271  1e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3626  putative ATPase  51.7 
 
 		 308 aa  271  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0941  ATPase  45.64 
 
 		 308 aa  271  1e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3073  AAA family ATPase  46.05 
 
 		 310 aa  270  2e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.209671  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2773  magnesium chelatase; methanol dehydrogenase regulator  46.39 
 
 		 310 aa  270  2e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0680478  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0280  ATPase  46.58 
 
 		 312 aa  270  2e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.760866  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1709  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.52 
 
 		 321 aa  269  4e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0802  ATPase  46.38 
 
 		 317 aa  269  5e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2824  AAA family ATPase  46.39 
 
 		 310 aa  269  5e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0314282  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3038  AAA family ATPase  46.39 
 
 		 310 aa  269  5e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.392336  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2942  MoxR-like ATPase  45.76 
 
 		 309 aa  268  8.999999999999999e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000701608  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5532  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.48 
 
 		 319 aa  268  8.999999999999999e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3068  ATPase, AAA family  45.7 
 
 		 310 aa  268  8.999999999999999e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0718148  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0473  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.87 
 
 		 320 aa  268  1e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.482238  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1196  ATPase  48.04 
 
 		 302 aa  268  1e-70  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.160899  normal  0.292882 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3936  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.84 
 
 		 337 aa  267  1e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.528453  normal  0.396618 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0864  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.79 
 
 		 317 aa  266  2e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1871  hypothetical protein  45.89 
 
 		 304 aa  266  2e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0438  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  42.95 
 
 		 316 aa  267  2e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2759  magnesium chelatase; methanol dehydrogenase regulator  45.7 
 
 		 309 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1862  hypothetical protein  45.89 
 
 		 304 aa  266  2.9999999999999995e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1679  ATPase  47.24 
 
 		 305 aa  266  4e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3184  ATPase  49.35 
 
 		 318 aa  266  4e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2778  hypothetical protein  45.16 
 
 		 350 aa  266  5e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1613  ATPase  47.24 
 
 		 305 aa  265  5.999999999999999e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.635167  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2912  ATPase  46.23 
 
 		 331 aa  265  8e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0275816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0813  ATPase  47.69 
 
 		 310 aa  264  1e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0320  ATPase  45.02 
 
 		 310 aa  264  2e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2069  succinyl-CoA ligase, alpha subunit  46.62 
 
 		 306 aa  263  2e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.534339  normal  0.58415 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2126  ATPase  45.64 
 
 		 303 aa  263  2e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3925  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.15 
 
 		 336 aa  263  2e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.233193  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2870  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.28 
 
 		 324 aa  263  2e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.648175  normal  0.0812651 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2386  ATPase  50.94 
 
 		 306 aa  263  3e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0494  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.44 
 
 		 313 aa  263  3e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0240  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.93 
 
 		 303 aa  263  3e-69  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.288695  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1116  ATPase  49.08 
 
 		 317 aa  263  3e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3146  ATPase  46.37 
 
 		 306 aa  263  4e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.109548 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1054  ATPase  42.12 
 
 		 318 aa  263  4e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0187  ATPase  44.26 
 
 		 313 aa  262  4.999999999999999e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2529  AAA_3 ATPase  48.79 
 
 		 306 aa  262  6e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2538  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.56 
 
 		 314 aa  262  6.999999999999999e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0819  ATPase  50.38 
 
 		 315 aa  261  8e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1210  methanol dehydrogenase regulatory protein  49.08 
 
 		 317 aa  261  8.999999999999999e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21600  MoxR-like ATPase  44.41 
 
 		 322 aa  261  1e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.264241  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1883  ATPase  45.67 
 
 		 306 aa  261  1e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.666763 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26910  hypothetical protein  48.68 
 
 		 305 aa  261  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1331  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.42 
 
 		 324 aa  261  1e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.280532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3487  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.64 
 
 		 324 aa  260  2e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1693  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.65 
 
 		 321 aa  260  2e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.506532  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0928  ATPase  44.52 
 
 		 314 aa  260  2e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3810  ATPase  42.72 
 
 		 318 aa  260  2e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1953  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  44.67 
 
 		 320 aa  259  3e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4605  ATPase  45.15 
 
 		 323 aa  259  3e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1778  ATPase  46.29 
 
 		 303 aa  259  3e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3552  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.16 
 
 		 403 aa  259  3e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1119  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.92 
 
 		 318 aa  259  3e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0032  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.23 
 
 		 318 aa  259  4e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.062228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1856  ATPase  45.94 
 
 		 303 aa  259  4e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.195599  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3413  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.3 
 
 		 324 aa  259  4e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.265752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5567  ATPase  48.45 
 
 		 305 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0627555  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2279  hypothetical protein  48.36 
 
 		 305 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2242  ATPase  45.58 
 
 		 313 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.839891  normal  0.451068 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2450  ATPase  49.48 
 
 		 305 aa  258  6e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.620681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2936  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.78 
 
 		 341 aa  259  6e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000363093  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2530  ATPase  43.01 
 
 		 303 aa  258  6e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2560  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  42.96 
 
 		 315 aa  258  6e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.050472  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0476  ATPase  46.2 
 
 		 317 aa  258  8e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0659  ATPase  44.11 
 
 		 341 aa  258  9e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.936381 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6584  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.51 
 
 		 325 aa  258  1e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.597099 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>