13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2490 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_2490  hypothetical protein  100 
 
 		 219 aa  455  1e-127  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000626304  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4120  hypothetical protein  56.62 
 
 		 207 aa  237  1e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3726  hypothetical protein  40.18 
 
 		 208 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3136  hypothetical protein  41.15 
 
 		 206 aa  160  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3669  hypothetical protein  27 
 
 		 215 aa  62  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0775009  normal  0.157085 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0379  hypothetical protein  26.97 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0418  hypothetical protein  25.11 
 
 		 215 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0005  hypothetical protein  27.84 
 
 		 229 aa  51.6  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0741  hypothetical protein  28.14 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1461  hypothetical protein  27.47 
 
 		 216 aa  49.3  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.57906  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1848  hypothetical protein  27.33 
 
 		 150 aa  48.5  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5114  hypothetical protein  27.08 
 
 		 214 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3356  hypothetical protein  29.2 
 
 		 209 aa  46.6  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.192638  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>