More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6028 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6028  adenylate kinase  100 
 
 
217 aa  438  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.16698 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0603  adenylate kinase  92.63 
 
 
217 aa  412  1e-114  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0583  adenylate kinase  70.97 
 
 
217 aa  323  8.000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1107  adenylate kinase  70.7 
 
 
216 aa  316  2e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.211555 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1207  adenylate kinase  70.23 
 
 
217 aa  313  9e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00730136 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4294  adenylate kinase  70.23 
 
 
217 aa  313  9.999999999999999e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487166 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3902  adenylate kinase  69.3 
 
 
217 aa  310  1e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0327  adenylate kinase  68.98 
 
 
217 aa  305  3e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000417947 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4300  adenylate kinase  70.83 
 
 
217 aa  303  1.0000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5145  adenylate kinase  63.43 
 
 
219 aa  281  6.000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.498584 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0952  adenylate kinase  60.91 
 
 
225 aa  263  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.519364  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3307  adenylate kinase  55.87 
 
 
214 aa  252  2.0000000000000002e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0954  adenylate kinase  55.4 
 
 
214 aa  251  6e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.338741  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0722  adenylate kinase  54.72 
 
 
216 aa  248  6e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.940289  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1725  adenylate kinase  52.36 
 
 
215 aa  241  7e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000477664  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0086  adenylate kinase  50.93 
 
 
215 aa  240  1e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00306231  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1087  adenylate kinase  52.11 
 
 
217 aa  240  1e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.171059  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1163  adenylate kinase  56.13 
 
 
211 aa  239  2e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0529729  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2924  adenylate kinase  50.94 
 
 
217 aa  239  2.9999999999999997e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0025  adenylate kinase  51.16 
 
 
215 aa  238  5e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000610793  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2297  adenylate kinase  50.47 
 
 
215 aa  237  9e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2256  adenylate kinase  50.47 
 
 
215 aa  237  9e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0268599  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1810  adenylate kinase  50 
 
 
215 aa  236  1e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0132  adenylate kinase  55.39 
 
 
216 aa  236  1e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00113447  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4486  adenylate kinase  58.33 
 
 
204 aa  237  1e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1237  adenylate kinase  51.4 
 
 
214 aa  237  1e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000920741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0779  adenylate kinase  50.94 
 
 
214 aa  234  5.0000000000000005e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000192318  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2625  adenylate kinase  57.94 
 
 
189 aa  234  7e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.155499  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1504  adenylate kinases  48.84 
 
 
215 aa  234  9e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0443  adenylate kinase  51.15 
 
 
217 aa  232  2.0000000000000002e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3646  adenylate kinase  54.04 
 
 
217 aa  231  8.000000000000001e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000547337  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01370  Adenylate kinase  50.24 
 
 
216 aa  230  1e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000615524  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1338  adenylate kinase  50.23 
 
 
213 aa  229  3e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.389991  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1718  adenylate kinase  49.3 
 
 
213 aa  228  4e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1576  adenylate kinases  51.69 
 
 
213 aa  228  5e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00457177  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0887  adenylate kinase  51.89 
 
 
217 aa  228  6e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.037956  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0128  adenylate kinase  53.92 
 
 
217 aa  225  3e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0701  adenylate kinase  51.96 
 
 
220 aa  224  6e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0297411  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0647  adenylate kinase  52.68 
 
 
222 aa  224  8e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00892777  hitchhiker  0.00000105788 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2690  adenylate kinase  51.63 
 
 
216 aa  224  8e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0131862  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2836  adenylate kinase  50.49 
 
 
217 aa  223  1e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0125  adenylate kinase  51.47 
 
 
216 aa  223  1e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000166818  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0152  adenylate kinase  50.98 
 
 
216 aa  223  2e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00506864  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0215  Adenylate kinase  51.17 
 
 
214 aa  223  2e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0126  adenylate kinase  50.98 
 
 
216 aa  222  3e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000253561  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0131  adenylate kinase  50.49 
 
 
216 aa  222  4e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000890423  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0162  adenylate kinase  50.49 
 
 
216 aa  222  4e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000036841  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5174  adenylate kinase  50.49 
 
 
216 aa  221  6e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000620291  unclonable  1.1738e-25 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1367  adenylate kinase  51.42 
 
 
214 aa  221  8e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00134255  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1111  adenylate kinase  49.53 
 
