12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5114 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5114  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  447  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0418  hypothetical protein  82.63 
 
 		 215 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3669  hypothetical protein  51.89 
 
 		 215 aa  222  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0775009  normal  0.157085 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0379  hypothetical protein  41.33 
 
 		 221 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3726  hypothetical protein  28.18 
 
 		 208 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4120  hypothetical protein  30.22 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0741  hypothetical protein  24.77 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3356  hypothetical protein  29.33 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.192638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2490  hypothetical protein  27.08 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000626304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0005  hypothetical protein  28.24 
 
 		 229 aa  47  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0200  hypothetical protein  25.97 
 
 		 213 aa  45.1  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.162545 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0031  hypothetical protein  30.84 
 
 		 240 aa  42  0.008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>