42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2809 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2809  hypothetical protein  100 
 
 		 249 aa  479  1e-134  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0618  regulatory protein, ArsR  65.82 
 
 		 210 aa  258  5.0000000000000005e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0746  transcriptional regulator, ArsR family  66.67 
 
 		 210 aa  253  3e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4536  ArsR family transcriptional regulator  72.45 
 
 		 224 aa  251  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.482904  normal  0.619073 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0212  regulatory protein ArsR  65.96 
 
 		 201 aa  231  9e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0328  putative transcriptional regulator  63.4 
 
 		 201 aa  231  1e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0496107 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1111  putative transcriptional regulator  66.49 
 
 		 223 aa  226  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0673626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0395  hypothetical protein  60 
 
 		 197 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0404  hypothetical protein  60 
 
 		 197 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.748136 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0383  hypothetical protein  60 
 
 		 197 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.181158 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2299  regulatory protein, ArsR  56.84 
 
 		 196 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.718193  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2853  putative transcriptional regulator  59.79 
 
 		 193 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.76719  decreased coverage  0.00327558 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1399  hypothetical protein  56.06 
 
 		 192 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.104773  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0607  hypothetical protein  42.63 
 
 		 205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4095  putative transcriptional regulator  38.3 
 
 		 196 aa  113  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.475604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4628  hypothetical protein  42.19 
 
 		 200 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0160155 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0996  hypothetical protein  41.5 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2552  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 185 aa  75.5  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0674571  normal  0.191331 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7611  ArsR family transcriptional regulator  30 
 
 		 185 aa  62  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0045  transcriptional regulator, ArsR family  30.23 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0109  ArsR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2973  putative transcriptional regulator  28.74 
 
 		 207 aa  54.3  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0226444  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4756  transcriptional regulator, ArsR family  27.17 
 
 		 150 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00171627  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3245  transcriptional regulator, ArsR family  28.74 
 
 		 208 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2946  ArsR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 207 aa  52  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.958799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3009  ArsR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 207 aa  52  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3024  ArsR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 207 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3255  transcriptional regulator, ArsR family  28.95 
 
 		 207 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3257  ArsR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 207 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3269  ArsR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 207 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.574198  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0361  hypothetical protein  31.11 
 
 		 182 aa  47.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.584384 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1862  putative transcriptional regulator, ArsR family  29.35 
 
 		 213 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0267319 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1838  transcriptional regulator, ArsR family  24.14 
 
 		 472 aa  44.3  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.240001  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4545  ArsR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 187 aa  43.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal  0.191523 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4542  regulatory protein ArsR  52.83 
 
 		 111 aa  43.1  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.436444 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11840  transcriptional regulator, ArsR family  47.17 
 
 		 119 aa  43.1  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7118  transcriptional regulator, ArsR family  34.21 
 
 		 180 aa  42.7  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2681  transcriptional regulator, ArsR family  40.68 
 
 		 214 aa  42.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18080  predicted transcriptional regulator  45.45 
 
 		 211 aa  42  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.493664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3902  regulatory protein, ArsR  52.83 
 
 		 109 aa  42  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.894762 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3558  ArsR family transcriptional regulator  51.11 
 
 		 97 aa  42  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681826  normal  0.406985 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4310  transcriptional regulator, TrmB  49.06 
 
 		 118 aa  42  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0416057  normal  0.35783 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>