 
214 aa  220  1.9999999999999999e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000158184  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0131  adenylate kinase  50 
 
 
216 aa  219  3e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000156427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0127  adenylate kinase  50 
 
 
216 aa  219  3e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000429626  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0125  adenylate kinase  50 
 
 
216 aa  219  3e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0141617  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0144  adenylate kinase  50 
 
 
216 aa  219  3e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.24496e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0131  adenylate kinase  50 
 
 
216 aa  219  3e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000118062  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2693  adenylate kinase  49.51 
 
 
216 aa  218  5e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2378  adenylate kinase  49.51 
 
 
216 aa  218  5e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2713  Adenylate kinase  52.94 
 
 
423 aa  218  7e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.690631  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1164  nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  45.83 
 
 
226 aa  217  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000123796  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2439  adenylate kinase  52.94 
 
 
217 aa  217  1e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1462  adenylate kinase  51.69 
 
 
219 aa  216  2e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000718997  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4005  nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  45.83 
 
 
226 aa  216  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000000986709  hitchhiker  0.0000175975 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2312  adenylate kinase  51.01 
 
 
215 aa  216  2e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00140159  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2380  adenylate kinase  49.04 
 
 
215 aa  214  8e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000961521  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2308  adenylate kinase  50 
 
 
218 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00367216  normal  0.15407 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1353  adenylate kinase  50.97 
 
 
216 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.362467  normal  0.404671 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1551  adenylate kinase  50 
 
 
218 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.399055  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1117  adenylate kinase  47.64 
 
 
218 aa  212  2.9999999999999995e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.018146  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1319  adenylate kinase  50.92 
 
 
215 aa  211  5.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.176093  hitchhiker  0.00352848 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2558  adenylate kinase  50 
 
 
217 aa  211  5.999999999999999e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00195471 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2561  adenylate kinase  50.45 
 
 
218 aa  211  5.999999999999999e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.072453  decreased coverage  0.00219618 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1753  adenylate kinase  51.02 
 
 
213 aa  211  7e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000121762  normal  0.119807 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1140  adenylate kinase  50.49 
 
 
208 aa  211  7.999999999999999e-54  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000592914  normal  0.025222 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1361  adenylate kinase  50.97 
 
 
224 aa  210  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0354  adenylate kinase  49.09 
 
 
222 aa  210  1e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1070  adenylate kinase  47.49 
 
 
216 aa  209  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.283029  normal  0.107455 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1112  adenylate kinase  48.73 
 
 
209 aa  209  3e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1509  adenylate kinase  50.46 
 
 
215 aa  209  3e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3359  adenylate kinase  49.54 
 
 
215 aa  208  4e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.848875  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2952  adenylate kinase  48.64 
 
 
218 aa  209  4e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3205  adenylate kinase  48.87 
 
 
217 aa  208  5e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.129481  normal  0.282312 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1451  adenylate kinase  50.72 
 
 
216 aa  208  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176418  normal  0.213105 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1925  adenylate kinase  49.77 
 
 
224 aa  207  7e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1920  adenylate kinase  46.85 
 
 
218 aa  207  8e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3158  adenylate kinase  49.09 
 
 
218 aa  207  9e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.350521  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2847  adenylate kinase  51.27 
 
 
217 aa  207  1e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.821791  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1936  adenylate kinase  48.66 
 
 
220 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0745182  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1886  adenylate kinase  48.17 
 
 
218 aa  207  1e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00135603  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4895  adenylate kinase  50.91 
 
 
218 aa  206  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.351979 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2548  adenylate kinase  48.66 
 
 
220 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2572  adenylate kinase  48.66 
 
 
220 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.601307 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3003  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  46.95 
 
 
222 aa  206  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.192004  hitchhiker  0.00720085 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2638  adenylate kinase  49.55 
 
 
218 aa  206  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.517304  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0270  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  44.88 
 
 
211 aa  206  2e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0167  adenylate kinases  46.48 
 
 
228 aa  206  2e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0999685  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1001  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  44.76 
 
 
215 aa  206  2e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000583079  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1430  adenylate kinase  53.37 
 
 
214 aa  206  3e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000051006  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3199  adenylate kinase  48 
 
 
221 aa  206  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166103  normal  0.776204 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0748  adenylate kinase  48.21 
 
 
220 aa  205  3e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.552209  normal  0.468478 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2466  adenylate kinase  49.55 
 
 
220 aa  205  4e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041386 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>