27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2764 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2764  hypothetical protein  100 
 
 
175 aa  347  3e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.720369  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0491  hypothetical protein  57.99 
 
 
184 aa  195  3e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.46585  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2763  hypothetical protein  59.66 
 
 
174 aa  193  9e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.861823  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5089  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.88 
 
 
178 aa  105  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00127684  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1003  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.71 
 
 
176 aa  101  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1428  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.73 
 
 
197 aa  101  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.770563  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4057  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.3 
 
 
193 aa  99  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000796256  hitchhiker  0.000000255237 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4088  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.62 
 
 
179 aa  95.9  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3099  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.53 
 
 
169 aa  86.7  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422914  normal  0.197974 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2016  hypothetical protein  32.52 
 
 
175 aa  81.3  0.000000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4648  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.17 
 
 
193 aa  65.9  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.030471  normal  0.671776 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1586  hypothetical protein  26.95 
 
 
174 aa  63.9  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.345573  normal  0.0169562 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0731  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.54 
 
 
174 aa  62  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0572  hypothetical protein  25.29 
 
 
188 aa  59.7  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.316463 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0590  hypothetical protein  26.06 
 
 
188 aa  59.3  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.583994  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1961  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.47 
 
 
174 aa  57  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00643734  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0635  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.31 
 
 
182 aa  55.1  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0605  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.81 
 
 
174 aa  51.6  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.946686  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0634  hypothetical protein  23.76 
 
 
177 aa  47.8  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0589  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.59 
 
 
177 aa  47  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.768385  normal  0.646896 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0571  hypothetical protein  29.59 
 
 
177 aa  46.6  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.487342 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1587  hypothetical protein  30.49 
 
 
177 aa  45.4  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0166263 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0604  hypothetical protein  29.27 
 
 
177 aa  45.1  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0730  hypothetical protein  27.71 
 
 
177 aa  43.5  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0551  hypothetical protein  24.22 
 
 
179 aa  42.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1962  hypothetical protein  28.05 
 
 
177 aa  42.4  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0548542  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1506  biopolymer transport protein  46.51 
 
 
136 aa  42  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000178844  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>